More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0343 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 1079 aa  2202    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  35.89 
 
 		 1407 aa  516  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 1258 aa  477  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0921  histidine kinase  34.58 
 
 		 1105 aa  453  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615746 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2607  GGDEF domain-containing protein  29.07 
 
 		 1054 aa  417  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202674  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  31.66 
 
 		 1526 aa  404  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  32.01 
 
 		 1397 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  33.63 
 
 		 1370 aa  381  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  29.62 
 
 		 1355 aa  377  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  30.7 
 
 		 1374 aa  370  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0275  histidine kinase  29.85 
 
 		 1070 aa  352  2e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  32.2 
 
 		 1306 aa  342  2e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_105  histidine kinase CheY-like domain protein  30.41 
 
 		 1070 aa  341  4e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  31.12 
 
 		 1342 aa  336  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  31.46 
 
 		 1378 aa  333  9e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  32.78 
 
 		 1388 aa  317  9.999999999999999e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  33.38 
 
 		 1024 aa  311  5.9999999999999995e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1335  histidine kinase  28.18 
 
 		 1278 aa  307  7e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820531 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  27.85 
 
 		 1334 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  28.47 
 
 		 1378 aa  305  3.0000000000000004e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  26.17 
 
 		 1363 aa  301  5e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  28.26 
 
 		 1355 aa  296  1e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0755  GGDEF domain-containing protein  27.5 
 
 		 1053 aa  296  1e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  31.35 
 
 		 1366 aa  295  3e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  28.71 
 
 		 1347 aa  294  5e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1493  sensor histidine kinase/response regulator  30.04 
 
 		 1086 aa  292  2e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0890895  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  31.34 
 
 		 1374 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  29.03 
 
 		 1093 aa  281  5e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  25.34 
 
 		 1373 aa  276  2.0000000000000002e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0448  histidine kinase  27.84 
 
 		 1114 aa  273  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4600  two component regulator propeller domain protein  31.15 
 
 		 1194 aa  272  2.9999999999999997e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.779291 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3543  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.54 
 
 		 1498 aa  267  7e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.476146  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  27.84 
 
 		 1343 aa  267  8e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  25.56 
 
 		 1384 aa  267  1e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  26.69 
 
 		 1414 aa  265  4.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1699  ATP-binding region, ATPase-like protein  29.93 
 
 		 1396 aa  263  1e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170141  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.2 
 
 		 601 aa  260  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  30.29 
 
 		 1313 aa  256  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1624  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.11 
 
 		 626 aa  252  3e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.835429  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2019  histidine kinase  23.76 
 
 		 1316 aa  251  6e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523526  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  29.31 
 
 		 1418 aa  250  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.39 
 
 		 636 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  27.49 
 
 		 1340 aa  245  3.9999999999999997e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  24.88 
 
 		 1373 aa  244  5e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  23.74 
 
 		 1400 aa  243  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0559  histidine kinase  27.08 
 
 		 1327 aa  243  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00477073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  26.99 
 
 		 1349 aa  243  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  28.08 
 
 		 1335 aa  238  6e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4681  GGDEF domain-containing protein  25.63 
 
 		 1034 aa  236  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0993  ligand-binding sensor domain-containing protein  26.04 
 
 		 1250 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  24.48 
 
 		 1278 aa  234  8.000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  35.75 
 
 		 1311 aa  231  7e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  24.79 
 
 		 1404 aa  230  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.05 
 
 		 628 aa  228  6e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1316  diguanylate cyclase  29.21 
 
 		 1004 aa  226  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.730261  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05925  GGDEF domain protein  27.19 
 
 		 1005 aa  226  3e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1331  sensor histidine kinase/response regulator  25.32 
 
 		 1118 aa  223  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3045  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.68 
 
 		 563 aa  220  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000317109  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2298  histidine kinase  24.95 
 
 		 1093 aa  220  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.57 
 
 		 557 aa  219  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0612  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.61 
 
 		 543 aa  218  4e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3107  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.43 
 
 		 542 aa  211  8e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.78 
 
 		 570 aa  209  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3648  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.95 
 
 		 1511 aa  207  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3298  sensory box protein  27.38 
 
 		 1494 aa  206  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.217559 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3521  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.06 
 
 		 1237 aa  203  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  40.71 
 
 		 549 aa  201  6e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  23.32 
 
 		 1351 aa  201  6e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.75 
 
 		 540 aa  201  9e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1041  methyl-accepting chemotaxis protein  40.62 
 
 		 541 aa  200  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.893443  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.84 
 
 		 547 aa  200  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3829  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.19 
 
 		 1505 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0341  sensory box protein  26.8 
 
 		 1515 aa  198  5.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  25.22 
 
 		 1374 aa  197  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2156  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.05 
 
 		 575 aa  196  2e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  39.69 
 
 		 544 aa  194  6e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.19 
 
 		 538 aa  194  7e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0821  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.75 
 
 		 545 aa  194  7e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000877148  hitchhiker  0.00000558474 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1754  histidine kinase  33.89 
 
 		 1344 aa  193  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3063  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.83 
 
 		 533 aa  194  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.378908  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.88 
 
 		 540 aa  193  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1685  GGDEF domain-containing protein  23.37 
 
 		 987 aa  192  2e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00461565  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5256  histidine kinase  25.75 
 
 		 1063 aa  192  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.015523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.06 
 
 		 549 aa  192  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.42 
 
 		 518 aa  192  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.42 
 
 		 540 aa  192  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2791  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.78 
 
 		 1226 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.544858 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.48 
 
 		 550 aa  192  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3770  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.59 
 
 		 691 aa  192  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.69 
 
 		 473 aa  192  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5305  chemotaxis sensory transducer  33.7 
 
 		 686 aa  192  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.115158  normal  0.281343 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.58 
 
 		 518 aa  192  4e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.06 
 
 		 541 aa  191  5e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0311  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.57 
 
 		 1504 aa  191  5e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3633  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.72 
 
 		 1504 aa  191  7e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.38 
 
 		 544 aa  191  8e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1374  methyl-accepting chemotaxis protein  40.96 
 
 		 541 aa  191  9e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.27 
 
 		 678 aa  190  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.01 
 
 		 565 aa  190  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.121118  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0511  twitching motility protein PilJ  34.27 
 
 		 682 aa  189  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>