More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3134 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3028  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  96.01 
 
 
702 aa  1109    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.337956  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3134  histidine kinase  100 
 
 
702 aa  1347    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.22778  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2942  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  92.17 
 
 
702 aa  1108    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897088  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1597  histidine kinase  51.33 
 
 
537 aa  359  9e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0756537 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  56.35 
 
 
623 aa  357  5.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.850341 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.58 
 
 
664 aa  343  4e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2356  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  55.12 
 
 
764 aa  342  1e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.736998  normal  0.0891785 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1685  multi-sensor hybrid histidine kinase  53.5 
 
 
844 aa  342  2e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0372  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  55.41 
 
 
1233 aa  340  5.9999999999999996e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4054  histidine kinase  55.35 
 
 
551 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.07 
 
 
659 aa  335  2e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.47344  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2484  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  53.53 
 
 
761 aa  332  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.55775  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.92 
 
 
1088 aa  330  6e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1756  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.27 
 
 
844 aa  329  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  53.55 
 
 
761 aa  325  2e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.170014  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3377  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  52.21 
 
 
1242 aa  322  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1737  histidine kinase  53.63 
 
 
633 aa  321  3e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.181813  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2005  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.49 
 
 
522 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2210  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  52.07 
 
 
633 aa  318  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00664902  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3183  signal transduction histidine kinase  53.31 
 
 
1279 aa  316  8e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0134  histidine kinase  44.44 
 
 
547 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1664  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  53.37 
 
 
633 aa  314  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0956689  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1400  PAS sensor signal transduction histidine kinase  40.85 
 
 
938 aa  301  2e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.65 
 
 
776 aa  300  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.103963 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2207  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.5 
 
 
866 aa  300  8e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.53 
 
 
1261 aa  295  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  45 
 
 
1287 aa  295  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3278  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  47.64 
 
 
2468 aa  294  4e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0267066 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  44.59 
 
 
1152 aa  289  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5296  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.17 
 
 
776 aa  289  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1520  signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  43.9 
 
 
1303 aa  286  8e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124967  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0539  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.24 
 
 
816 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146269  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0027  multi-sensor hybrid histidine kinase  54.46 
 
 
917 aa  282  1e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0521  multi sensor hybrid histidine kinase  41.71 
 
 
1344 aa  278  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2246  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.54 
 
 
1084 aa  278  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.692403 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5081  PAS  42.08 
 
 
659 aa  278  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.803763  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  43.48 
 
 
1218 aa  278  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3275  PAS sensor protein  39.08 
 
 
1015 aa  277  5e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.991698  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6537  histidine kinase  44.59 
 
 
742 aa  277  5e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0717  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.32 
 
 
641 aa  276  9e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.33 
 
 
730 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.996582  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0091  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.01 
 
 
930 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00954137  normal  0.993222 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2956  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  48.58 
 
 
752 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.660632  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1601  CheB methylesterase, CheR methyltransferase, hybrid histidine kinase  40.37 
 
 
1222 aa  273  6e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.472526  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1671  histidine kinase  49.86 
 
 
755 aa  273  1e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408129  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1295  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.54 
 
 
1223 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0981526  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5239  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.58 
 
 
869 aa  270  5e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0570546 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1404  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  43.21 
 
 
1759 aa  270  5.9999999999999995e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3151  histidine kinase  48.65 
 
 
741 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.105074  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1658  histidine kinase  43.08 
 
 
518 aa  268  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.68 
 
 
760 aa  269  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762207 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1490  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.3 
 
 
835 aa  267  5.999999999999999e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3043  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  47.86 
 
 
738 aa  266  8e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0109423  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5252  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  43.58 
 
 
1698 aa  266  8.999999999999999e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0072  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.49 
 
 
568 aa  261  5.0000000000000005e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516402 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4167  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.68 
 
 
592 aa  260  6e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2241  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.82 
 
 
657 aa  259  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5975  histidine kinase  43.5 
 
 
524 aa  259  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.005421  normal  0.414836 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5630  histidine kinase  45.45 
 
 
714 aa  259  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.11737 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.48 
 
 
1406 aa  257  5e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1750  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.4 
 
 
660 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0397  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.23 
 
 
755 aa  253  7e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4198  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.11 
 
 
1185 aa  251  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.996958 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1492  histidine kinase  44.74 
 
 
519 aa  250  5e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.416072 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.42 
 
 
529 aa  249  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.17892 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.11 
 
 
639 aa  248  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5434  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.13 
 
 
539 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489177  normal  0.0484799 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00897  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:Histidine kinase A, N-terminal  34.13 
 
 
884 aa  246  9.999999999999999e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.717501  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3029  histidine kinase  46.76 
 
 
512 aa  244  3e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2013  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.56 
 
 
569 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00655857 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1391  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.58 
 
 
526 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.444347  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6593  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.44 
 
 
906 aa  244  3.9999999999999997e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0667  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.16 
 
 
703 aa  243  7.999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.85 
 
 
528 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568926  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6439  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.58 
 
 
776 aa  243  9e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249109  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6406  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.85 
 
 
528 aa  243  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0853653  normal  0.114934 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.49 
 
 
1965 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3767  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 
587 aa  240  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634012  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4639  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.98 
 
 
1453 aa  240  6.999999999999999e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432269  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.19 
 
 
530 aa  239  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.766371  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3135  histidine kinase  47.04 
 
 
512 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0645839  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2075  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  37.31 
 
 
572 aa  236  1.0000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.13 
 
 
1331 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2490  histidine kinase  36.89 
 
 
554 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5085  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 
530 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3427  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  41.18 
 
 
2031 aa  233  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0889636 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.5 
 
 
1431 aa  231  3e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6399  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  39.53 
 
 
1361 aa  231  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4928  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.15 
 
 
889 aa  231  5e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.49 
 
 
1478 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3467  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.38 
 
 
865 aa  228  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2317  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 
657 aa  228  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.553373  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5171  histidine kinase  40.54 
 
 
584 aa  228  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.944283 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.83 
 
 
657 aa  228  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435635  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4915  PAS  41.29 
 
 
1384 aa  227  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3072  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.3 
 
 
689 aa  227  6e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0145505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
955 aa  226  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.15 
 
 
652 aa  226  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.950985 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2943  histidine kinase  47.08 
 
 
512 aa  225  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.779732  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.4 
 
 
708 aa  224  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>