More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6439 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_5434  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  77.92 
 
 
539 aa  812    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489177  normal  0.0484799 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6406  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  76.79 
 
 
528 aa  791    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0853653  normal  0.114934 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  94.33 
 
 
529 aa  968    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.17892 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1391  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
526 aa  1060    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.444347  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  76.79 
 
 
528 aa  793    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568926  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6439  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
776 aa  1542    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249109  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  63.08 
 
 
530 aa  629  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.766371  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5085  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  64.41 
 
 
530 aa  625  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.92 
 
 
657 aa  478  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435635  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2241  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.71 
 
 
657 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.89 
 
 
639 aa  457  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5679  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.15 
 
 
845 aa  421  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.304618  normal  0.613324 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0717  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.74 
 
 
641 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2246  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.42 
 
 
1084 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.692403 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.53 
 
 
776 aa  296  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.103963 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1400  PAS sensor signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 
938 aa  286  1.0000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5296  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.53 
 
 
776 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.2 
 
 
652 aa  283  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.950985 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3143  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.8 
 
 
652 aa  281  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.417887  normal  0.0487579 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2417  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.31 
 
 
1535 aa  278  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.117494  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4915  PAS  35.38 
 
 
1384 aa  277  6e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6399  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.12 
 
 
1361 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2129  sensory box histidine kinase/response regulator  36.63 
 
 
746 aa  275  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.706377  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3018  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.2 
 
 
1371 aa  273  6e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.980757 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.46 
 
 
1287 aa  272  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1939  PAS  34.87 
 
 
779 aa  268  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.627435  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1295  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.8 
 
 
1223 aa  269  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0981526  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.98 
 
 
1261 aa  268  4e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1703  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.01 
 
 
1408 aa  267  5e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433463  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3193  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.83 
 
 
1380 aa  266  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112764 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5383  Signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 
784 aa  265  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.626951  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2207  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 
866 aa  263  8.999999999999999e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5239  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.71 
 
 
869 aa  261  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0570546 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1658  histidine kinase  40.68 
 
 
518 aa  256  8e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.2 
 
 
664 aa  255  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 
1406 aa  254  5.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0091  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.47 
 
 
930 aa  252  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00954137  normal  0.993222 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.37 
 
 
1088 aa  253  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1750  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.32 
 
 
660 aa  252  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0134  histidine kinase  40.31 
 
 
547 aa  252  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0539  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.16 
 
 
816 aa  251  4e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146269  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05296  Two-component system protein A (EC 2.7.13.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9P896]  32.51 
 
 
682 aa  250  8e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1685  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.87 
 
 
844 aa  248  4e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1520  signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  33.4 
 
 
1303 aa  247  8e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124967  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1490  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.75 
 
 
835 aa  246  9.999999999999999e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.63 
 
 
760 aa  245  3e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762207 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2356  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.6 
 
 
764 aa  244  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.736998  normal  0.0891785 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5252  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  36.02 
 
 
1698 aa  243  9e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  37.14 
 
 
1218 aa  242  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1671  histidine kinase  40 
 
 
755 aa  240  9e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408129  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4184  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.61 
 
 
783 aa  239  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1756  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.73 
 
 
844 aa  239  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0521  multi sensor hybrid histidine kinase  33.66 
 
 
1344 aa  239  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6537  histidine kinase  39.74 
 
 
742 aa  236  8e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2484  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.98 
 
 
761 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.55775  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.18 
 
 
761 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.170014  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7014  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.08 
 
 
781 aa  234  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5081  PAS  36.1 
 
 
659 aa  234  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.803763  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.49 
 
 
730 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.996582  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4198  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.32 
 
 
1185 aa  234  4.0000000000000004e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.996958 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4054  histidine kinase  40.63 
 
 
551 aa  234  5e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.02 
 
 
1331 aa  234  5e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  38.03 
 
 
1152 aa  233  9e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3122  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.39 
 
 
540 aa  232  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.340394  normal  0.912648 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1601  CheB methylesterase, CheR methyltransferase, hybrid histidine kinase  31.61 
 
 
1222 aa  232  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.472526  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.38 
 
 
1348 aa  232  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3275  PAS sensor protein  33.63 
 
 
1015 aa  232  2e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.991698  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1404  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.3 
 
 
1759 aa  231  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1531  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 
643 aa  231  3e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.963114 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.04 
 
 
659 aa  231  4e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.47344  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3072  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.1 
 
 
689 aa  229  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0145505 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0072  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
568 aa  229  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516402 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1375  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.61 
 
 
768 aa  229  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.397027  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6615  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.73 
 
 
660 aa  228  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0224174  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6454  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.61 
 
 
768 aa  229  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3772  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.88 
 
 
934 aa  228  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6593  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.47 
 
 
906 aa  228  4e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2956  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  44 
 
 
752 aa  227  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.660632  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.71 
 
 
662 aa  227  6e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3591  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.3 
 
 
650 aa  226  1e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.81 
 
 
623 aa  226  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.850341 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6046  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.52 
 
 
768 aa  225  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479069  normal  0.26296 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4639  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.19 
 
 
1453 aa  224  4.9999999999999996e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432269  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.2 
 
 
651 aa  224  4.9999999999999996e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326262  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00897  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:Histidine kinase A, N-terminal  31.52 
 
 
884 aa  223  7e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.717501  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3362  PAS sensor protein  33.88 
 
 
678 aa  223  9e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2075  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  37.53 
 
 
572 aa  221  5e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3125  putative sensor/response regulator hybrid  34.51 
 
 
650 aa  220  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.70953  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.52 
 
 
789 aa  220  8.999999999999998e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163342  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4534  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.52 
 
 
789 aa  220  8.999999999999998e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00178045  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4167  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.92 
 
 
592 aa  219  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4749  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.46 
 
 
781 aa  219  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.872225  normal  0.641352 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2013  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.73 
 
 
569 aa  219  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00655857 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2490  histidine kinase  38.36 
 
 
554 aa  219  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3151  histidine kinase  43.68 
 
 
741 aa  219  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.105074  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.89 
 
 
1297 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6946  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.54 
 
 
789 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1716  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.27 
 
 
628 aa  218  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805197  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3043  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.29 
 
 
738 aa  218  4e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0109423  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3488  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 
508 aa  218  4e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>