More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0134 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0134  histidine kinase  100 
 
 
547 aa  1095    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  41.94 
 
 
1152 aa  359  9e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.73 
 
 
1287 aa  358  1.9999999999999998e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2207  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.37 
 
 
866 aa  353  4e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.09 
 
 
776 aa  344  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.103963 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5296  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.66 
 
 
776 aa  335  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1295  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.68 
 
 
1223 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0981526  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5081  PAS  46.25 
 
 
659 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.803763  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.02 
 
 
1261 aa  323  3e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1400  PAS sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
938 aa  323  4e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3275  PAS sensor protein  39.74 
 
 
1015 aa  316  9e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.991698  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0372  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  48.33 
 
 
1233 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.61 
 
 
664 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1658  histidine kinase  42.99 
 
 
518 aa  309  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1520  signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  43 
 
 
1303 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124967  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.34 
 
 
760 aa  301  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762207 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1685  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.87 
 
 
844 aa  300  4e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0091  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.51 
 
 
930 aa  300  5e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00954137  normal  0.993222 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1490  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.93 
 
 
835 aa  299  1e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1671  histidine kinase  46.2 
 
 
755 aa  299  1e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408129  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0521  multi sensor hybrid histidine kinase  41.79 
 
 
1344 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5239  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.58 
 
 
869 aa  296  7e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0570546 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2241  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.33 
 
 
657 aa  296  7e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.48 
 
 
659 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.47344  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4198  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.91 
 
 
1185 aa  295  1e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.996958 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  43.19 
 
 
1218 aa  295  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1601  CheB methylesterase, CheR methyltransferase, hybrid histidine kinase  41.18 
 
 
1222 aa  294  2e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.472526  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5975  histidine kinase  45.12 
 
 
524 aa  295  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.005421  normal  0.414836 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0717  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.03 
 
 
641 aa  295  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2356  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.1 
 
 
764 aa  294  3e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.736998  normal  0.0891785 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2246  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.15 
 
 
1084 aa  294  3e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.692403 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4054  histidine kinase  46.82 
 
 
551 aa  293  5e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1756  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.94 
 
 
844 aa  292  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.95 
 
 
1088 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2210  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  47.72 
 
 
633 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00664902  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3377  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  45.59 
 
 
1242 aa  290  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1597  histidine kinase  44.5 
 
 
537 aa  290  6e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0756537 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1750  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.61 
 
 
660 aa  290  6e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.44 
 
 
730 aa  289  7e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.996582  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.41 
 
 
1406 aa  288  2e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5630  histidine kinase  46.52 
 
 
714 aa  288  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.11737 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6537  histidine kinase  44.18 
 
 
742 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0539  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.82 
 
 
816 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146269  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2956  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  46.13 
 
 
752 aa  282  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.660632  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3183  signal transduction histidine kinase  43.8 
 
 
1279 aa  282  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2490  histidine kinase  41.37 
 
 
554 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2484  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.33 
 
 
761 aa  280  5e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.55775  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2075  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  34.68 
 
 
572 aa  280  7e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1737  histidine kinase  47.21 
 
 
633 aa  280  7e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.181813  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1664  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  47.72 
 
 
633 aa  280  7e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0956689  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2417  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  43.12 
 
 
1535 aa  279  9e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.117494  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2942  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  45.29 
 
 
702 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897088  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3043  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  46.2 
 
 
738 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0109423  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5679  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.4 
 
 
845 aa  277  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.304618  normal  0.613324 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3151  histidine kinase  45.92 
 
 
741 aa  276  6e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.105074  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1404  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  41.69 
 
 
1759 aa  275  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4167  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.12 
 
 
592 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.65 
 
 
761 aa  273  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.170014  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.52 
 
 
623 aa  272  1e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.850341 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0397  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.27 
 
 
755 aa  269  8.999999999999999e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0072  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.98 
 
 
568 aa  267  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516402 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.47 
 
 
639 aa  265  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3028  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.95 
 
 
702 aa  265  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.337956  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.54 
 
 
657 aa  264  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435635  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2013  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.05 
 
 
569 aa  264  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00655857 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5434  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.42 
 
 
539 aa  264  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489177  normal  0.0484799 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1492  histidine kinase  39.86 
 
 
519 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.416072 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2005  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.84 
 
 
522 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3135  histidine kinase  44.23 
 
 
512 aa  261  3e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0645839  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6593  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.4 
 
 
906 aa  259  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3029  histidine kinase  40.76 
 
 
512 aa  259  1e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3134  histidine kinase  44.44 
 
 
702 aa  257  5e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.22778  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00897  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:Histidine kinase A, N-terminal  35.26 
 
 
884 aa  256  6e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.717501  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.23 
 
 
530 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.766371  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0027  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.04 
 
 
917 aa  253  8.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5252  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  42.67 
 
 
1698 aa  253  8.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5085  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.48 
 
 
530 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2943  histidine kinase  45.67 
 
 
512 aa  250  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.779732  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1391  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.36 
 
 
526 aa  249  8e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.444347  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5171  histidine kinase  39.48 
 
 
584 aa  248  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.944283 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6439  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.36 
 
 
776 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249109  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0241  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  39.32 
 
 
582 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.7 
 
 
529 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.17892 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4639  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  37.34 
 
 
1453 aa  245  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432269  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4928  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.19 
 
 
889 aa  241  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5775  histidine kinase  37.76 
 
 
554 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.941039 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3427  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  40.2 
 
 
2031 aa  240  5e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0889636 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6406  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.57 
 
 
528 aa  239  8e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0853653  normal  0.114934 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.84 
 
 
528 aa  239  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568926  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.62 
 
 
652 aa  236  7e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.950985 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.05 
 
 
1297 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3767  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 
587 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634012  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3278  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  40.36 
 
 
2468 aa  231  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0267066 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3143  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.63 
 
 
652 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.417887  normal  0.0487579 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9098  bacteriophytochrome protein  37.89 
 
 
378 aa  231  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.384054  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3122  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.25 
 
 
540 aa  229  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.340394  normal  0.912648 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.05 
 
 
955 aa  226  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0992  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.73 
 
 
663 aa  226  8e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374279  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.59 
 
 
1478 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.48 
 
 
1331 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>