More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6047 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6047  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 677 aa  1376    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1905  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  56.28 
 
 		 668 aa  697    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0295515  normal  0.210974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4604  histidine kinase  51.24 
 
 		 663 aa  667    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  46.68 
 
 		 1311 aa  459  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  41.28 
 
 		 1343 aa  396  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2318  histidine kinase  40.04 
 
 		 1298 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1754  histidine kinase  39.42 
 
 		 1344 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  37.32 
 
 		 1378 aa  340  4e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  34.79 
 
 		 1366 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  35.37 
 
 		 1366 aa  336  7.999999999999999e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  35.88 
 
 		 1370 aa  332  1e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  33.98 
 
 		 1306 aa  325  2e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  34.35 
 
 		 1400 aa  321  1.9999999999999998e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  34.94 
 
 		 1373 aa  314  3.9999999999999997e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  33.94 
 
 		 1374 aa  313  4.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  33.04 
 
 		 934 aa  312  2e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  33.27 
 
 		 1340 aa  311  4e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  34.73 
 
 		 1335 aa  310  8e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  33.81 
 
 		 1384 aa  307  4.0000000000000004e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  32.85 
 
 		 1374 aa  306  9.000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  34.87 
 
 		 1378 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  32.26 
 
 		 1347 aa  304  3.0000000000000004e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  35.61 
 
 		 1355 aa  303  6.000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3199  two component transcriptional regulator, AraC family  35.24 
 
 		 940 aa  302  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157032  normal  0.236848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  36.36 
 
 		 1388 aa  302  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  34.04 
 
 		 1355 aa  289  1e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  33.63 
 
 		 1418 aa  282  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  31.58 
 
 		 1373 aa  278  3e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  33.82 
 
 		 1278 aa  276  8e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1604  two component transcriptional regulator, AraC family  33.88 
 
 		 904 aa  273  6e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  33.39 
 
 		 1341 aa  271  2e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  31.51 
 
 		 1397 aa  271  4e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  32.57 
 
 		 1363 aa  270  8.999999999999999e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  32.02 
 
 		 1349 aa  269  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  32.25 
 
 		 1344 aa  267  5e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  33.81 
 
 		 1324 aa  261  3e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 		 1131 aa  260  5.0000000000000005e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0756  sensory box sensor histidine kinase/DNA-binding response regulator  31.85 
 
 		 993 aa  257  4e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0559  histidine kinase  31.2 
 
 		 1327 aa  252  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00477073  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1797  DNA-binding response regulator/sensor histidine kinase  30.45 
 
 		 961 aa  251  4e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  32.62 
 
 		 1404 aa  249  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2019  histidine kinase  31.66 
 
 		 1316 aa  244  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523526  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  31.15 
 
 		 1342 aa  241  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2723  histidine kinase  29.82 
 
 		 1347 aa  239  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.26 
 
 		 1426 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0615  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 		 395 aa  237  6e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858549 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 1383 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.6 
 
 		 1431 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2687  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 1013 aa  234  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 1153 aa  232  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359014  hitchhiker  0.0000017622 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  31.6 
 
 		 1313 aa  232  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.4 
 
 		 1287 aa  231  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.63 
 
 		 1651 aa  230  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  31.24 
 
 		 1152 aa  229  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  30.07 
 
 		 1334 aa  228  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  31.36 
 
 		 1427 aa  228  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1699  ATP-binding region, ATPase-like protein  30.03 
 
 		 1396 aa  227  6e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170141  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0148  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 1048 aa  227  7e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 1711 aa  226  9e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.71 
 
 		 1390 aa  226  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.71 
 
 		 1390 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.71 
 
 		 1390 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 		 1385 aa  225  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 1383 aa  224  4e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 1361 aa  224  4e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1002 aa  223  7e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  34.22 
 
 		 876 aa  223  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  32.82 
 
 		 1202 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 		 1010 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.412805  hitchhiker  0.00597184 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.27 
 
 		 1559 aa  222  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.1 
 
 		 1415 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 1118 aa  220  7e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000390432  normal  0.0407868 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.26 
 
 		 1646 aa  219  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.03 
 
 		 1631 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  29.13 
 
 		 1374 aa  219  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  34.14 
 
 		 1156 aa  218  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 		 1140 aa  217  5.9999999999999996e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  33.03 
 
 		 1299 aa  217  5.9999999999999996e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4814  histidine kinase  31.91 
 
 		 919 aa  216  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00150972  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4411  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.34 
 
 		 1514 aa  213  7e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0203527 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1562  histidine kinase  29.47 
 
 		 1296 aa  212  2e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.655639  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4349  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.34 
 
 		 1514 aa  212  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.14 
 
 		 1051 aa  212  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4608  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 		 1645 aa  210  7e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.284957  normal  0.407853 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  33.19 
 
 		 1180 aa  209  1e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1470  histidine kinase  29.03 
 
 		 1376 aa  209  1e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0500626  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31 
 
 		 1406 aa  209  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 		 1370 aa  207  6e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2406  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.85 
 
 		 1301 aa  206  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 978 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149383  normal  0.186346 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.78 
 
 		 975 aa  205  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.11 
 
 		 1248 aa  204  4e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2074  sensor histidine kinase  30.53 
 
 		 816 aa  203  9e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2084  sensor histidine kinase  30.09 
 
 		 816 aa  203  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5118  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.83 
 
 		 837 aa  201  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  32.74 
 
 		 1172 aa  199  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 		 979 aa  192  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.366427 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.52 
 
 		 1691 aa  189  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  27.05 
 
 		 1414 aa  187  6e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 		 823 aa  187  8e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>