More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4608 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  52.77 
 
 		 1002 aa  726    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4608  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 1645 aa  3368    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.284957  normal  0.407853 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  46.72 
 
 		 1152 aa  566  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  55.94 
 
 		 1431 aa  540  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0148  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.41 
 
 		 1048 aa  514  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  57.46 
 
 		 1383 aa  493  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  57.61 
 
 		 1202 aa  488  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 1003 aa  486  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4349  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  52.4 
 
 		 1514 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4411  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  52.4 
 
 		 1514 aa  479  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0203527 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 		 1010 aa  476  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.412805  hitchhiker  0.00597184 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.84 
 
 		 1426 aa  475  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  53.54 
 
 		 1427 aa  473  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  53.65 
 
 		 1299 aa  473  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.54 
 
 		 1390 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.86 
 
 		 1140 aa  468  9.999999999999999e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  53.76 
 
 		 1415 aa  465  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.87 
 
 		 1390 aa  466  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.87 
 
 		 1390 aa  466  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.98 
 
 		 1711 aa  459  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2687  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.44 
 
 		 1013 aa  453  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  54.38 
 
 		 1287 aa  442  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.42 
 
 		 1406 aa  434  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.3 
 
 		 1383 aa  437  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2138  putative PAS/PAC sensor protein  39.23 
 
 		 849 aa  432  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.906633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.21 
 
 		 1385 aa  431  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.6 
 
 		 1248 aa  429  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.8 
 
 		 1559 aa  428  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.41 
 
 		 1361 aa  427  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.88 
 
 		 1131 aa  422  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.21 
 
 		 1646 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.89 
 
 		 1153 aa  420  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359014  hitchhiker  0.0000017622 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.37 
 
 		 1631 aa  416  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.08 
 
 		 1370 aa  416  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  46.48 
 
 		 1651 aa  413  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  49 
 
 		 1051 aa  413  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.95 
 
 		 1331 aa  403  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4814  histidine kinase  49.67 
 
 		 919 aa  385  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00150972  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.77 
 
 		 1118 aa  373  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000390432  normal  0.0407868 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.43 
 
 		 1261 aa  358  3.9999999999999996e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  38.18 
 
 		 1156 aa  283  3e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  38.41 
 
 		 1180 aa  281  6e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02240  protein-histidine kinase, putative  35.22 
 
 		 1816 aa  280  2e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  35.6 
 
 		 1366 aa  269  2.9999999999999995e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  37.23 
 
 		 1343 aa  267  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  36.8 
 
 		 1172 aa  264  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02350  protein-histidine kinase, putative  35.77 
 
 		 1614 aa  260  2e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.16806  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3055  putative PAS/PAC sensor protein  71.68 
 
 		 561 aa  256  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.618146  normal  0.669916 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1604  two component transcriptional regulator, AraC family  35.84 
 
 		 904 aa  252  3e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  36.14 
 
 		 1311 aa  251  6e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  33.54 
 
 		 934 aa  251  9e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  34.09 
 
 		 1366 aa  249  3e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  33.72 
 
 		 1384 aa  249  3e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0191  response regulator receiver hybrid histidine kinase  40.21 
 
 		 519 aa  248  4.9999999999999997e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.835451  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 1341 aa  248  9e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  34.91 
 
 		 1378 aa  247  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1754  histidine kinase  35.19 
 
 		 1344 aa  245  5e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  31.87 
 
 		 1373 aa  241  6.999999999999999e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 		 975 aa  239  4e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3767  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  38.55 
 
 		 587 aa  235  5e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4604  histidine kinase  34.61 
 
 		 663 aa  235  6e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  32.3 
 
 		 1418 aa  234  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 		 979 aa  232  4e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.366427 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5910  putative PAS/PAC sensor protein  34.44 
 
 		 739 aa  231  7e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2318  histidine kinase  33.27 
 
 		 1298 aa  231  9e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  31.85 
 
 		 1347 aa  230  2e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  34.92 
 
 		 1306 aa  229  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  33.02 
 
 		 1374 aa  229  4e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  30.7 
 
 		 1397 aa  228  7e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.21 
 
 		 1116 aa  227  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  36.17 
 
 		 876 aa  225  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4783  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.15 
 
 		 680 aa  223  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.302794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 978 aa  223  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149383  normal  0.186346 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2074  sensor histidine kinase  27.54 
 
 		 816 aa  222  5e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.09 
 
 		 1977 aa  222  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2406  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.33 
 
 		 1301 aa  222  5e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  31.4 
 
 		 1349 aa  221  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  32.7 
 
 		 1373 aa  220  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1716  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.67 
 
 		 628 aa  220  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.87 
 
 		 955 aa  219  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  32.82 
 
 		 1335 aa  219  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.22 
 
 		 1391 aa  219  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6047  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  33.7 
 
 		 677 aa  218  7e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3772  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.2 
 
 		 934 aa  218  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  34.25 
 
 		 1355 aa  217  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4807  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.78 
 
 		 1287 aa  215  5.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00341781  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3061  ATP-binding region ATPase domain protein  27.56 
 
 		 863 aa  215  7e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141845  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.98 
 
 		 1274 aa  214  7.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2084  sensor histidine kinase  27.27 
 
 		 816 aa  214  9e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03078  sensor histidine kinase  29.38 
 
 		 678 aa  213  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5118  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.93 
 
 		 837 aa  213  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  32.49 
 
 		 1355 aa  213  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1797  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.87 
 
 		 1419 aa  212  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.77 
 
 		 708 aa  211  8e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3199  two component transcriptional regulator, AraC family  31.8 
 
 		 940 aa  211  8e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157032  normal  0.236848 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.79 
 
 		 1965 aa  210  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  30 
 
 		 1374 aa  209  3e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.4 
 
 		 1548 aa  209  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.59 
 
 		 1501 aa  209  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  31.66 
 
 		 1340 aa  209  4e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>