More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2138 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2138  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
849 aa  1758    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.906633  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4608  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.23 
 
 
1645 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.284957  normal  0.407853 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.79 
 
 
1331 aa  261  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0851  signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 
1124 aa  185  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.596817 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4198  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.46 
 
 
1185 aa  184  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.996958 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0667  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.02 
 
 
703 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0876  signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 
1132 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.61927  normal  0.464028 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0915  PAS sensor protein  30.88 
 
 
1132 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.476466  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5910  putative PAS/PAC sensor protein  32.52 
 
 
739 aa  163  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.67 
 
 
1267 aa  139  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.142245  normal  0.539943 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2356  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.78 
 
 
764 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.736998  normal  0.0891785 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4387  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.77 
 
 
946 aa  135  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.86 
 
 
1261 aa  135  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.24 
 
 
1330 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173382  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0428  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.72 
 
 
943 aa  132  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.94781  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.41 
 
 
664 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5794  signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 
717 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.63151  normal  0.343732 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4422  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.75 
 
 
1274 aa  127  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.381764  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  45.45 
 
 
728 aa  126  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 
728 aa  127  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3662  alcohol dehydrogenase  41.67 
 
 
733 aa  119  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.899908  normal  0.588935 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0315  signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 
901 aa  119  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3792  putative PAS/PAC sensor protein  40.23 
 
 
406 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.200151 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2081  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
899 aa  112  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.31 
 
 
674 aa  110  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2810  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.07 
 
 
998 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3272  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.06 
 
 
1011 aa  110  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.04 
 
 
858 aa  109  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1516  signal transduction histidine kinase  41.45 
 
 
1205 aa  108  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0460264 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4618  signal transduction histidine kinase  39.72 
 
 
454 aa  108  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.723174  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5234  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.4 
 
 
946 aa  107  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2072  signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 
829 aa  105  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3696  sensory box histidine kinase/response regulator  40.46 
 
 
827 aa  105  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.652711  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1778  PAS  41.22 
 
 
956 aa  104  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.584017  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1053  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.73 
 
 
1059 aa  104  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111783  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6183  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.31 
 
 
916 aa  103  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.24256 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5002  signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 
1096 aa  103  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.47 
 
 
1808 aa  103  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4542  PAS sensor protein  29.47 
 
 
1096 aa  103  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220973  normal  0.0899725 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.58 
 
 
898 aa  101  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0005  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.62 
 
 
1399 aa  100  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7049  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5055  signal transduction histidine kinase  25.61 
 
 
1111 aa  100  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372822  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2168  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  60 
 
 
828 aa  97.4  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.419482 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2789  sensory box histidine kinase  41.3 
 
 
770 aa  96.3  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.41 
 
 
1134 aa  96.7  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0577  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.69 
 
 
1005 aa  96.7  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0920445  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 
2072 aa  95.5  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3736  putative PAS/PAC sensor protein  29.8 
 
 
1017 aa  95.1  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 
909 aa  94.7  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2246  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.84 
 
 
1084 aa  94.4  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.692403 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4329  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.38 
 
 
683 aa  93.2  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.213628  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1425  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.71 
 
 
1096 aa  92.8  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.579353  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6445  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.59 
 
 
830 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0224728  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5228  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.26 
 
 
1224 aa  92.8  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4536  signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 
430 aa  92.4  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3087  ATP-binding region, ATPase-like  38.24 
 
 
847 aa  91.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.373882  normal  0.0754896 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3071  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
1222 aa  90.9  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0997499 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.41 
 
 
1124 aa  90.5  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03078  sensor histidine kinase  38.4 
 
 
678 aa  89.7  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4113  putative PAS/PAC sensor protein  35.83 
 
 
896 aa  88.6  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.17 
 
 
701 aa  88.6  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.711392  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4823  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.64 
 
 
1004 aa  86.3  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9041  two component sensor kinase/response regulator hybrid  33.82 
 
 
701 aa  86.3  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1809  putative PAS/PAC sensor protein  42.61 
 
 
868 aa  86.7  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.109167 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 
1758 aa  84.7  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.669381 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.22 
 
 
686 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0036  histidine kinase  38.14 
 
 
556 aa  83.6  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.526737  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1400  PAS sensor signal transduction histidine kinase  26.19 
 
 
938 aa  82.8  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
960 aa  83.6  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3626  signal transduction histidine kinase  37.82 
 
 
792 aa  83.6  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0746201  normal  0.0102319 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  37.17 
 
 
1182 aa  82.8  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0323  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.84 
 
 
789 aa  82.4  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.179581  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2640  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 
955 aa  82.4  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3355  PAS  40.71 
 
 
646 aa  82  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.996652  normal  0.102892 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1417  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 
1055 aa  82  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0587691  normal  0.569805 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1410  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  36.67 
 
 
1120 aa  82  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132886  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4108  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.75 
 
 
1095 aa  81.6  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.43 
 
 
1253 aa  81.3  0.00000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0877  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 
1050 aa  80.9  0.00000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.948624  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3546  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.33 
 
 
688 aa  80.9  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2228  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.82 
 
 
688 aa  80.9  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.899414 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.71 
 
 
1131 aa  80.5  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0447  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.17 
 
 
662 aa  80.9  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1530  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.18 
 
 
1164 aa  80.5  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4080  putative PAS/PAC sensor protein  46.43 
 
 
1081 aa  80.1  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.99 
 
 
1040 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3584  sensory box histidine kinase/response regulator  40.18 
 
 
646 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1329  PAS sensor protein  32.18 
 
 
1164 aa  80.1  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.488954 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0818  EAL and GGDEF domain-containing protein  32.12 
 
 
976 aa  79.3  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5380  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.55 
 
 
890 aa  79.3  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.622794 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4420  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.06 
 
 
922 aa  79.3  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0348998  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2377  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 
688 aa  77.8  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0496  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 
896 aa  77  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4051  PAS sensor protein  31.76 
 
 
783 aa  77.4  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.688401  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4421  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.76 
 
 
783 aa  77.4  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4533  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
785 aa  77.4  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.955834 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3231  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.65 
 
 
914 aa  77  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1939  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 
691 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0201512 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1997  histidine kinase/response regulator hybrid protein  33.61 
 
 
558 aa  76.3  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.947527  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1922  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 
558 aa  76.3  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>