More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7544 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  100 
 
 
1051 aa  2080    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.91 
 
 
1383 aa  605  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4411  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  42.05 
 
 
1514 aa  588  1e-166  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0203527 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.15 
 
 
1002 aa  587  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4349  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  41.79 
 
 
1514 aa  585  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  44.3 
 
 
1202 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.96 
 
 
1711 aa  581  1e-164  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0148  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.97 
 
 
1048 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.92 
 
 
1415 aa  565  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.61 
 
 
1131 aa  564  1.0000000000000001e-159  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  42.73 
 
 
1427 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.28 
 
 
1390 aa  560  1e-158  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.28 
 
 
1390 aa  560  1e-158  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.78 
 
 
1385 aa  560  1e-158  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.35 
 
 
1390 aa  560  1e-158  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.05 
 
 
1426 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.35 
 
 
1431 aa  550  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.46 
 
 
1361 aa  552  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.28 
 
 
1370 aa  552  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.71 
 
 
1559 aa  548  1e-154  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.47 
 
 
1003 aa  548  1e-154  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.9 
 
 
1140 aa  547  1e-154  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  41.25 
 
 
1299 aa  542  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.73 
 
 
1153 aa  538  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359014  hitchhiker  0.0000017622 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.79 
 
 
1406 aa  532  1e-149  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  43.57 
 
 
1152 aa  527  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.32 
 
 
1631 aa  528  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  42.71 
 
 
1651 aa  528  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2687  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.59 
 
 
1013 aa  528  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70216  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.84 
 
 
1287 aa  527  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 
1010 aa  525  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.412805  hitchhiker  0.00597184 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.24 
 
 
1646 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.83 
 
 
1383 aa  512  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.91 
 
 
1118 aa  502  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000390432  normal  0.0407868 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4814  histidine kinase  42.26 
 
 
919 aa  497  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00150972  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.6 
 
 
1248 aa  498  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4608  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49 
 
 
1645 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.284957  normal  0.407853 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02240  protein-histidine kinase, putative  35.34 
 
 
1816 aa  284  7.000000000000001e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  38.05 
 
 
1156 aa  272  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  35.79 
 
 
1172 aa  259  3e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  32.13 
 
 
1384 aa  254  6e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  36.02 
 
 
1180 aa  254  7e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1754  histidine kinase  35.94 
 
 
1344 aa  249  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176495  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.79 
 
 
975 aa  249  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  36.64 
 
 
1311 aa  248  4e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  34.87 
 
 
1343 aa  246  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  32.68 
 
 
934 aa  244  9e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02350  protein-histidine kinase, putative  34.82 
 
 
1614 aa  243  1e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.16806  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  35.7 
 
 
1366 aa  241  5e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  34.19 
 
 
1344 aa  241  8e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  34.68 
 
 
1341 aa  240  8e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1604  two component transcriptional regulator, AraC family  35.68 
 
 
904 aa  240  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  34.72 
 
 
1378 aa  234  7.000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  33.76 
 
 
1418 aa  234  8.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  32.36 
 
 
1373 aa  233  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2318  histidine kinase  35.49 
 
 
1298 aa  230  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  33.92 
 
 
1366 aa  228  5.0000000000000005e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  30.04 
 
 
1374 aa  226  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  31.46 
 
 
1373 aa  225  3e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  32.69 
 
 
1397 aa  224  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6047  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  32.14 
 
 
677 aa  223  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4604  histidine kinase  33.92 
 
 
663 aa  221  7e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  34.47 
 
 
1306 aa  220  8.999999999999998e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  32.6 
 
 
1347 aa  219  2e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2406  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.49 
 
 
1301 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2074  sensor histidine kinase  32.71 
 
 
816 aa  218  5e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  28.93 
 
 
1340 aa  218  7e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  30.19 
 
 
1400 aa  217  9e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  35.5 
 
 
876 aa  217  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  32.38 
 
 
1335 aa  216  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3039  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.48 
 
 
1067 aa  216  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.635771  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  32.29 
 
 
1370 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  33.49 
 
 
1355 aa  213  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1750  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.07 
 
 
660 aa  213  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  32.67 
 
 
1378 aa  212  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  32.31 
 
 
1355 aa  212  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2723  histidine kinase  32.24 
 
 
1347 aa  211  4e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  31.21 
 
 
1349 aa  211  9e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3199  two component transcriptional regulator, AraC family  34.54 
 
 
940 aa  210  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157032  normal  0.236848 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 
978 aa  209  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149383  normal  0.186346 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2084  sensor histidine kinase  31.93 
 
 
816 aa  208  5e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3061  ATP-binding region ATPase domain protein  30.13 
 
 
863 aa  208  5e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141845  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  31 
 
 
1374 aa  208  5e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.7 
 
 
823 aa  207  6e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  32.95 
 
 
1278 aa  206  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_002950  PG1797  DNA-binding response regulator/sensor histidine kinase  29.83 
 
 
961 aa  199  2.0000000000000003e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
870 aa  198  5.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2251  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.96 
 
 
721 aa  197  6e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0770498  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.01 
 
 
975 aa  197  7e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.41 
 
 
1002 aa  197  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  30.6 
 
 
1133 aa  195  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4574  histidine kinase  34.93 
 
 
900 aa  195  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  32.42 
 
 
1207 aa  195  4e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  32.61 
 
 
1324 aa  194  8e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2976  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.48 
 
 
889 aa  194  8e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.29382  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2746  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.33 
 
 
1096 aa  194  9e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.455726  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  34.94 
 
 
1388 aa  194  9e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0756  sensory box sensor histidine kinase/DNA-binding response regulator  30.09 
 
 
993 aa  193  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  30.84 
 
 
1119 aa  193  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.83 
 
 
803 aa  193  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>