More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3122 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3122  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
540 aa  1072    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.340394  normal  0.912648 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5296  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.98 
 
 
776 aa  259  7e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1400  PAS sensor signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 
938 aa  259  8e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2207  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.01 
 
 
866 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1520  signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  41.5 
 
 
1303 aa  254  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124967  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.15 
 
 
776 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.103963 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0521  multi sensor hybrid histidine kinase  39.9 
 
 
1344 aa  249  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1295  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.92 
 
 
1223 aa  246  9e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0981526  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.58 
 
 
760 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762207 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.39 
 
 
1287 aa  240  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1671  histidine kinase  42.37 
 
 
755 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408129  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1601  CheB methylesterase, CheR methyltransferase, hybrid histidine kinase  36.15 
 
 
1222 aa  238  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.472526  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.42 
 
 
1297 aa  237  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2956  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  45.58 
 
 
752 aa  236  6e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.660632  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1750  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.18 
 
 
660 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1490  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.56 
 
 
835 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.61 
 
 
1261 aa  231  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.49 
 
 
730 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.996582  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6537  histidine kinase  40.83 
 
 
742 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0091  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.87 
 
 
930 aa  230  4e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00954137  normal  0.993222 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5239  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.32 
 
 
869 aa  229  7e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0570546 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  36.8 
 
 
1152 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0539  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.44 
 
 
816 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146269  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0134  histidine kinase  38.62 
 
 
547 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.07 
 
 
1331 aa  226  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3043  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.98 
 
 
738 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0109423  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2995  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.25 
 
 
1002 aa  225  2e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175208  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0072  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.82 
 
 
568 aa  225  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516402 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.37 
 
 
528 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568926  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  37.7 
 
 
1218 aa  224  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.93 
 
 
623 aa  224  4e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.850341 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3151  histidine kinase  44.03 
 
 
741 aa  223  7e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.105074  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.47 
 
 
720 aa  223  8e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1458  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.29 
 
 
585 aa  223  8e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1658  histidine kinase  40.1 
 
 
518 aa  223  8e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6406  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.1 
 
 
528 aa  223  9e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0853653  normal  0.114934 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5679  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.4 
 
 
845 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.304618  normal  0.613324 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3772  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 
934 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0397  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.15 
 
 
755 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.33 
 
 
1501 aa  221  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1391  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.66 
 
 
526 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.444347  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4928  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.23 
 
 
889 aa  220  5e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3275  PAS sensor protein  31.54 
 
 
1015 aa  220  5e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.991698  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2075  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  38.62 
 
 
572 aa  219  7e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3467  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.62 
 
 
865 aa  219  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.48 
 
 
1088 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.69 
 
 
529 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.17892 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6439  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.66 
 
 
776 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249109  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2246  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.94 
 
 
1084 aa  217  4e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.692403 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.23 
 
 
1406 aa  217  5e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2490  histidine kinase  38.04 
 
 
554 aa  216  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.56 
 
 
1808 aa  216  7e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1870  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.98 
 
 
657 aa  216  8e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240453  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00897  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:Histidine kinase A, N-terminal  35.42 
 
 
884 aa  215  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.717501  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.55 
 
 
1348 aa  216  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.5 
 
 
708 aa  215  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1492  histidine kinase  41.01 
 
 
519 aa  216  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.416072 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2241  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.44 
 
 
657 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2317  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.3 
 
 
657 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.553373  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0717  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.61 
 
 
641 aa  215  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5434  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.67 
 
 
539 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489177  normal  0.0484799 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34 
 
 
955 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2013  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.68 
 
 
569 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00655857 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3795  histidine kinase  39.47 
 
 
725 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.421724 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 
639 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1191  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.52 
 
 
697 aa  213  7.999999999999999e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.604254  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4054  histidine kinase  43.14 
 
 
551 aa  213  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4198  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.24 
 
 
1185 aa  212  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.996958 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 
1548 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5081  PAS  37.34 
 
 
659 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.803763  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.53 
 
 
530 aa  211  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.766371  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6593  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.6 
 
 
906 aa  211  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.5 
 
 
696 aa  209  7e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.125145  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5978  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 
656 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.410257  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3427  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  38.83 
 
 
2031 aa  209  7e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0889636 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0372  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  41.94 
 
 
1233 aa  209  8e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.7 
 
 
664 aa  209  9e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3990  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 
666 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5085  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.33 
 
 
530 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4377  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 
666 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2417  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  38.4 
 
 
1535 aa  209  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.117494  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.41 
 
 
1431 aa  208  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4783  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.08 
 
 
680 aa  208  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.302794  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5775  histidine kinase  38.56 
 
 
554 aa  208  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.941039 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2376  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.43 
 
 
1407 aa  208  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1685  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.89 
 
 
844 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4406  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 
653 aa  207  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3270  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.32 
 
 
796 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.498059 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2771  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.16 
 
 
1557 aa  206  6e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4915  PAS  36.59 
 
 
1384 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1664  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.06 
 
 
633 aa  206  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0956689  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4616  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.05 
 
 
701 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1737  histidine kinase  41.78 
 
 
633 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.181813  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4167  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.84 
 
 
592 aa  205  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0362  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.52 
 
 
1184 aa  204  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.656273  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4310  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 
631 aa  204  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.917762  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1797  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.46 
 
 
1419 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4200  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 
678 aa  204  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.679083  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2210  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.9 
 
 
633 aa  204  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00664902  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5630  histidine kinase  40.46 
 
 
714 aa  200  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.11737 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>