More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6369 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  46.55 
 
 		 1306 aa  1217    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  34.24 
 
 		 1370 aa  718    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  34.51 
 
 		 1378 aa  766    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  32.48 
 
 		 1340 aa  638    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  33.36 
 
 		 1355 aa  700    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  41.52 
 
 		 1378 aa  1054    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  32.47 
 
 		 1374 aa  729    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  100 
 
 		 1366 aa  2828    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  31.86 
 
 		 1388 aa  636    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  31.38 
 
 		 1347 aa  637    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  32.94 
 
 		 1374 aa  685    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  31.12 
 
 		 1400 aa  637    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  29.71 
 
 		 1342 aa  620  1e-176  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  30.86 
 
 		 1363 aa  618  1e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  29.47 
 
 		 1384 aa  613  9.999999999999999e-175  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  30.08 
 
 		 1418 aa  603  1.0000000000000001e-171  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  30.39 
 
 		 1404 aa  604  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  30.82 
 
 		 1373 aa  606  1.0000000000000001e-171  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  30.09 
 
 		 1397 aa  597  1e-169  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  28.03 
 
 		 1373 aa  580  1e-164  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  29.15 
 
 		 1355 aa  568  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  29.28 
 
 		 1334 aa  558  1e-157  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  30.2 
 
 		 1313 aa  555  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  30.94 
 
 		 1344 aa  551  1e-155  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  31.3 
 
 		 1526 aa  547  1e-154  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  28.5 
 
 		 1335 aa  537  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  28.24 
 
 		 1349 aa  521  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  34.57 
 
 		 1343 aa  509  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2019  histidine kinase  29.19 
 
 		 1316 aa  506  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523526  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0559  histidine kinase  28.26 
 
 		 1327 aa  503  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00477073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  29.53 
 
 		 1278 aa  491  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  28.25 
 
 		 1374 aa  486  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0921  histidine kinase  29.45 
 
 		 1105 aa  479  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615746 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  28.62 
 
 		 1324 aa  477  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2723  histidine kinase  27.18 
 
 		 1347 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  28.19 
 
 		 1407 aa  464  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1754  histidine kinase  32.06 
 
 		 1344 aa  463  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2318  histidine kinase  32.71 
 
 		 1298 aa  450  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  25.88 
 
 		 1414 aa  449  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  31.42 
 
 		 1311 aa  447  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1699  ATP-binding region, ATPase-like protein  26.56 
 
 		 1396 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170141  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.24 
 
 		 1258 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  27.63 
 
 		 1093 aa  392  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_105  histidine kinase CheY-like domain protein  27.81 
 
 		 1070 aa  389  1e-106  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  33.79 
 
 		 1366 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0275  histidine kinase  27.88 
 
 		 1070 aa  383  1e-104  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1493  sensor histidine kinase/response regulator  26.82 
 
 		 1086 aa  382  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0890895  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1470  histidine kinase  25.09 
 
 		 1376 aa  377  1e-102  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0500626  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3543  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.33 
 
 		 1498 aa  374  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.476146  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1562  histidine kinase  26.33 
 
 		 1296 aa  353  8.999999999999999e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.655639  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2607  GGDEF domain-containing protein  29.27 
 
 		 1054 aa  352  3e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202674  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6047  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  35.08 
 
 		 677 aa  340  9.999999999999999e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3199  two component transcriptional regulator, AraC family  34.02 
 
 		 940 aa  328  4.0000000000000003e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157032  normal  0.236848 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1331  sensor histidine kinase/response regulator  26.4 
 
 		 1118 aa  326  1e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  35.24 
 
 		 934 aa  325  3e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  25.89 
 
 		 1346 aa  325  4e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1335  histidine kinase  25.5 
 
 		 1278 aa  319  2e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820531 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1604  two component transcriptional regulator, AraC family  33.91 
 
 		 904 aa  318  6e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  27.81 
 
 		 1024 aa  309  3e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4604  histidine kinase  34.42 
 
 		 663 aa  308  4.0000000000000004e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0448  histidine kinase  26.7 
 
 		 1114 aa  306  2.0000000000000002e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.54 
 
 		 1079 aa  280  2e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0605  histidine kinase  24.19 
 
 		 1190 aa  276  1.0000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 1341 aa  275  6e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0688  histidine kinase/response regulator hybrid protein  24.04 
 
 		 1179 aa  270  1e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1905  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  32.38 
 
 		 668 aa  263  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0295515  normal  0.210974 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  24.89 
 
 		 1351 aa  262  4e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3041  histidine kinase  23.27 
 
 		 1175 aa  261  8e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.551193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.08 
 
 		 1415 aa  258  7e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4600  two component regulator propeller domain protein  25.16 
 
 		 1194 aa  257  1.0000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.779291 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  36.41 
 
 		 1299 aa  251  5e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1797  DNA-binding response regulator/sensor histidine kinase  30.93 
 
 		 961 aa  251  8e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.19 
 
 		 1431 aa  250  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01690  histidine kinase-response regulator hybrid protein  22.95 
 
 		 1191 aa  250  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 		 1426 aa  249  3e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.97 
 
 		 1153 aa  249  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359014  hitchhiker  0.0000017622 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  35.45 
 
 		 1427 aa  248  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.28 
 
 		 1010 aa  248  6e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.412805  hitchhiker  0.00597184 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0993  ligand-binding sensor domain-containing protein  24.88 
 
 		 1250 aa  247  9.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4608  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 		 1645 aa  246  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.284957  normal  0.407853 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 1131 aa  244  7e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4411  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.59 
 
 		 1514 aa  244  7e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0203527 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4349  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.79 
 
 		 1514 aa  244  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 1118 aa  243  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000390432  normal  0.0407868 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0755  GGDEF domain-containing protein  25.17 
 
 		 1053 aa  243  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0148  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 		 1048 aa  243  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 1385 aa  242  4e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 		 1140 aa  241  6.999999999999999e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.34 
 
 		 1711 aa  241  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.24 
 
 		 1559 aa  238  7e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.64 
 
 		 1287 aa  237  9e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.44 
 
 		 1390 aa  236  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.44 
 
 		 1390 aa  236  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.68 
 
 		 1390 aa  235  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  34.38 
 
 		 1202 aa  234  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0756  sensory box sensor histidine kinase/DNA-binding response regulator  28.6 
 
 		 993 aa  233  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5256  histidine kinase  24.78 
 
 		 1063 aa  233  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.015523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 1383 aa  233  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 		 1002 aa  233  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.41 
 
 		 1651 aa  231  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>