More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3141 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0148  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  49.2 
 
 		 1048 aa  666    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  49.36 
 
 		 1152 aa  696    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  54.45 
 
 		 1299 aa  805    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.87 
 
 		 1383 aa  697    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4349  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  48.85 
 
 		 1514 aa  707    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.62 
 
 		 1431 aa  786    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.41 
 
 		 1646 aa  774    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  40.79 
 
 		 1202 aa  758    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4411  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  48.72 
 
 		 1514 aa  706    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0203527 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.71 
 
 		 1711 aa  744    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  49.48 
 
 		 1002 aa  715    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.89 
 
 		 1426 aa  863    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  47.7 
 
 		 1010 aa  706    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.412805  hitchhiker  0.00597184 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.58 
 
 		 1003 aa  639    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  52.55 
 
 		 1651 aa  783    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 1406 aa  2808    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.39 
 
 		 1118 aa  685    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000390432  normal  0.0407868 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  56.82 
 
 		 1427 aa  804    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.02 
 
 		 1131 aa  649    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.99 
 
 		 1140 aa  714    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.54 
 
 		 1390 aa  692    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.39 
 
 		 1559 aa  692    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.33 
 
 		 1415 aa  890    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.54 
 
 		 1390 aa  692    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.08 
 
 		 1385 aa  678    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.62 
 
 		 1631 aa  759    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.54 
 
 		 1390 aa  692    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.48 
 
 		 1361 aa  690    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.8 
 
 		 1370 aa  636  1e-180  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.63 
 
 		 1248 aa  632  1e-179  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.65 
 
 		 1287 aa  626  1e-178  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2687  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.22 
 
 		 1013 aa  602  1e-170  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.67 
 
 		 1153 aa  598  1e-169  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359014  hitchhiker  0.0000017622 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.58 
 
 		 1383 aa  592  1e-167  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4814  histidine kinase  44.35 
 
 		 919 aa  535  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00150972  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.92 
 
 		 1051 aa  521  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4608  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.71 
 
 		 1645 aa  423  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.284957  normal  0.407853 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1295  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.07 
 
 		 1223 aa  404  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0981526  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1490  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.9 
 
 		 835 aa  383  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02350  protein-histidine kinase, putative  32.03 
 
 		 1614 aa  379  1e-103  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.16806  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.12 
 
 		 776 aa  370  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.103963 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5296  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.2 
 
 		 776 aa  369  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02240  protein-histidine kinase, putative  35.55 
 
 		 1816 aa  367  1e-99  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0091  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.74 
 
 		 930 aa  355  2e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00954137  normal  0.993222 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3275  PAS sensor protein  38.71 
 
 		 1015 aa  349  2e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.991698  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2246  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.11 
 
 		 1084 aa  346  2e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.692403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  45.29 
 
 		 1218 aa  341  5e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1400  PAS sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 		 938 aa  340  9.999999999999999e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2484  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.81 
 
 		 761 aa  332  3e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.55775  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2995  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.07 
 
 		 1002 aa  332  3e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175208  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 		 1297 aa  331  7e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.62 
 
 		 761 aa  329  3e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.170014  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.81 
 
 		 659 aa  328  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.47344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.66 
 
 		 1331 aa  326  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4198  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.31 
 
 		 1185 aa  318  5e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.996958 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0134  histidine kinase  47.18 
 
 		 547 aa  317  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2207  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.22 
 
 		 866 aa  315  3.9999999999999997e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2241  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.91 
 
 		 657 aa  311  6.999999999999999e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.23 
 
 		 1501 aa  308  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5239  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.21 
 
 		 869 aa  304  7.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0570546 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.49 
 
 		 664 aa  299  3e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2417  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.18 
 
 		 1535 aa  298  7e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.117494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0539  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.34 
 
 		 816 aa  296  2e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.9 
 
 		 657 aa  295  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.21 
 
 		 1478 aa  293  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4783  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 		 680 aa  293  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.302794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.41 
 
 		 708 aa  292  3e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.95 
 
 		 1808 aa  291  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5081  PAS  37 
 
 		 659 aa  291  5.0000000000000004e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.803763  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1658  histidine kinase  45.5 
 
 		 518 aa  290  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.84 
 
 		 1068 aa  286  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0640729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1750  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.59 
 
 		 660 aa  286  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4639  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.9 
 
 		 1453 aa  284  1e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  39.64 
 
 		 1172 aa  283  2e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0372  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  44.75 
 
 		 1233 aa  281  4e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.63 
 
 		 1261 aa  280  1e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  40.05 
 
 		 1180 aa  280  2e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  40.46 
 
 		 1156 aa  279  3e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2356  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.85 
 
 		 764 aa  278  4e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.736998  normal  0.0891785 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.93 
 
 		 639 aa  277  9e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6593  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.58 
 
 		 906 aa  275  3e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.3 
 
 		 1088 aa  275  6e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1492  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.51 
 
 		 606 aa  275  7e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216645  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2005  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.15 
 
 		 522 aa  274  8.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5434  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.95 
 
 		 539 aa  273  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489177  normal  0.0484799 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5679  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.33 
 
 		 845 aa  273  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.304618  normal  0.613324 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.23 
 
 		 623 aa  272  4e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.850341 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.92 
 
 		 530 aa  271  7e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.766371  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03078  sensor histidine kinase  35.21 
 
 		 678 aa  270  1e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.53 
 
 		 529 aa  270  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.17892 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  35.43 
 
 		 1366 aa  268  4e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1391  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.53 
 
 		 526 aa  268  5e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.444347  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1671  histidine kinase  45.97 
 
 		 755 aa  268  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1597  histidine kinase  44.08 
 
 		 537 aa  267  8e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0756537 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.67 
 
 		 696 aa  267  8.999999999999999e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.125145  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6439  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.53 
 
 		 776 aa  267  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4054  histidine kinase  42.72 
 
 		 551 aa  266  2e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2317  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.89 
 
 		 657 aa  266  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.553373  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.75 
 
 		 760 aa  266  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762207 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1685  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.27 
 
 		 844 aa  266  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>