More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2726 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  35.71 
 
 		 1374 aa  781    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  34.78 
 
 		 1384 aa  693    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  32.22 
 
 		 1335 aa  644    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  33.12 
 
 		 1366 aa  683    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0559  histidine kinase  33.99 
 
 		 1327 aa  686    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00477073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  100 
 
 		 1355 aa  2794    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  34.29 
 
 		 1378 aa  785    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  35.54 
 
 		 1340 aa  778    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  35.56 
 
 		 1400 aa  779    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  32.82 
 
 		 1373 aa  669    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  46.58 
 
 		 1374 aa  1227    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  31.19 
 
 		 1378 aa  663    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  35.18 
 
 		 1397 aa  857    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  33.78 
 
 		 1334 aa  701    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  30.8 
 
 		 1342 aa  651    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  34.65 
 
 		 1324 aa  767    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  38.11 
 
 		 1370 aa  874    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  34.22 
 
 		 1278 aa  711    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  31.48 
 
 		 1418 aa  661    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  35.72 
 
 		 1388 aa  859    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  35.77 
 
 		 1363 aa  835    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  35.76 
 
 		 1306 aa  768    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  32.01 
 
 		 1347 aa  645    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2019  histidine kinase  34.82 
 
 		 1316 aa  714    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523526  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  36.45 
 
 		 1373 aa  782    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  32.34 
 
 		 1313 aa  635  1e-180  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  31.65 
 
 		 1404 aa  631  1e-179  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  31.55 
 
 		 1355 aa  611  1e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  30.59 
 
 		 1526 aa  601  1e-170  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  30.63 
 
 		 1344 aa  574  1.0000000000000001e-162  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  29.88 
 
 		 1343 aa  559  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  30.43 
 
 		 1349 aa  556  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  28.76 
 
 		 1311 aa  526  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0921  histidine kinase  31.29 
 
 		 1105 aa  518  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615746 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2723  histidine kinase  28.1 
 
 		 1347 aa  515  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1699  ATP-binding region, ATPase-like protein  26.27 
 
 		 1396 aa  499  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170141  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  27.44 
 
 		 1374 aa  481  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 1258 aa  477  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2318  histidine kinase  27.93 
 
 		 1298 aa  464  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1493  sensor histidine kinase/response regulator  30.25 
 
 		 1086 aa  464  1e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0890895  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1754  histidine kinase  27.78 
 
 		 1344 aa  460  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_105  histidine kinase CheY-like domain protein  30.35 
 
 		 1070 aa  456  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0275  histidine kinase  30.33 
 
 		 1070 aa  449  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  32.13 
 
 		 1407 aa  436  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  28.58 
 
 		 1093 aa  426  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1470  histidine kinase  26.07 
 
 		 1376 aa  422  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0500626  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1331  sensor histidine kinase/response regulator  30.08 
 
 		 1118 aa  421  1e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2607  GGDEF domain-containing protein  31.87 
 
 		 1054 aa  417  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202674  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  36.27 
 
 		 1366 aa  405  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1335  histidine kinase  28.73 
 
 		 1278 aa  365  3e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820531 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1562  histidine kinase  26.48 
 
 		 1296 aa  363  8e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.655639  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.1 
 
 		 1079 aa  360  9e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1604  two component transcriptional regulator, AraC family  38.99 
 
 		 904 aa  353  1e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3543  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.24 
 
 		 1498 aa  347  7e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.476146  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  25.65 
 
 		 1351 aa  343  1e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  24.86 
 
 		 1346 aa  333  2e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0755  GGDEF domain-containing protein  28.65 
 
 		 1053 aa  322  3.9999999999999996e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  33.95 
 
 		 934 aa  317  9.999999999999999e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4600  two component regulator propeller domain protein  27.66 
 
 		 1194 aa  314  9e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.779291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3199  two component transcriptional regulator, AraC family  35.2 
 
 		 940 aa  314  9e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157032  normal  0.236848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0448  histidine kinase  26.93 
 
 		 1114 aa  309  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_84  histidine kinase  25.61 
 
 		 1084 aa  308  6e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6047  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  35.61 
 
 		 677 aa  303  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  26.63 
 
 		 1024 aa  292  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4604  histidine kinase  34.21 
 
 		 663 aa  292  3e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 1341 aa  287  8e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3041  histidine kinase  23.03 
 
 		 1175 aa  286  1.0000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.551193  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4681  GGDEF domain-containing protein  28.21 
 
 		 1034 aa  278  4e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3354  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 		 1242 aa  268  4e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1905  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  34.97 
 
 		 668 aa  268  5.999999999999999e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0295515  normal  0.210974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1316  diguanylate cyclase  25.16 
 
 		 1004 aa  262  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.730261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  27.24 
 
 		 1414 aa  259  3e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4159  histidine kinase  24.08 
 
 		 1017 aa  257  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0934723  normal  0.139569 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5256  histidine kinase  25.74 
 
 		 1063 aa  256  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.015523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0993  ligand-binding sensor domain-containing protein  26.64 
 
 		 1250 aa  255  3e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3042  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  23.02 
 
 		 1181 aa  251  7e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.227036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3521  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 1237 aa  249  4e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01690  histidine kinase-response regulator hybrid protein  22.92 
 
 		 1191 aa  241  5.999999999999999e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0756  sensory box sensor histidine kinase/DNA-binding response regulator  30.85 
 
 		 993 aa  240  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 1711 aa  235  4.0000000000000004e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.19 
 
 		 1559 aa  235  4.0000000000000004e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.9 
 
 		 1385 aa  235  5e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1027  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.06 
 
 		 1276 aa  233  1e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.82 
 
 		 1390 aa  233  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 		 1390 aa  231  6e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 		 1390 aa  231  6e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  32.79 
 
 		 1202 aa  229  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2687  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 1013 aa  228  5.0000000000000005e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 1383 aa  228  5.0000000000000005e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1431 aa  228  5.0000000000000005e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0148  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 		 1048 aa  228  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 1002 aa  228  7e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 		 1131 aa  227  9e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 		 1383 aa  228  9e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0415  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.39 
 
 		 1486 aa  226  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 		 1370 aa  225  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0605  histidine kinase  21.17 
 
 		 1190 aa  224  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.18 
 
 		 1287 aa  222  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 1010 aa  221  7e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.412805  hitchhiker  0.00597184 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4411  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.79 
 
 		 1514 aa  221  7e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0203527 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>