More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0350 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.12 
 
 
1002 aa  671    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4411  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  47.38 
 
 
1514 aa  667    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0203527 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  56.59 
 
 
1370 aa  1378    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.58 
 
 
1383 aa  1169    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  48.61 
 
 
1152 aa  644    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  99.64 
 
 
1390 aa  2760    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  66.76 
 
 
1361 aa  1730    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.03 
 
 
1431 aa  710    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.5 
 
 
1631 aa  643    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.21 
 
 
1415 aa  706    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.49 
 
 
1010 aa  637    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.412805  hitchhiker  0.00597184 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  44.08 
 
 
1202 aa  667    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.42 
 
 
1248 aa  1157    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.83 
 
 
1426 aa  706    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  47.84 
 
 
1651 aa  648    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  45.7 
 
 
1427 aa  703    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.38 
 
 
1131 aa  646    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.55 
 
 
1140 aa  739    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
1390 aa  2771    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0148  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  50.13 
 
 
1048 aa  667    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.57 
 
 
1711 aa  860    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4349  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  47.38 
 
 
1514 aa  666    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  50 
 
 
1299 aa  692    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
1390 aa  2771    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.68 
 
 
1383 aa  640    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  68.21 
 
 
1385 aa  1812    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.27 
 
 
1406 aa  693    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.51 
 
 
1559 aa  627  1e-178  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.4 
 
 
1003 aa  626  1e-178  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.81 
 
 
1646 aa  623  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  65.39 
 
 
828 aa  613  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  63.78 
 
 
851 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.02 
 
 
1287 aa  599  1e-169  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.41 
 
 
1118 aa  585  1.0000000000000001e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000390432  normal  0.0407868 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.49 
 
 
1153 aa  575  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359014  hitchhiker  0.0000017622 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2687  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.1 
 
 
1013 aa  569  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70216  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  45.28 
 
 
1051 aa  547  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4814  histidine kinase  45.52 
 
 
919 aa  546  1e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00150972  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4608  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55.38 
 
 
1645 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.284957  normal  0.407853 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02350  protein-histidine kinase, putative  33.29 
 
 
1614 aa  387  1e-106  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.16806  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02240  protein-histidine kinase, putative  36.46 
 
 
1816 aa  350  1e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  38.8 
 
 
1156 aa  295  5e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  37.72 
 
 
1180 aa  294  8e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.68 
 
 
1036 aa  288  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.705021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  38.66 
 
 
1366 aa  280  1e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  34.72 
 
 
1172 aa  279  3e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1604  two component transcriptional regulator, AraC family  37.53 
 
 
904 aa  273  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2976  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.88 
 
 
889 aa  270  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.29382  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  37.83 
 
 
1311 aa  266  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  33.65 
 
 
1384 aa  262  3e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  32.48 
 
 
1374 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  38.59 
 
 
876 aa  253  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1754  histidine kinase  36.3 
 
 
1344 aa  251  9e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176495  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  35.5 
 
 
1378 aa  250  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  35.45 
 
 
1343 aa  250  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  34.57 
 
 
1373 aa  246  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  34.03 
 
 
1370 aa  246  3e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  35.42 
 
 
1306 aa  243  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2885  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.39 
 
 
818 aa  243  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0237924  normal  0.0700462 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  35.13 
 
 
934 aa  242  2.9999999999999997e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2406  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.6 
 
 
1301 aa  241  5e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  31.86 
 
 
1340 aa  239  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.12 
 
 
975 aa  240  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  34.08 
 
 
1355 aa  238  6e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  32.15 
 
 
1373 aa  237  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 
978 aa  235  5e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149383  normal  0.186346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  34.49 
 
 
1378 aa  233  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  31.93 
 
 
1355 aa  232  5e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  32.4 
 
 
1347 aa  231  6e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  33.49 
 
 
1397 aa  230  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  33.25 
 
 
1341 aa  231  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  34.2 
 
 
1366 aa  229  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  32.51 
 
 
1418 aa  228  9e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  32.3 
 
 
1400 aa  227  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  31.26 
 
 
1344 aa  225  4e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6047  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  33.71 
 
 
677 aa  225  4.9999999999999996e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  32.21 
 
 
1334 aa  225  4.9999999999999996e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2074  sensor histidine kinase  34.05 
 
 
816 aa  224  6e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  32.45 
 
 
1374 aa  224  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  36.26 
 
 
1349 aa  221  7e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  31.49 
 
 
1335 aa  218  7e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2084  sensor histidine kinase  33.57 
 
 
816 aa  216  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  33.18 
 
 
1526 aa  216  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  29.53 
 
 
1133 aa  216  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2723  histidine kinase  33.97 
 
 
1347 aa  214  7e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4604  histidine kinase  33.18 
 
 
663 aa  214  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.07 
 
 
1002 aa  213  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3199  two component transcriptional regulator, AraC family  33.5 
 
 
940 aa  213  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157032  normal  0.236848 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  30.95 
 
 
1207 aa  213  3e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2318  histidine kinase  33.02 
 
 
1298 aa  212  4e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0756  sensory box sensor histidine kinase/DNA-binding response regulator  33.57 
 
 
993 aa  211  6e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1905  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  34.84 
 
 
668 aa  211  9e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0295515  normal  0.210974 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  25.09 
 
 
1130 aa  207  9e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3061  ATP-binding region ATPase domain protein  33.49 
 
 
863 aa  206  3e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141845  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.51 
 
 
823 aa  204  8e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  32.7 
 
 
1324 aa  204  9e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  29.65 
 
 
1363 aa  201  6e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  32.46 
 
 
1278 aa  198  6e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 
979 aa  197  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.366427 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0559  histidine kinase  31.3 
 
 
1327 aa  197  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00477073  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>