More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0921 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  52.01 
 
 		 1407 aa  1120    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0921  histidine kinase  100 
 
 		 1105 aa  2274    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.54 
 
 		 1258 aa  582  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  33.39 
 
 		 1526 aa  578  1.0000000000000001e-163  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  33.48 
 
 		 1374 aa  560  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  32.67 
 
 		 1306 aa  543  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  32.21 
 
 		 1397 aa  527  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  31.53 
 
 		 1355 aa  526  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  32.58 
 
 		 1370 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  31.8 
 
 		 1378 aa  503  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  31.59 
 
 		 1347 aa  496  9.999999999999999e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  30.19 
 
 		 1378 aa  491  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  29.91 
 
 		 1363 aa  488  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_105  histidine kinase CheY-like domain protein  29.57 
 
 		 1070 aa  487  1e-136  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0275  histidine kinase  29.81 
 
 		 1070 aa  488  1e-136  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3543  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.43 
 
 		 1498 aa  480  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.476146  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  29.36 
 
 		 1366 aa  481  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  34.06 
 
 		 1024 aa  475  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  28.77 
 
 		 1334 aa  476  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  30.43 
 
 		 1388 aa  469  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  28.6 
 
 		 1384 aa  459  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  29.54 
 
 		 1374 aa  436  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.44 
 
 		 1079 aa  433  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  28.84 
 
 		 1400 aa  432  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  29.49 
 
 		 1342 aa  429  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  29.25 
 
 		 1351 aa  425  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  28.83 
 
 		 1404 aa  426  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  27.74 
 
 		 1418 aa  420  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  28.38 
 
 		 1340 aa  418  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  27.21 
 
 		 1373 aa  418  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1335  histidine kinase  28.57 
 
 		 1278 aa  418  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820531 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  29.77 
 
 		 1355 aa  407  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  27.94 
 
 		 1093 aa  405  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  29.57 
 
 		 1313 aa  399  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  28.88 
 
 		 1414 aa  399  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2607  GGDEF domain-containing protein  28.88 
 
 		 1054 aa  395  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202674  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1331  sensor histidine kinase/response regulator  26.93 
 
 		 1118 aa  391  1e-107  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0448  histidine kinase  28.62 
 
 		 1114 aa  391  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1493  sensor histidine kinase/response regulator  27 
 
 		 1086 aa  389  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0890895  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  27.06 
 
 		 1373 aa  389  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1699  ATP-binding region, ATPase-like protein  28.13 
 
 		 1396 aa  374  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170141  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  26.78 
 
 		 1335 aa  360  9e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0755  GGDEF domain-containing protein  28.43 
 
 		 1053 aa  355  2.9999999999999997e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4681  GGDEF domain-containing protein  29.28 
 
 		 1034 aa  354  5.9999999999999994e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0559  histidine kinase  25.28 
 
 		 1327 aa  351  3e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00477073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2019  histidine kinase  26.38 
 
 		 1316 aa  344  5e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523526  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  25.18 
 
 		 1349 aa  342  2.9999999999999998e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4600  two component regulator propeller domain protein  29.14 
 
 		 1194 aa  340  9e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.779291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  26.13 
 
 		 1343 aa  332  3e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_84  histidine kinase  25.55 
 
 		 1084 aa  327  1e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  28.65 
 
 		 1346 aa  321  6e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  25.8 
 
 		 1278 aa  311  4e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4159  histidine kinase  26.07 
 
 		 1017 aa  305  3.0000000000000004e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0934723  normal  0.139569 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  26.23 
 
 		 1374 aa  304  8.000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  25.74 
 
 		 1344 aa  303  1e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  33.33 
 
 		 1311 aa  302  3e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3042  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.9 
 
 		 1181 aa  292  2e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.227036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  25.95 
 
 		 1324 aa  292  3e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2723  histidine kinase  26.01 
 
 		 1347 aa  290  8e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1316  diguanylate cyclase  27.84 
 
 		 1004 aa  280  8e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.730261  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0341  sensory box protein  25 
 
 		 1515 aa  279  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2318  histidine kinase  24.6 
 
 		 1298 aa  278  4e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0311  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.52 
 
 		 1504 aa  277  7e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5256  histidine kinase  25.38 
 
 		 1063 aa  275  5.000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.015523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3633  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.17 
 
 		 1504 aa  273  1e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3041  histidine kinase  24.82 
 
 		 1175 aa  271  5e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.551193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3648  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.21 
 
 		 1511 aa  271  5.9999999999999995e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01691  histidine kinase/response regulator hybrid protein  24.69 
 
 		 1185 aa  270  1e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.578363  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3354  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 		 1242 aa  269  2.9999999999999995e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3829  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.59 
 
 		 1505 aa  265  4e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  53.53 
 
 		 1178 aa  259  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3521  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.52 
 
 		 1237 aa  258  4e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1754  histidine kinase  29.16 
 
 		 1344 aa  252  3e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2792  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50.21 
 
 		 930 aa  252  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.111634 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0993  ligand-binding sensor domain-containing protein  24.83 
 
 		 1250 aa  251  4e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3829  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.65 
 
 		 475 aa  249  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.821642 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4026  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  25.93 
 
 		 1508 aa  248  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1041  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.6 
 
 		 1406 aa  243  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.845277 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0139  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.38 
 
 		 1066 aa  243  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4145  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  25.51 
 
 		 1508 aa  243  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1027  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.15 
 
 		 1276 aa  241  5e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  24.2 
 
 		 1093 aa  238  4e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1039  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.79 
 
 		 1259 aa  238  6e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05925  GGDEF domain protein  23.79 
 
 		 1005 aa  236  2.0000000000000002e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0688  histidine kinase/response regulator hybrid protein  25.73 
 
 		 1179 aa  235  4.0000000000000004e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3424  GGDEF domain-containing protein  25.09 
 
 		 1502 aa  234  1e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0605  histidine kinase  25.24 
 
 		 1190 aa  231  5e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3298  sensory box protein  25.24 
 
 		 1494 aa  231  5e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.217559 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1400  signal transduction histidine kinase, LytS  24.06 
 
 		 1051 aa  230  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01690  histidine kinase-response regulator hybrid protein  25.05 
 
 		 1191 aa  229  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3101  histidine kinase  25.09 
 
 		 1037 aa  229  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377571  normal  0.147743 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1685  GGDEF domain-containing protein  24.36 
 
 		 987 aa  228  4e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00461565  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1665  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.31 
 
 		 1505 aa  228  4e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.40172  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.3 
 
 		 1043 aa  226  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2298  histidine kinase  22.31 
 
 		 1093 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0595  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.34 
 
 		 752 aa  216  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0415  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.63 
 
 		 1486 aa  213  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2140  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.6 
 
 		 1211 aa  209  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382987 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.07 
 
 		 1030 aa  207  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223882  normal  0.750566 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3394  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 		 728 aa  207  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.99137  normal  0.249099 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>