More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0550 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  29.85 
 
 		 1334 aa  649    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  32.59 
 
 		 1340 aa  692    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  31.49 
 
 		 1400 aa  746    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  31.87 
 
 		 1324 aa  661    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  33.65 
 
 		 1374 aa  752    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  38.22 
 
 		 1374 aa  974    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  32.71 
 
 		 1306 aa  707    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  30.98 
 
 		 1363 aa  687    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  30.17 
 
 		 1373 aa  645    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  35.35 
 
 		 1370 aa  845    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  31.78 
 
 		 1366 aa  647    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  100 
 
 		 1388 aa  2873    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  35.87 
 
 		 1355 aa  879    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  30.74 
 
 		 1384 aa  693    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  32.09 
 
 		 1378 aa  712    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  30.73 
 
 		 1418 aa  637    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  31.46 
 
 		 1373 aa  679    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  29.93 
 
 		 1397 aa  635  1e-180  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  31.63 
 
 		 1278 aa  621  1e-176  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  30.22 
 
 		 1378 aa  620  1e-176  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  31.65 
 
 		 1404 aa  621  1e-176  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0559  histidine kinase  29.99 
 
 		 1327 aa  612  1e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00477073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2019  histidine kinase  29.56 
 
 		 1316 aa  605  1.0000000000000001e-171  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523526  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  29.42 
 
 		 1347 aa  592  1e-167  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  29.58 
 
 		 1335 aa  592  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  31.13 
 
 		 1355 aa  568  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  29.84 
 
 		 1344 aa  568  1e-160  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  28.24 
 
 		 1342 aa  566  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  29.21 
 
 		 1313 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  29.93 
 
 		 1349 aa  547  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  31.1 
 
 		 1343 aa  538  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  28.47 
 
 		 1526 aa  514  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1699  ATP-binding region, ATPase-like protein  28.29 
 
 		 1396 aa  485  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2723  histidine kinase  26.49 
 
 		 1347 aa  482  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  26.94 
 
 		 1374 aa  478  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0921  histidine kinase  30.43 
 
 		 1105 aa  475  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  27.39 
 
 		 1407 aa  474  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2318  histidine kinase  29.45 
 
 		 1298 aa  474  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  27.19 
 
 		 1414 aa  469  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 1258 aa  467  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_105  histidine kinase CheY-like domain protein  30.12 
 
 		 1070 aa  459  1e-127  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  27.68 
 
 		 1311 aa  456  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1470  histidine kinase  27.61 
 
 		 1376 aa  454  1.0000000000000001e-126  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0500626  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0275  histidine kinase  29.74 
 
 		 1070 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1754  histidine kinase  33.41 
 
 		 1344 aa  424  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176495  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2607  GGDEF domain-containing protein  31.79 
 
 		 1054 aa  422  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202674  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  27.75 
 
 		 1093 aa  421  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1493  sensor histidine kinase/response regulator  27.29 
 
 		 1086 aa  413  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0890895  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  35.27 
 
 		 1366 aa  392  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1335  histidine kinase  26.96 
 
 		 1278 aa  388  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820531 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1331  sensor histidine kinase/response regulator  26.11 
 
 		 1118 aa  368  1e-100  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3543  Hpt sensor hybrid histidine kinase  26.98 
 
 		 1498 aa  365  2e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.476146  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0448  histidine kinase  28.45 
 
 		 1114 aa  345  2.9999999999999997e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  26.55 
 
 		 1351 aa  340  9.999999999999999e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1604  two component transcriptional regulator, AraC family  37.45 
 
 		 904 aa  338  5.999999999999999e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  29.85 
 
 		 1024 aa  337  7.999999999999999e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0755  GGDEF domain-containing protein  28.7 
 
 		 1053 aa  336  2e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1562  histidine kinase  25.15 
 
 		 1296 aa  335  4e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.655639  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3199  two component transcriptional regulator, AraC family  35.15 
 
 		 940 aa  331  6e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157032  normal  0.236848 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  26.46 
 
 		 1346 aa  321  5e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6047  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 677 aa  320  9e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4604  histidine kinase  38.19 
 
 		 663 aa  318  3e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  32.26 
 
 		 934 aa  317  8e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.03 
 
 		 1079 aa  306  2.0000000000000002e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4600  two component regulator propeller domain protein  28.6 
 
 		 1194 aa  298  6e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.779291 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_84  histidine kinase  23.75 
 
 		 1084 aa  294  1e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4681  GGDEF domain-containing protein  26.96 
 
 		 1034 aa  292  4e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3042  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.61 
 
 		 1181 aa  276  1.0000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.227036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1905  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 		 668 aa  271  5e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0295515  normal  0.210974 
 
 
-
 
NC_002950  PG1797  DNA-binding response regulator/sensor histidine kinase  33.77 
 
 		 961 aa  266  3e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5256  histidine kinase  25 
 
 		 1063 aa  260  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.015523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 1341 aa  258  7e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1027  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.33 
 
 		 1276 aa  249  3e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3041  histidine kinase  23.85 
 
 		 1175 aa  248  6e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.551193  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0756  sensory box sensor histidine kinase/DNA-binding response regulator  30.43 
 
 		 993 aa  244  6e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0605  histidine kinase  24.67 
 
 		 1190 aa  244  7.999999999999999e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2298  histidine kinase  25.26 
 
 		 1093 aa  243  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3829  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.12 
 
 		 1505 aa  236  3e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0688  histidine kinase/response regulator hybrid protein  24.9 
 
 		 1179 aa  234  7.000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0341  sensory box protein  25.57 
 
 		 1515 aa  234  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01690  histidine kinase-response regulator hybrid protein  24.2 
 
 		 1191 aa  233  2e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01691  histidine kinase/response regulator hybrid protein  23.92 
 
 		 1185 aa  232  3e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.578363  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3298  sensory box protein  26.93 
 
 		 1494 aa  232  3e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.217559 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 		 1711 aa  231  6e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2791  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.05 
 
 		 1226 aa  231  1e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.544858 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0415  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.18 
 
 		 1486 aa  228  4e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3354  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.65 
 
 		 1242 aa  226  3e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3648  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.28 
 
 		 1511 aa  225  4e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.8 
 
 		 1431 aa  219  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01692  histidine kinase-response regulator hybrid protein  25.94 
 
 		 921 aa  219  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.803557  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3521  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.54 
 
 		 1237 aa  218  8e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4052  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  24.57 
 
 		 1508 aa  218  8e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4026  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  24.91 
 
 		 1508 aa  217  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3424  GGDEF domain-containing protein  25.8 
 
 		 1502 aa  216  2.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.85 
 
 		 1140 aa  215  3.9999999999999995e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 		 1361 aa  214  7.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 1010 aa  214  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.412805  hitchhiker  0.00597184 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 1118 aa  213  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000390432  normal  0.0407868 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0148  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 1048 aa  213  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3950  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.57 
 
 		 1508 aa  213  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>