More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1470 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1470  histidine kinase  100 
 
 		 1376 aa  2865    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0500626  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2723  histidine kinase  28.18 
 
 		 1347 aa  550  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  27.62 
 
 		 1418 aa  497  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  27.17 
 
 		 1397 aa  479  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  26.4 
 
 		 1384 aa  476  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  27.95 
 
 		 1374 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  27.04 
 
 		 1374 aa  458  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  27.51 
 
 		 1363 aa  457  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  26.73 
 
 		 1373 aa  459  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  26.65 
 
 		 1370 aa  457  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2019  histidine kinase  27.8 
 
 		 1316 aa  455  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523526  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  27.71 
 
 		 1373 aa  455  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  27.54 
 
 		 1388 aa  450  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  27.53 
 
 		 1340 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  26.29 
 
 		 1342 aa  441  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  26.07 
 
 		 1355 aa  437  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0559  histidine kinase  27.32 
 
 		 1327 aa  435  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00477073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  27.21 
 
 		 1378 aa  433  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  25.82 
 
 		 1335 aa  426  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  25.54 
 
 		 1400 aa  417  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  26.4 
 
 		 1347 aa  417  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  27.75 
 
 		 1404 aa  412  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  26.61 
 
 		 1349 aa  410  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  25.43 
 
 		 1378 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  25.42 
 
 		 1355 aa  403  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  25.4 
 
 		 1334 aa  393  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2318  histidine kinase  24.64 
 
 		 1298 aa  379  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  29.74 
 
 		 1343 aa  377  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1754  histidine kinase  26.04 
 
 		 1344 aa  372  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  25.11 
 
 		 1366 aa  372  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  25.78 
 
 		 1278 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  25.23 
 
 		 1306 aa  364  5.0000000000000005e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  25.37 
 
 		 1324 aa  363  2e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  25.22 
 
 		 1313 aa  361  6e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  28.96 
 
 		 1344 aa  334  6e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  27.85 
 
 		 1311 aa  325  4e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1699  ATP-binding region, ATPase-like protein  24.93 
 
 		 1396 aa  324  6e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170141  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  24.14 
 
 		 1374 aa  324  7e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  29.36 
 
 		 1366 aa  305  4.0000000000000003e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  24.71 
 
 		 1526 aa  305  5.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  32.75 
 
 		 934 aa  291  6e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  23.6 
 
 		 1414 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3199  two component transcriptional regulator, AraC family  28.86 
 
 		 940 aa  259  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157032  normal  0.236848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1604  two component transcriptional regulator, AraC family  30.43 
 
 		 904 aa  257  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1562  histidine kinase  25.54 
 
 		 1296 aa  256  2.0000000000000002e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.655639  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1797  DNA-binding response regulator/sensor histidine kinase  29.84 
 
 		 961 aa  254  1e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 1341 aa  253  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.11 
 
 		 1258 aa  243  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_105  histidine kinase CheY-like domain protein  22.32 
 
 		 1070 aa  240  1e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0275  histidine kinase  22.18 
 
 		 1070 aa  233  1e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0756  sensory box sensor histidine kinase/DNA-binding response regulator  29.56 
 
 		 993 aa  233  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  22.99 
 
 		 1407 aa  233  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4604  histidine kinase  28.92 
 
 		 663 aa  228  9e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0921  histidine kinase  24.46 
 
 		 1105 aa  227  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615746 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  23.08 
 
 		 1093 aa  225  4e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1493  sensor histidine kinase/response regulator  22.79 
 
 		 1086 aa  218  5e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0890895  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  26.95 
 
 		 1152 aa  216  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.37 
 
 		 1431 aa  214  7.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 		 1118 aa  212  5e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000390432  normal  0.0407868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 1010 aa  211  7e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.412805  hitchhiker  0.00597184 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6047  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  29.03 
 
 		 677 aa  209  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 1131 aa  206  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  22.78 
 
 		 1346 aa  206  3e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.46 
 
 		 1415 aa  205  5e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.64 
 
 		 1559 aa  202  5e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0148  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 		 1048 aa  202  5e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 		 1385 aa  201  9e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.28 
 
 		 1711 aa  201  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  29.73 
 
 		 1427 aa  199  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.09 
 
 		 1426 aa  199  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  29.45 
 
 		 1202 aa  198  7e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.39 
 
 		 1140 aa  197  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 		 1383 aa  197  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2687  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 		 1013 aa  196  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  28.08 
 
 		 876 aa  196  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1331  sensor histidine kinase/response regulator  21.99 
 
 		 1118 aa  194  7e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 		 1383 aa  194  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.19 
 
 		 1651 aa  193  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  31.61 
 
 		 1172 aa  193  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 		 1153 aa  193  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359014  hitchhiker  0.0000017622 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.6 
 
 		 1390 aa  192  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.98 
 
 		 1002 aa  192  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.6 
 
 		 1390 aa  192  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.6 
 
 		 1390 aa  192  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 1003 aa  192  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1905  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  27.82 
 
 		 668 aa  191  7e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0295515  normal  0.210974 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.74 
 
 		 1406 aa  191  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4814  histidine kinase  26.81 
 
 		 919 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00150972  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.9 
 
 		 1361 aa  186  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4608  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 		 1645 aa  185  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.284957  normal  0.407853 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 		 1370 aa  184  8.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4411  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.54 
 
 		 1514 aa  183  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0203527 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  29.55 
 
 		 1156 aa  182  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4349  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.11 
 
 		 1514 aa  181  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.18 
 
 		 1287 aa  181  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  27.11 
 
 		 1299 aa  179  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 		 978 aa  178  7e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149383  normal  0.186346 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.08 
 
 		 1631 aa  178  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.1 
 
 		 1248 aa  176  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3543  Hpt sensor hybrid histidine kinase  23.2 
 
 		 1498 aa  174  7.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.476146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>