More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2075 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2075  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
572 aa  1138    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.28 
 
 
776 aa  326  6e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.103963 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3767  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  35.68 
 
 
587 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634012  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5296  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.31 
 
 
776 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0134  histidine kinase  36.89 
 
 
547 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3275  PAS sensor protein  42.82 
 
 
1015 aa  304  3.0000000000000004e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.991698  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9098  bacteriophytochrome protein  41.63 
 
 
378 aa  298  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.384054  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2207  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.25 
 
 
866 aa  296  8e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1490  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.42 
 
 
835 aa  290  3e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5356  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.55 
 
 
377 aa  289  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.940445 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.29 
 
 
1287 aa  288  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0539  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.75 
 
 
816 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146269  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1295  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.73 
 
 
1223 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0981526  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1520  signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  41.75 
 
 
1303 aa  282  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124967  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  35.84 
 
 
1152 aa  281  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1671  histidine kinase  44.74 
 
 
755 aa  279  9e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408129  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2241  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.35 
 
 
657 aa  278  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2956  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  45.68 
 
 
752 aa  276  8e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.660632  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3151  histidine kinase  45.95 
 
 
741 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.105074  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0521  multi sensor hybrid histidine kinase  39.95 
 
 
1344 aa  272  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3043  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  46.49 
 
 
738 aa  272  1e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0109423  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.9 
 
 
1261 aa  271  2.9999999999999997e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.44 
 
 
1406 aa  270  5.9999999999999995e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1750  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.6 
 
 
660 aa  270  8e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  32.19 
 
 
544 aa  268  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.39 
 
 
664 aa  264  3e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  41.15 
 
 
1218 aa  264  4e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1658  histidine kinase  41.37 
 
 
518 aa  264  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2246  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.49 
 
 
1084 aa  260  5.0000000000000005e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.692403 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4198  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.16 
 
 
1185 aa  257  4e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.996958 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5081  PAS  37.06 
 
 
659 aa  257  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.803763  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1492  histidine kinase  42.08 
 
 
519 aa  256  5e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.416072 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.01 
 
 
657 aa  256  8e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435635  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5239  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.74 
 
 
869 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0570546 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.82 
 
 
760 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762207 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5434  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.49 
 
 
539 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489177  normal  0.0484799 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6406  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.55 
 
 
528 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0853653  normal  0.114934 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.8 
 
 
528 aa  253  6e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568926  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0091  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.54 
 
 
930 aa  253  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00954137  normal  0.993222 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1685  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.56 
 
 
844 aa  251  3e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2356  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.2 
 
 
764 aa  250  5e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.736998  normal  0.0891785 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3029  histidine kinase  40.36 
 
 
512 aa  249  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.05 
 
 
730 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.996582  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6537  histidine kinase  39.43 
 
 
742 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0241  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  40.05 
 
 
582 aa  248  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1601  CheB methylesterase, CheR methyltransferase, hybrid histidine kinase  38.18 
 
 
1222 aa  246  6e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.472526  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3122  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.24 
 
 
540 aa  246  8e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.340394  normal  0.912648 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1400  PAS sensor signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 
938 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.94 
 
 
639 aa  244  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1756  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.38 
 
 
844 aa  244  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1404  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  38.65 
 
 
1759 aa  243  5e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4167  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.63 
 
 
592 aa  243  5e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.13 
 
 
623 aa  243  7e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.850341 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5252  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  37.84 
 
 
1698 aa  242  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3467  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.32 
 
 
865 aa  242  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.5 
 
 
1088 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  37.86 
 
 
1348 aa  240  4e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0397  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.69 
 
 
755 aa  240  5e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2005  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.18 
 
 
522 aa  239  9e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.56 
 
 
761 aa  239  1e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.170014  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4639  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  37.82 
 
 
1453 aa  238  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432269  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2484  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.31 
 
 
761 aa  238  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.55775  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.79 
 
 
1331 aa  237  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3135  histidine kinase  42.5 
 
 
512 aa  238  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0645839  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1797  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.95 
 
 
1419 aa  237  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5171  histidine kinase  38.5 
 
 
584 aa  236  9e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.944283 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1391  multi-sensor hybrid histidine kinase  38 
 
 
526 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.444347  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2210  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.21 
 
 
633 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00664902  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4807  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.78 
 
 
1287 aa  234  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00341781  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6439  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38 
 
 
776 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249109  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5679  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.19 
 
 
845 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.304618  normal  0.613324 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.11 
 
 
1965 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.06 
 
 
529 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.17892 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.66 
 
 
1478 aa  233  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.63 
 
 
708 aa  232  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.63 
 
 
1691 aa  231  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5775  histidine kinase  37.9 
 
 
554 aa  231  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.941039 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4054  histidine kinase  40.77 
 
 
551 aa  230  5e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0072  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.49 
 
 
568 aa  229  8e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516402 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00897  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:Histidine kinase A, N-terminal  32.47 
 
 
884 aa  229  8e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.717501  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1664  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.46 
 
 
633 aa  229  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0956689  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0314  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  34.58 
 
 
1399 aa  229  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.03 
 
 
1431 aa  229  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4928  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 
889 aa  229  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.56 
 
 
530 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.766371  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1900  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.8 
 
 
1057 aa  229  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.053752 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2490  histidine kinase  35.19 
 
 
554 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1737  histidine kinase  40.21 
 
 
633 aa  228  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.181813  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0717  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.74 
 
 
641 aa  226  6e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1597  histidine kinase  38.56 
 
 
537 aa  226  6e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0756537 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2590  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 
405 aa  226  9e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.413696 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2013  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.19 
 
 
569 aa  226  9e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00655857 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1716  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.89 
 
 
628 aa  226  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805197  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2771  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.41 
 
 
1557 aa  226  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5085  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.8 
 
 
530 aa  226  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4406  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.18 
 
 
653 aa  225  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.68 
 
 
659 aa  225  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.47344  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0372  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  39.9 
 
 
1233 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.24 
 
 
1501 aa  224  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2802  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 
406 aa  224  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>