More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4776 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.48 
 
 
1711 aa  679    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.74 
 
 
1415 aa  650    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  56.52 
 
 
1370 aa  1238    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  46.81 
 
 
1152 aa  648    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.65 
 
 
1431 aa  646    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  46.6 
 
 
1299 aa  647    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
1248 aa  2475    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  65.01 
 
 
1383 aa  1494    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4411  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  42.65 
 
 
1514 aa  637    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0203527 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  45.49 
 
 
1427 aa  654    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.46 
 
 
1390 aa  1143    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4349  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  42.77 
 
 
1514 aa  638    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.46 
 
 
1390 aa  1143    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.63 
 
 
1385 aa  1127    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.54 
 
 
1390 aa  1144    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.36 
 
 
1361 aa  1080    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.34 
 
 
1002 aa  630  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.7 
 
 
1426 aa  632  1e-179  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.69 
 
 
1406 aa  627  1e-178  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0148  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  48.08 
 
 
1048 aa  619  1e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  45.67 
 
 
1202 aa  608  9.999999999999999e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.4 
 
 
1383 aa  605  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.2 
 
 
1559 aa  601  1e-170  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.7 
 
 
1003 aa  600  1e-170  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  46.36 
 
 
1651 aa  601  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.31 
 
 
1140 aa  600  1e-170  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.21 
 
 
1631 aa  602  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.72 
 
 
1646 aa  593  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.28 
 
 
1131 aa  579  1.0000000000000001e-163  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.95 
 
 
1010 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.412805  hitchhiker  0.00597184 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.2 
 
 
1287 aa  563  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2687  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.47 
 
 
1013 aa  522  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70216  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.35 
 
 
1118 aa  510  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000390432  normal  0.0407868 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 
1153 aa  512  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359014  hitchhiker  0.0000017622 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4814  histidine kinase  43.48 
 
 
919 aa  505  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00150972  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.6 
 
 
1051 aa  484  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4608  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.6 
 
 
1645 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.284957  normal  0.407853 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02350  protein-histidine kinase, putative  30.92 
 
 
1614 aa  337  1e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.16806  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02240  protein-histidine kinase, putative  34.06 
 
 
1816 aa  315  2.9999999999999996e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  49.29 
 
 
828 aa  310  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  46.38 
 
 
851 aa  304  8.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  36.01 
 
 
1156 aa  285  5.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  34.59 
 
 
1180 aa  281  4e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  34.03 
 
 
1172 aa  264  8.999999999999999e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  36.78 
 
 
1366 aa  255  4.0000000000000004e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.03 
 
 
975 aa  241  5.999999999999999e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1604  two component transcriptional regulator, AraC family  37.56 
 
 
904 aa  240  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  31.44 
 
 
1374 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  31.13 
 
 
934 aa  232  3e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  35.42 
 
 
1311 aa  231  5e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  34.23 
 
 
1343 aa  230  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  31.46 
 
 
1384 aa  229  3e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 
978 aa  225  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149383  normal  0.186346 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  31.35 
 
 
1370 aa  224  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  33.64 
 
 
1378 aa  222  3e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  33.57 
 
 
1378 aa  221  5e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  35.67 
 
 
876 aa  221  5e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  31.19 
 
 
1418 aa  218  5.9999999999999996e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1754  histidine kinase  33.48 
 
 
1344 aa  216  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176495  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  31.53 
 
 
1373 aa  212  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1750  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.19 
 
 
660 aa  212  4e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  31 
 
 
1373 aa  211  7e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  31.59 
 
 
1306 aa  209  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  32.08 
 
 
1366 aa  208  6e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2406  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.35 
 
 
1301 aa  207  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  32.34 
 
 
1355 aa  206  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2074  sensor histidine kinase  31.91 
 
 
816 aa  204  6e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  30.89 
 
 
1347 aa  204  6e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  32.07 
 
 
1374 aa  204  7e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6047  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  33.11 
 
 
677 aa  204  9e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  27.22 
 
 
1340 aa  203  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3199  two component transcriptional regulator, AraC family  32.88 
 
 
940 aa  202  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157032  normal  0.236848 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2084  sensor histidine kinase  31.84 
 
 
816 aa  200  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.67 
 
 
1036 aa  200  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.705021 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  28.15 
 
 
1344 aa  200  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  27.97 
 
 
1400 aa  198  5.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3061  ATP-binding region ATPase domain protein  32.88 
 
 
863 aa  197  1e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141845  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2206  histidine kinase  34.17 
 
 
556 aa  196  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  30.17 
 
 
1355 aa  195  4e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0338  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 
568 aa  195  4e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127973  decreased coverage  0.00024777 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  29.8 
 
 
1397 aa  194  6e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 
979 aa  195  6e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.366427 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.89 
 
 
858 aa  194  7e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.48 
 
 
823 aa  194  7e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.07 
 
 
1002 aa  192  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4604  histidine kinase  33.73 
 
 
663 aa  192  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002587  chitin catabolic cascade sensor histidine kinase ChiS  31.59 
 
 
1111 aa  190  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  32.01 
 
 
970 aa  190  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  28.6 
 
 
1133 aa  189  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.65 
 
 
977 aa  186  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  29.55 
 
 
1335 aa  186  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4734  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33 
 
 
798 aa  184  9.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660973 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  26.7 
 
 
1363 aa  184  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  29.81 
 
 
1341 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  29.65 
 
 
1207 aa  182  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2976  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.19 
 
 
889 aa  182  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.29382  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1905  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  32.71 
 
 
668 aa  181  5.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0295515  normal  0.210974 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  29.05 
 
 
1334 aa  181  5.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2159  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.92 
 
 
796 aa  181  7e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.758044 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2771  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.9 
 
 
1557 aa  181  7e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>