More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4775 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.92 
 
 		 1711 aa  689    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 1383 aa  2744    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  65.01 
 
 		 1248 aa  1549    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  54.27 
 
 		 1370 aa  1296    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  43.37 
 
 		 1202 aa  659    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.44 
 
 		 1426 aa  644    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4411  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  41.08 
 
 		 1514 aa  658    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0203527 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  46.71 
 
 		 1427 aa  645    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.65 
 
 		 1390 aa  1208    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4349  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.97 
 
 		 1514 aa  657    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.67 
 
 		 1415 aa  649    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.65 
 
 		 1390 aa  1208    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.53 
 
 		 1385 aa  1190    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  47.54 
 
 		 1299 aa  636    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.73 
 
 		 1390 aa  1208    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.47 
 
 		 1361 aa  1149    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  45.96 
 
 		 1152 aa  627  1e-178  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.27 
 
 		 1431 aa  625  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.46 
 
 		 1002 aa  624  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.08 
 
 		 1383 aa  624  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.6 
 
 		 1559 aa  617  1e-175  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.32 
 
 		 1140 aa  617  1e-175  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.6 
 
 		 1406 aa  615  9.999999999999999e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  45.91 
 
 		 1651 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0148  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.08 
 
 		 1048 aa  608  9.999999999999999e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.67 
 
 		 1631 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.39 
 
 		 1003 aa  602  1e-170  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.95 
 
 		 1646 aa  602  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.33 
 
 		 1010 aa  596  1e-169  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.412805  hitchhiker  0.00597184 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.68 
 
 		 1287 aa  596  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.17 
 
 		 1131 aa  589  1e-166  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.15 
 
 		 1153 aa  560  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359014  hitchhiker  0.0000017622 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.72 
 
 		 1118 aa  541  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000390432  normal  0.0407868 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.83 
 
 		 1051 aa  527  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2687  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 		 1013 aa  522  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4814  histidine kinase  43.31 
 
 		 919 aa  501  1e-140  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00150972  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4608  multi-sensor signal transduction histidine kinase  54.67 
 
 		 1645 aa  439  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.284957  normal  0.407853 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  49.16 
 
 		 828 aa  405  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  44.25 
 
 		 851 aa  384  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02350  protein-histidine kinase, putative  31.26 
 
 		 1614 aa  366  2e-99  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.16806  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02240  protein-histidine kinase, putative  33.12 
 
 		 1816 aa  319  3e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  35.79 
 
 		 1156 aa  301  8e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  35.04 
 
 		 1180 aa  296  3e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  32.11 
 
 		 1172 aa  269  2.9999999999999995e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  35.8 
 
 		 1384 aa  265  3e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  33.2 
 
 		 1374 aa  265  6.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.77 
 
 		 975 aa  264  1e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  36.57 
 
 		 1366 aa  258  6e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  35.39 
 
 		 934 aa  253  1e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  36.73 
 
 		 1311 aa  254  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  34.04 
 
 		 1373 aa  249  2e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  35.44 
 
 		 1418 aa  248  4.9999999999999997e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  37.25 
 
 		 876 aa  245  5e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  34.09 
 
 		 1355 aa  244  7e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  32.85 
 
 		 1370 aa  243  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1604  two component transcriptional regulator, AraC family  37.12 
 
 		 904 aa  242  2.9999999999999997e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  35.79 
 
 		 1343 aa  239  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  34.43 
 
 		 1378 aa  239  3e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1750  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.2 
 
 		 660 aa  238  5.0000000000000005e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  32.3 
 
 		 1400 aa  236  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  35.22 
 
 		 1378 aa  233  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6047  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 		 677 aa  234  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  33.33 
 
 		 1397 aa  233  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1754  histidine kinase  35.51 
 
 		 1344 aa  231  7e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2406  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.96 
 
 		 1301 aa  231  7e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3199  two component transcriptional regulator, AraC family  34.2 
 
 		 940 aa  231  8e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157032  normal  0.236848 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  34.14 
 
 		 1373 aa  231  8e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  34.78 
 
 		 1366 aa  231  9e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  32.33 
 
 		 1347 aa  231  1e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.68 
 
 		 978 aa  229  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149383  normal  0.186346 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  33.25 
 
 		 1340 aa  229  3e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  34.19 
 
 		 1306 aa  227  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  34.03 
 
 		 1355 aa  226  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  33.79 
 
 		 1374 aa  224  7e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  32.3 
 
 		 1344 aa  224  9e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0338  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 		 568 aa  219  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127973  decreased coverage  0.00024777 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 1341 aa  219  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4604  histidine kinase  36.63 
 
 		 663 aa  218  5e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  33.56 
 
 		 1335 aa  214  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2074  sensor histidine kinase  30.91 
 
 		 816 aa  213  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.51 
 
 		 1002 aa  213  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2723  histidine kinase  32.19 
 
 		 1347 aa  211  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.86 
 
 		 1036 aa  210  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.705021 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3651  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.25 
 
 		 727 aa  209  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.125923 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.94 
 
 		 977 aa  209  2e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.58 
 
 		 823 aa  210  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2318  histidine kinase  32.57 
 
 		 1298 aa  210  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  37.29 
 
 		 1388 aa  208  6e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  32.47 
 
 		 1526 aa  208  6e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2206  histidine kinase  32.28 
 
 		 556 aa  207  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3061  ATP-binding region ATPase domain protein  34.27 
 
 		 863 aa  207  1e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141845  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  30.47 
 
 		 1363 aa  207  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2079  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.25 
 
 		 727 aa  206  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.79077 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2084  sensor histidine kinase  30.87 
 
 		 816 aa  203  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  32.71 
 
 		 1349 aa  202  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.52 
 
 		 703 aa  202  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  31.76 
 
 		 1133 aa  202  3.9999999999999996e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1470  histidine kinase  29.32 
 
 		 1376 aa  202  3.9999999999999996e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0500626  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  32.68 
 
 		 1313 aa  202  5e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2256  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.09 
 
 		 727 aa  201  6e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.903593 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>