More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1944 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  34.22 
 
 		 1355 aa  725    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  100 
 
 		 1278 aa  2648    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  34.11 
 
 		 1374 aa  719    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  50.66 
 
 		 1324 aa  1248    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  32.03 
 
 		 1370 aa  625  1e-177  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  31.56 
 
 		 1388 aa  617  1e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  30.65 
 
 		 1340 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  29.52 
 
 		 1347 aa  570  1e-161  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  30.91 
 
 		 1373 aa  570  1e-161  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  29.94 
 
 		 1384 aa  557  1e-157  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  30.38 
 
 		 1374 aa  553  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  31.04 
 
 		 1373 aa  555  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  29.35 
 
 		 1397 aa  551  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  29.53 
 
 		 1306 aa  549  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  28.47 
 
 		 1363 aa  540  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  28.76 
 
 		 1400 aa  535  1e-150  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  29.16 
 
 		 1378 aa  528  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  28.08 
 
 		 1334 aa  528  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  28.85 
 
 		 1404 aa  520  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  29.33 
 
 		 1355 aa  506  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  27.48 
 
 		 1418 aa  500  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  29.45 
 
 		 1366 aa  500  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2019  histidine kinase  29.14 
 
 		 1316 aa  498  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523526  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  27.97 
 
 		 1378 aa  489  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  28.21 
 
 		 1335 aa  488  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  27.94 
 
 		 1342 aa  484  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  29.31 
 
 		 1344 aa  482  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  28.22 
 
 		 1313 aa  473  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0559  histidine kinase  27.41 
 
 		 1327 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00477073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  28.13 
 
 		 1343 aa  447  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2318  histidine kinase  28.9 
 
 		 1298 aa  436  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2723  histidine kinase  27.02 
 
 		 1347 aa  416  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  25.66 
 
 		 1349 aa  388  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  26.89 
 
 		 1526 aa  382  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  31.31 
 
 		 1311 aa  382  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1470  histidine kinase  25.78 
 
 		 1376 aa  374  1e-102  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0500626  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  32.31 
 
 		 1366 aa  348  3e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1699  ATP-binding region, ATPase-like protein  25.25 
 
 		 1396 aa  342  4e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170141  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1754  histidine kinase  30 
 
 		 1344 aa  338  3.9999999999999995e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  24.43 
 
 		 1407 aa  335  2e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  26.46 
 
 		 1374 aa  325  3e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1604  two component transcriptional regulator, AraC family  35.94 
 
 		 904 aa  322  3e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0921  histidine kinase  25.87 
 
 		 1105 aa  309  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615746 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  32.95 
 
 		 934 aa  306  1.0000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3199  two component transcriptional regulator, AraC family  36.17 
 
 		 940 aa  298  4e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157032  normal  0.236848 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1331  sensor histidine kinase/response regulator  25.64 
 
 		 1118 aa  292  3e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6047  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  33.82 
 
 		 677 aa  291  6e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1335  histidine kinase  25.04 
 
 		 1278 aa  289  2.9999999999999996e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820531 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 1341 aa  284  9e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.22 
 
 		 1258 aa  283  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_105  histidine kinase CheY-like domain protein  24.76 
 
 		 1070 aa  281  5e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1562  histidine kinase  23.65 
 
 		 1296 aa  275  4.0000000000000004e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.655639  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0275  histidine kinase  24.25 
 
 		 1070 aa  273  1e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4604  histidine kinase  32.22 
 
 		 663 aa  259  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0756  sensory box sensor histidine kinase/DNA-binding response regulator  32.07 
 
 		 993 aa  252  3e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  27.48 
 
 		 1024 aa  252  4e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  25.33 
 
 		 1093 aa  252  4e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1493  sensor histidine kinase/response regulator  25.61 
 
 		 1086 aa  248  4.9999999999999997e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0890895  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1797  DNA-binding response regulator/sensor histidine kinase  30.61 
 
 		 961 aa  247  9.999999999999999e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1905  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  31.51 
 
 		 668 aa  247  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0295515  normal  0.210974 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2607  GGDEF domain-containing protein  26.63 
 
 		 1054 aa  236  3e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202674  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 1131 aa  235  4.0000000000000004e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0448  histidine kinase  24.81 
 
 		 1114 aa  234  7.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  23.75 
 
 		 1346 aa  230  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  24.32 
 
 		 1351 aa  225  4e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  32.56 
 
 		 1202 aa  224  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  26.68 
 
 		 1414 aa  218  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 1383 aa  218  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3543  Hpt sensor hybrid histidine kinase  22.86 
 
 		 1498 aa  218  7e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.476146  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.85 
 
 		 1079 aa  218  8e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  30.51 
 
 		 1427 aa  216  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 		 1010 aa  214  7.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.412805  hitchhiker  0.00597184 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.68 
 
 		 1390 aa  214  9e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  32.64 
 
 		 1299 aa  214  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.95 
 
 		 1051 aa  213  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2687  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 		 1013 aa  213  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.81 
 
 		 1426 aa  211  9e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.44 
 
 		 1287 aa  210  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.46 
 
 		 1390 aa  210  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.46 
 
 		 1390 aa  210  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 1153 aa  209  4e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359014  hitchhiker  0.0000017622 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.39 
 
 		 1431 aa  208  5e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1027  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.5 
 
 		 1276 aa  208  6e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3042  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  21.92 
 
 		 1181 aa  207  8e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.227036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.51 
 
 		 1415 aa  206  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 1711 aa  205  4e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 		 1140 aa  205  5e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4159  histidine kinase  24.97 
 
 		 1017 aa  204  6e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0934723  normal  0.139569 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0148  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 		 1048 aa  204  6e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  32.65 
 
 		 1156 aa  203  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01690  histidine kinase-response regulator hybrid protein  23.28 
 
 		 1191 aa  202  3.9999999999999996e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4411  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.39 
 
 		 1514 aa  201  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0203527 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  30.81 
 
 		 1180 aa  200  1.0000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 		 1361 aa  200  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 1003 aa  200  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4608  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 		 1645 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.284957  normal  0.407853 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  31.41 
 
 		 1172 aa  199  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3041  histidine kinase  22.9 
 
 		 1175 aa  199  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.551193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4349  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.39 
 
 		 1514 aa  199  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 1118 aa  198  5.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000390432  normal  0.0407868 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>