More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0406 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0475  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  75.72 
 
 		 686 aa  976    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.178091  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4989  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  76.17 
 
 		 686 aa  952    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4863  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  76.32 
 
 		 686 aa  952    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0070905 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2901  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.81 
 
 		 700 aa  648    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.726182  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5031  type IV pilus biogenesis protein PilJ  78.05 
 
 		 680 aa  988    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3770  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.19 
 
 		 691 aa  887    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0491  chemotaxis sensory transducer  77.89 
 
 		 680 aa  985    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  76.17 
 
 		 686 aa  951    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.468878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05360  twitching motility protein PilJ  87.74 
 
 		 682 aa  1168    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 678 aa  1342    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5305  chemotaxis sensory transducer  79.14 
 
 		 686 aa  1042    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.115158  normal  0.281343 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0511  twitching motility protein PilJ  87.74 
 
 		 682 aa  1167    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3631  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.15 
 
 		 731 aa  739    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.455048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01605  pilus biogenesis protein  48.64 
 
 		 678 aa  540  9.999999999999999e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.128934  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2397  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.47 
 
 		 686 aa  528  1e-148  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.688228 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3086  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.97 
 
 		 678 aa  498  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.12197 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.15 
 
 		 680 aa  483  1e-135  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  71.87 
 
 		 473 aa  484  1e-135  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1019  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.77 
 
 		 680 aa  480  1e-134  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.58121  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1815  putative chemotaxis sensory transducer  71.51 
 
 		 475 aa  478  1e-133  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0517  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.1 
 
 		 671 aa  456  1e-127  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.104858  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0128  chemotaxis sensory transducer  73.8 
 
 		 537 aa  456  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3896  chemotaxis sensory transducer  42.66 
 
 		 706 aa  449  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2156  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.88 
 
 		 575 aa  444  1e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2549  chemotaxis sensory transducer  40.31 
 
 		 707 aa  431  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.67 
 
 		 560 aa  423  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0237962  normal  0.734928 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0563  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.25 
 
 		 745 aa  423  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0615  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.25 
 
 		 745 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.685399  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0671  putative twitching motility transmembrane protein  40.52 
 
 		 743 aa  419  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.357708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38 
 
 		 733 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.89 
 
 		 733 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.371682  normal  0.522662 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3018  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.78 
 
 		 767 aa  384  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.238689  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3351  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.77 
 
 		 759 aa  377  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.335724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.12 
 
 		 692 aa  378  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.534971 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0904  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.77 
 
 		 745 aa  375  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2898  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.2 
 
 		 754 aa  368  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0204496  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3575  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.2 
 
 		 754 aa  369  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946853  normal  0.162427 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4623  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.86 
 
 		 770 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408638  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1245  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.83 
 
 		 543 aa  369  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403133  normal  0.310409 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3968  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.75 
 
 		 777 aa  364  3e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0103685 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1575  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.44 
 
 		 749 aa  360  4e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1374  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.08 
 
 		 759 aa  355  2e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.43954  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3187  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.7 
 
 		 745 aa  352  2e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.484204  normal  0.234759 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3691  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.69 
 
 		 704 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.02239  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1015  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41 
 
 		 839 aa  238  3e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0741142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3745  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.47 
 
 		 852 aa  228  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0506  chemotaxis sensory transducer  36.94 
 
 		 982 aa  219  8.999999999999998e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.202983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4746  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.29 
 
 		 503 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363987 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4950  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.19 
 
 		 975 aa  218  2e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  39 
 
 		 1153 aa  217  7e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2778  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  39 
 
 		 1153 aa  217  7e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.970502 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.6 
 
 		 915 aa  212  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  38.01 
 
 		 902 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.59 
 
 		 787 aa  206  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.68627  normal  0.569737 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0749  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.34 
 
 		 880 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0720  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.34 
 
 		 880 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2793  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.88 
 
 		 778 aa  204  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3107  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.52 
 
 		 542 aa  201  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with phytochrome sensor  36.77 
 
 		 1406 aa  201  5e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0185965  normal  0.079214 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  38.63 
 
 		 879 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.698769  hitchhiker  0.00000570114 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.75 
 
 		 570 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3246  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.87 
 
 		 1105 aa  196  9e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.610597  normal  0.482443 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.09 
 
 		 538 aa  196  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1033  methyl-accepting chemotaxis protein  37.35 
 
 		 533 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.58 
 
 		 541 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.27 
 
 		 1079 aa  191  5e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.73 
 
 		 550 aa  191  5e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0724  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.01 
 
 		 539 aa  191  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1884  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.09 
 
 		 547 aa  190  5.999999999999999e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.54 
 
 		 544 aa  190  5.999999999999999e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0612  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.65 
 
 		 543 aa  190  5.999999999999999e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.96 
 
 		 533 aa  191  5.999999999999999e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1426  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.45 
 
 		 768 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.541717  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  38.12 
 
 		 549 aa  189  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3063  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.96 
 
 		 533 aa  189  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.378908  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0520  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.48 
 
 		 711 aa  189  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1029  methyl-accepting chemotaxis protein  37.58 
 
 		 549 aa  188  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.392996  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.59 
 
 		 540 aa  187  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0302394  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.26 
 
 		 557 aa  187  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  37.5 
 
 		 549 aa  187  5e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2326  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.7 
 
 		 547 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.44 
 
 		 628 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0401  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  37.12 
 
 		 539 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.395676  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.8 
 
 		 542 aa  182  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0226154 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  37.89 
 
 		 544 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.09 
 
 		 540 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0061  chemotaxis sensory transducer  36.66 
 
 		 752 aa  180  7e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.691552  normal  0.30416 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3778  chemotaxis sensory transducer, phytochrome sensor  35.4 
 
 		 1100 aa  180  9e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0750  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  32.41 
 
 		 539 aa  179  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.42 
 
 		 544 aa  179  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000143655  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0809  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.07 
 
 		 532 aa  179  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.826751  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.43 
 
 		 541 aa  178  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.76 
 
 		 532 aa  178  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0235494 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.58 
 
 		 544 aa  179  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.62 
 
 		 540 aa  177  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.92 
 
 		 661 aa  177  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4287  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.71 
 
 		 854 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.71 
 
 		 854 aa  177  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.28 
 
 		 549 aa  177  7e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3045  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.74 
 
 		 563 aa  177  7e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000317109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>