More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4521 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  74.24 
 
 
828 aa  1135    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  100 
 
 
851 aa  1680    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  63.52 
 
 
1390 aa  595  1e-168  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  63.52 
 
 
1390 aa  595  1e-168  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  63.73 
 
 
1390 aa  595  1e-168  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  60.6 
 
 
1361 aa  585  1e-166  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  60.68 
 
 
1385 aa  569  1e-161  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.93 
 
 
1370 aa  421  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.25 
 
 
1383 aa  363  6e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.38 
 
 
1248 aa  305  3.0000000000000004e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1413  GAF sensor signal transduction histidine kinase  45.71 
 
 
568 aa  286  9e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.87 
 
 
1711 aa  194  8e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34940  fused histidine kinase with GAF domain/SpoIIE-like protein  35.07 
 
 
537 aa  191  7e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24735  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2005  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.53 
 
 
595 aa  178  5e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0401989  hitchhiker  0.00207123 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3606  protein serine/threonine phosphatase  43.89 
 
 
395 aa  176  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3736  putative PAS/PAC sensor protein  37.84 
 
 
1017 aa  174  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3046  GAF:ATP-binding region, ATPase-like  33.72 
 
 
572 aa  162  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12064  histidine kinase response regulator  34.78 
 
 
573 aa  159  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2114  anti-sigma-factor antagonist  38.79 
 
 
618 aa  158  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.39314  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1241  putative PAS/PAC sensor protein  37.18 
 
 
1432 aa  157  8e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402812 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1969  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 
568 aa  157  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.197678  normal  0.851655 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1654  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
567 aa  155  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7089  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  39.08 
 
 
697 aa  153  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288523  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3501  putative PAS/PAC sensor protein  33.75 
 
 
1225 aa  152  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.480314  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  37.96 
 
 
693 aa  152  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2140  PAS/protein phosphatase 2C-like  37.82 
 
 
688 aa  151  6e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731032  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13153  two component system sensor histidine kinase devS  33.54 
 
 
578 aa  150  9e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1578  ATPase domain-containing protein  35 
 
 
573 aa  147  7.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0501  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 
571 aa  146  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31980  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  34.68 
 
 
453 aa  145  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585203  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2087  putative PAS/PAC sensor protein  33.42 
 
 
666 aa  145  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000976195  normal  0.0252685 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11395  hypothetical protein  34.48 
 
 
653 aa  145  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2399  putative PAS/PAC sensor protein  37.77 
 
 
700 aa  144  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.249407  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4356  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
568 aa  144  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.641048  normal  0.232825 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06030  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  40.16 
 
 
567 aa  144  7e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.486099  normal  0.150997 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3523  Histidine kinase  33.14 
 
 
591 aa  144  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0630905  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4125  putative signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
568 aa  144  8e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4200  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
568 aa  144  8e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112122  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3855  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.74 
 
 
560 aa  144  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.574477  normal  0.471316 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3764  putative PAS/PAC sensor protein  35.37 
 
 
643 aa  140  8.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124369  normal  0.415801 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2597  putative PAS/PAC sensor protein  35.37 
 
 
594 aa  140  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4619  putative PAS/PAC sensor protein  40.57 
 
 
409 aa  140  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1077  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 
566 aa  139  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1093  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 
566 aa  139  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1104  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 
566 aa  139  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3313  putative PAS/PAC sensor protein  35.77 
 
 
692 aa  138  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  34 
 
 
573 aa  137  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  38.59 
 
 
1039 aa  135  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1882  putative PAS/PAC sensor protein  35.44 
 
 
721 aa  135  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.755669 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1895  putative PAS/PAC sensor protein  35.23 
 
 
574 aa  134  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.757129 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0086  putative PAS/PAC sensor protein  38.55 
 
 
685 aa  134  7.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.65346  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1588  putative PAS/PAC sensor protein  33.57 
 
 
607 aa  134  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.127314 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1529  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 
573 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.916601  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2814  putative PAS/PAC sensor protein  36.89 
 
 
709 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0793374  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4838  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.1 
 
 
566 aa  133  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  31.23 
 
 
817 aa  132  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0098  putative PAS/PAC sensor protein  37.13 
 
 
865 aa  132  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0698116  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0227  putative PAS/PAC sensor protein  37.18 
 
 
607 aa  132  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.456595  hitchhiker  0.00174766 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3844  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 
575 aa  132  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00743108  normal  0.0464921 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2019  protein serine/threonine phosphatase  34.62 
 
 
308 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5311  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.96 
 
 
952 aa  131  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  32.68 
 
 
697 aa  131  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.38 
 
 
1051 aa  130  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1151  serine phosphatase  37.18 
 
 
713 aa  130  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4019  putative PAS/PAC sensor protein  34.72 
 
 
614 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.33 
 
 
549 aa  130  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0347  putative PAS/PAC sensor protein  34.44 
 
 
723 aa  130  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4478  putative PAS/PAC sensor protein  36.01 
 
 
652 aa  129  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0359873 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3278  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.37 
 
 
775 aa  129  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771244  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2009  putative PAS/PAC sensor protein  33.92 
 
 
932 aa  129  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.240269  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0106  PAS protein phosphatase 2C-like  33.33 
 
 
670 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1395  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 
559 aa  128  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735957  normal  0.354354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3071  protein serine/threonine phosphatase  44.71 
 
 
260 aa  127  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.136695 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0524  putative PAS/PAC sensor protein  30.06 
 
 
744 aa  127  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3356  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  34.57 
 
 
692 aa  126  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223934  normal  0.0312208 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4485  putative PAS/PAC sensor protein  34.67 
 
 
547 aa  125  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110526  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.16 
 
 
616 aa  126  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3812  putative PAS/PAC sensor protein  43.64 
 
 
757 aa  125  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.719446  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13090  Stage II sporulation protein E (SpoIIE)  33.6 
 
 
576 aa  125  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0433  putative PAS/PAC sensor protein  35.57 
 
 
627 aa  125  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.546697  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1571  putative PAS/PAC sensor protein  35.5 
 
 
562 aa  125  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1552  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  32.22 
 
 
618 aa  124  7e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  32.23 
 
 
713 aa  124  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5033  putative PAS/PAC sensor protein  36.03 
 
 
760 aa  124  9e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6792  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  43.04 
 
 
585 aa  124  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1560  putative signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 
588 aa  124  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.298915  normal  0.578819 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1989  putative PAS/PAC sensor protein  30.36 
 
 
722 aa  123  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965966  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3673  putative PAS/PAC sensor protein  45.81 
 
 
738 aa  123  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.483009  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4166  putative PAS/PAC sensor protein  30.77 
 
 
765 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299427  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0250  PAS containing protein phosphatase 2C-like  31.55 
 
 
753 aa  122  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337993  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13140  bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)  38.72 
 
 
772 aa  122  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0838  putative PAS/PAC sensor protein  36.48 
 
 
754 aa  122  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0191  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 
544 aa  122  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.303575  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5315  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.33 
 
 
750 aa  122  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.315721 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0617  putative PAS/PAC sensor protein  36.1 
 
 
580 aa  121  7e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.33 
 
 
738 aa  120  7.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.13 
 
 
1045 aa  120  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4200  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  31.55 
 
 
702 aa  120  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00190608  normal  0.0466919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  34.94 
 
 
855 aa  120  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4347  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  40.28 
 
 
576 aa  119  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0230944  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>