More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3954 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  54.27 
 
 		 1383 aa  1255    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  49 
 
 		 1152 aa  650    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0148  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  52.51 
 
 		 1048 aa  668    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  54.26 
 
 		 1711 aa  728    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.98 
 
 		 1431 aa  686    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  50.4 
 
 		 1299 aa  661    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.56 
 
 		 1559 aa  652    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4411  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  46.67 
 
 		 1514 aa  665    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0203527 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.71 
 
 		 1426 aa  645    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  49.86 
 
 		 1202 aa  662    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.67 
 
 		 1003 aa  653    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  44.92 
 
 		 1427 aa  644    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.29 
 
 		 1140 aa  670    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  56.76 
 
 		 1390 aa  1380    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  56.52 
 
 		 1248 aa  1261    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55.43 
 
 		 1361 aa  1363    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4349  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  46.54 
 
 		 1514 aa  664    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.82 
 
 		 1383 aa  640    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  56.76 
 
 		 1390 aa  1380    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55.75 
 
 		 1385 aa  1367    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.97 
 
 		 1002 aa  683    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 1370 aa  2665    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.64 
 
 		 1415 aa  665    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  56.76 
 
 		 1390 aa  1382    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.2 
 
 		 1406 aa  635  1e-180  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  48.14 
 
 		 1651 aa  631  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.29 
 
 		 1010 aa  628  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.412805  hitchhiker  0.00597184 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.95 
 
 		 1287 aa  623  1e-177  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.01 
 
 		 1646 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.79 
 
 		 1631 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.84 
 
 		 1131 aa  602  1e-170  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.24 
 
 		 1153 aa  568  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359014  hitchhiker  0.0000017622 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2687  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.1 
 
 		 1013 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4814  histidine kinase  46.76 
 
 		 919 aa  546  1e-154  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00150972  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  46.28 
 
 		 1051 aa  543  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 		 1118 aa  521  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000390432  normal  0.0407868 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  50.6 
 
 		 828 aa  445  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  47.04 
 
 		 851 aa  422  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4608  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.58 
 
 		 1645 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.284957  normal  0.407853 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02350  protein-histidine kinase, putative  31.4 
 
 		 1614 aa  359  1.9999999999999998e-97  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.16806  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02240  protein-histidine kinase, putative  32.2 
 
 		 1816 aa  331  5.0000000000000004e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  35.9 
 
 		 1180 aa  298  7e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  36.45 
 
 		 1156 aa  296  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  33.62 
 
 		 1172 aa  276  2.0000000000000002e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  39.08 
 
 		 1366 aa  275  5.000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.61 
 
 		 975 aa  265  4e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  37.8 
 
 		 1311 aa  260  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1604  two component transcriptional regulator, AraC family  38.98 
 
 		 904 aa  259  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  32.35 
 
 		 1374 aa  251  6e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 		 978 aa  250  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149383  normal  0.186346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  35.81 
 
 		 1418 aa  246  3e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  34.05 
 
 		 1373 aa  245  3.9999999999999997e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  38.17 
 
 		 876 aa  244  9e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  32.21 
 
 		 934 aa  244  1e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  31.88 
 
 		 1384 aa  241  6.999999999999999e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2406  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.75 
 
 		 1301 aa  239  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  33.49 
 
 		 1378 aa  237  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  35 
 
 		 1378 aa  235  4.0000000000000004e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2252  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.22 
 
 		 732 aa  235  5e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  34.59 
 
 		 1355 aa  233  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1750  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.5 
 
 		 660 aa  233  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  34.4 
 
 		 1343 aa  233  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  34.86 
 
 		 1366 aa  233  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1754  histidine kinase  34.64 
 
 		 1344 aa  232  4e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.63 
 
 		 1036 aa  229  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.705021 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2079  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.66 
 
 		 727 aa  229  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.79077 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  33.41 
 
 		 1355 aa  228  6e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  35.46 
 
 		 1349 aa  228  7e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  33.97 
 
 		 1306 aa  227  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  32.43 
 
 		 1374 aa  226  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3651  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.53 
 
 		 727 aa  226  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.125923 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2074  sensor histidine kinase  33.49 
 
 		 816 aa  226  3e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2084  sensor histidine kinase  32.77 
 
 		 816 aa  222  3.9999999999999997e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  28.91 
 
 		 1340 aa  222  3.9999999999999997e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2976  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.36 
 
 		 889 aa  221  6e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.29382  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  29.67 
 
 		 1400 aa  220  1e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  31.62 
 
 		 1370 aa  220  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  28.5 
 
 		 1373 aa  218  5e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  31.65 
 
 		 1344 aa  218  7e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2885  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.98 
 
 		 818 aa  217  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0237924  normal  0.0700462 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6047  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 677 aa  217  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2256  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.93 
 
 		 727 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.903593 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.73 
 
 		 703 aa  216  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  30.23 
 
 		 1347 aa  215  3.9999999999999995e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0338  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 568 aa  215  3.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127973  decreased coverage  0.00024777 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3199  two component transcriptional regulator, AraC family  31.54 
 
 		 940 aa  211  9e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157032  normal  0.236848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  30.97 
 
 		 1397 aa  210  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  31.7 
 
 		 1335 aa  210  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 		 979 aa  209  3e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.366427 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0756  sensory box sensor histidine kinase/DNA-binding response regulator  32.41 
 
 		 993 aa  209  4e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3061  ATP-binding region ATPase domain protein  34.04 
 
 		 863 aa  207  9e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141845  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.64 
 
 		 823 aa  204  8e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2723  histidine kinase  30.79 
 
 		 1347 aa  202  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  28.84 
 
 		 1363 aa  202  3e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 1341 aa  202  5e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.81 
 
 		 1002 aa  201  6e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4604  histidine kinase  33.89 
 
 		 663 aa  199  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  28.73 
 
 		 1133 aa  197  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2318  histidine kinase  30.25 
 
 		 1298 aa  197  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2746  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.65 
 
 		 1096 aa  196  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.455726  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>