More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2648 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  33.16 
 
 		 1340 aa  674    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  33.04 
 
 		 1374 aa  710    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  34.48 
 
 		 1374 aa  821    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  100 
 
 		 1363 aa  2793    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  31.3 
 
 		 1388 aa  688    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  31.1 
 
 		 1373 aa  638    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  30.14 
 
 		 1418 aa  661    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  33.93 
 
 		 1400 aa  762    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  33 
 
 		 1397 aa  772    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  34.6 
 
 		 1306 aa  708    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  35.98 
 
 		 1355 aa  833    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  33 
 
 		 1384 aa  691    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  36.33 
 
 		 1370 aa  815    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  32.03 
 
 		 1378 aa  731    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  30.31 
 
 		 1373 aa  635  1e-180  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  31.74 
 
 		 1313 aa  627  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  30.08 
 
 		 1342 aa  621  1e-176  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  29.15 
 
 		 1404 aa  616  9.999999999999999e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  30.95 
 
 		 1366 aa  604  1.0000000000000001e-171  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2019  histidine kinase  31.69 
 
 		 1316 aa  602  1e-170  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523526  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  29.78 
 
 		 1378 aa  599  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  30.72 
 
 		 1334 aa  598  1e-169  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0559  histidine kinase  29.37 
 
 		 1327 aa  595  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00477073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  30.37 
 
 		 1355 aa  590  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  30.31 
 
 		 1526 aa  584  1.0000000000000001e-165  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  29.62 
 
 		 1347 aa  573  1.0000000000000001e-162  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2723  histidine kinase  29.71 
 
 		 1347 aa  558  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  27.46 
 
 		 1343 aa  532  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  28.52 
 
 		 1278 aa  526  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  28.01 
 
 		 1349 aa  528  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  29.06 
 
 		 1335 aa  526  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1699  ATP-binding region, ATPase-like protein  26.82 
 
 		 1396 aa  515  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170141  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  27.99 
 
 		 1324 aa  512  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  28.88 
 
 		 1407 aa  496  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  28.76 
 
 		 1374 aa  494  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  27.91 
 
 		 1344 aa  489  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0921  histidine kinase  29.91 
 
 		 1105 aa  475  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615746 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  31.34 
 
 		 1093 aa  472  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 		 1258 aa  466  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1754  histidine kinase  27.89 
 
 		 1344 aa  461  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1493  sensor histidine kinase/response regulator  30.61 
 
 		 1086 aa  455  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0890895  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1470  histidine kinase  27.36 
 
 		 1376 aa  448  1.0000000000000001e-124  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0500626  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  27.82 
 
 		 1311 aa  448  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2318  histidine kinase  27.73 
 
 		 1298 aa  442  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_105  histidine kinase CheY-like domain protein  28.21 
 
 		 1070 aa  414  1e-114  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1562  histidine kinase  27.3 
 
 		 1296 aa  397  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.655639  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2607  GGDEF domain-containing protein  29.79 
 
 		 1054 aa  390  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202674  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  34.54 
 
 		 1366 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3543  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.17 
 
 		 1498 aa  370  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.476146  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1331  sensor histidine kinase/response regulator  26.88 
 
 		 1118 aa  357  1e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0275  histidine kinase  27.02 
 
 		 1070 aa  355  2.9999999999999997e-96  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  27.37 
 
 		 1024 aa  336  2e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0755  GGDEF domain-containing protein  27.74 
 
 		 1053 aa  325  3e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1335  histidine kinase  26.42 
 
 		 1278 aa  323  9.999999999999999e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820531 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  34.72 
 
 		 934 aa  317  8e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1604  two component transcriptional regulator, AraC family  33.46 
 
 		 904 aa  308  5.0000000000000004e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  24.66 
 
 		 1351 aa  307  1.0000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3199  two component transcriptional regulator, AraC family  33.88 
 
 		 940 aa  299  3e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157032  normal  0.236848 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  24.17 
 
 		 1346 aa  295  5e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.91 
 
 		 1079 aa  287  8e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5256  histidine kinase  26.06 
 
 		 1063 aa  277  9e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.015523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6047  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  32.57 
 
 		 677 aa  270  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0448  histidine kinase  24.98 
 
 		 1114 aa  268  5e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3041  histidine kinase  22.36 
 
 		 1175 aa  266  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.551193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0605  histidine kinase  22.73 
 
 		 1190 aa  262  3e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 1341 aa  261  8e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0688  histidine kinase/response regulator hybrid protein  23.05 
 
 		 1179 aa  260  1e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_84  histidine kinase  23.36 
 
 		 1084 aa  256  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01690  histidine kinase-response regulator hybrid protein  22.43 
 
 		 1191 aa  254  9.000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1797  DNA-binding response regulator/sensor histidine kinase  31.18 
 
 		 961 aa  253  2e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4604  histidine kinase  31.55 
 
 		 663 aa  253  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4681  GGDEF domain-containing protein  26.46 
 
 		 1034 aa  252  4e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1316  diguanylate cyclase  24.75 
 
 		 1004 aa  252  4e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.730261  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0341  sensory box protein  24.51 
 
 		 1515 aa  251  7e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3521  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 1237 aa  249  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3829  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.89 
 
 		 1505 aa  245  3e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01691  histidine kinase/response regulator hybrid protein  21.72 
 
 		 1185 aa  245  3.9999999999999997e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.578363  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4600  two component regulator propeller domain protein  24.46 
 
 		 1194 aa  245  5e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.779291 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3101  histidine kinase  25.11 
 
 		 1037 aa  243  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377571  normal  0.147743 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0993  ligand-binding sensor domain-containing protein  23.81 
 
 		 1250 aa  244  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3633  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.3 
 
 		 1504 aa  239  3e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3354  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.77 
 
 		 1242 aa  238  8e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3950  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.89 
 
 		 1508 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3298  sensory box protein  26.48 
 
 		 1494 aa  234  8.000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.217559 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4052  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  26.18 
 
 		 1508 aa  234  9e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0311  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.94 
 
 		 1504 aa  234  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4145  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  25.66 
 
 		 1508 aa  234  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4026  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  25.77 
 
 		 1508 aa  233  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  24.74 
 
 		 1414 aa  231  5e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3648  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.4 
 
 		 1511 aa  231  8e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3424  GGDEF domain-containing protein  25.94 
 
 		 1502 aa  229  3e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 1010 aa  229  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.412805  hitchhiker  0.00597184 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 1131 aa  225  4e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1905  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  31.31 
 
 		 668 aa  224  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0295515  normal  0.210974 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3042  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  21.51 
 
 		 1181 aa  224  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.227036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0148  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 		 1048 aa  223  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4159  histidine kinase  26.59 
 
 		 1017 aa  221  5e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0934723  normal  0.139569 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0756  sensory box sensor histidine kinase/DNA-binding response regulator  28.12 
 
 		 993 aa  220  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01692  histidine kinase-response regulator hybrid protein  22.9 
 
 		 921 aa  214  7e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.803557  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1027  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.14 
 
 		 1276 aa  214  9e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>