More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1493 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  93.78 
 
 		 1093 aa  2075    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1493  sensor histidine kinase/response regulator  100 
 
 		 1086 aa  2195    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0890895  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  30.64 
 
 		 1363 aa  460  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  30.59 
 
 		 1370 aa  458  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  30.1 
 
 		 1374 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  29.49 
 
 		 1407 aa  445  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  28.81 
 
 		 1397 aa  440  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  28.55 
 
 		 1355 aa  439  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  29.16 
 
 		 1378 aa  435  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0275  histidine kinase  29.59 
 
 		 1070 aa  426  1e-118  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  27.04 
 
 		 1342 aa  422  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_105  histidine kinase CheY-like domain protein  28.78 
 
 		 1070 aa  422  1e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  29.56 
 
 		 1340 aa  417  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  29.15 
 
 		 1347 aa  416  1e-114  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  29.57 
 
 		 1400 aa  414  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  26.39 
 
 		 1378 aa  412  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  27.39 
 
 		 1388 aa  403  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  28.3 
 
 		 1306 aa  402  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  25.82 
 
 		 1526 aa  393  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0921  histidine kinase  27.26 
 
 		 1105 aa  385  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615746 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1331  sensor histidine kinase/response regulator  28.56 
 
 		 1118 aa  379  1e-103  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  28.75 
 
 		 1374 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  27.58 
 
 		 1366 aa  375  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2607  GGDEF domain-containing protein  30.72 
 
 		 1054 aa  365  2e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202674  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  28.03 
 
 		 1335 aa  363  9e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1699  ATP-binding region, ATPase-like protein  27.03 
 
 		 1396 aa  360  7e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170141  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0559  histidine kinase  27.52 
 
 		 1327 aa  357  5.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00477073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  27.45 
 
 		 1334 aa  356  2e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  27.94 
 
 		 1373 aa  351  5e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3543  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.83 
 
 		 1498 aa  348  4e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.476146  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  26.46 
 
 		 1418 aa  346  1e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  27.26 
 
 		 1351 aa  345  2e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  25.76 
 
 		 1404 aa  342  2e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2019  histidine kinase  27.56 
 
 		 1316 aa  338  2.9999999999999997e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523526  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  25.09 
 
 		 1346 aa  338  5e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  26.47 
 
 		 1349 aa  337  7e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  28.89 
 
 		 1384 aa  337  7e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  26.4 
 
 		 1355 aa  337  9e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  27 
 
 		 1024 aa  326  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0448  histidine kinase  24.87 
 
 		 1114 aa  319  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  26.81 
 
 		 1373 aa  318  3e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 		 1258 aa  318  4e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  27 
 
 		 1313 aa  317  7e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  27.73 
 
 		 1344 aa  310  1.0000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3041  histidine kinase  23.61 
 
 		 1175 aa  308  4.0000000000000004e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.551193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1335  histidine kinase  23.59 
 
 		 1278 aa  296  1e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820531 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  25.07 
 
 		 1343 aa  293  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01691  histidine kinase/response regulator hybrid protein  22.66 
 
 		 1185 aa  290  1e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.578363  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1754  histidine kinase  25.09 
 
 		 1344 aa  290  1e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  25.3 
 
 		 1311 aa  287  5.999999999999999e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.04 
 
 		 1079 aa  278  4e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0755  GGDEF domain-containing protein  27.35 
 
 		 1053 aa  273  1e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2318  histidine kinase  26.18 
 
 		 1298 aa  272  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2723  histidine kinase  24.86 
 
 		 1347 aa  271  4e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  24.33 
 
 		 1324 aa  265  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  24.89 
 
 		 1374 aa  263  1e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3648  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.12 
 
 		 1511 aa  261  6e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3042  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  22.5 
 
 		 1181 aa  259  1e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.227036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4026  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  26.33 
 
 		 1508 aa  259  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4052  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  26.38 
 
 		 1508 aa  259  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3521  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.1 
 
 		 1237 aa  258  4e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  24.1 
 
 		 1414 aa  257  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0993  ligand-binding sensor domain-containing protein  25.6 
 
 		 1250 aa  256  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4145  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  25.95 
 
 		 1508 aa  254  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2791  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.64 
 
 		 1226 aa  254  6e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.544858 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3950  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26 
 
 		 1508 aa  254  6e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3354  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.21 
 
 		 1242 aa  253  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3633  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.94 
 
 		 1504 aa  253  1e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0311  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.17 
 
 		 1504 aa  252  3e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0605  histidine kinase  23.51 
 
 		 1190 aa  251  5e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5256  histidine kinase  23.36 
 
 		 1063 aa  251  6e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.015523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4159  histidine kinase  24.8 
 
 		 1017 aa  250  9e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0934723  normal  0.139569 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0341  sensory box protein  26.04 
 
 		 1515 aa  250  1e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05925  GGDEF domain protein  25.42 
 
 		 1005 aa  250  1e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3829  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.03 
 
 		 1505 aa  247  8e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3424  GGDEF domain-containing protein  26.29 
 
 		 1502 aa  245  3e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0688  histidine kinase/response regulator hybrid protein  23.7 
 
 		 1179 aa  244  6e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_84  histidine kinase  23.85 
 
 		 1084 aa  242  2.9999999999999997e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0415  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.35 
 
 		 1486 aa  240  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01690  histidine kinase-response regulator hybrid protein  22.16 
 
 		 1191 aa  239  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  24.39 
 
 		 1278 aa  232  3e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3298  sensory box protein  25.26 
 
 		 1494 aa  230  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.217559 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4681  GGDEF domain-containing protein  26.33 
 
 		 1034 aa  228  3e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4600  two component regulator propeller domain protein  24.83 
 
 		 1194 aa  225  4e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.779291 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01692  histidine kinase-response regulator hybrid protein  22.96 
 
 		 921 aa  217  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.803557  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1470  histidine kinase  23.02 
 
 		 1376 aa  214  7.999999999999999e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0500626  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1852  histidine kinase  23.13 
 
 		 1074 aa  204  7e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.496494  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1685  GGDEF domain-containing protein  25.83 
 
 		 987 aa  193  2e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00461565  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1523  sensory box histidine kinase  42.8 
 
 		 787 aa  191  5e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00153524  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1316  sensory box histidine kinase  43.7 
 
 		 787 aa  191  5.999999999999999e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00351204  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0198  sensory box histidine kinase  43.22 
 
 		 791 aa  191  8e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00155091  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  22.16 
 
 		 1093 aa  191  8e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3383  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 		 617 aa  190  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3101  histidine kinase  24.4 
 
 		 1037 aa  189  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377571  normal  0.147743 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0195  sensory box histidine kinase  43.32 
 
 		 791 aa  188  5e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00184929  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1105  signal transduction histidine kinase-like protein  22.42 
 
 		 1141 aa  188  5e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1400  signal transduction histidine kinase, LytS  23.14 
 
 		 1051 aa  187  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1316  diguanylate cyclase  21.7 
 
 		 1004 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.730261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0286  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.97 
 
 		 424 aa  186  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.136894  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2076  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.72 
 
 		 387 aa  186  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.52949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>