More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3626 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3626  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 792 aa  1558    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0746201  normal  0.0102319 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4542  PAS sensor protein  47.09 
 
 		 1096 aa  537  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220973  normal  0.0899725 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5055  signal transduction histidine kinase  46.81 
 
 		 1111 aa  529  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5002  signal transduction histidine kinase  47.09 
 
 		 1096 aa  527  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7977  signal transduction histidine kinase  41.36 
 
 		 1039 aa  293  9e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5910  putative PAS/PAC sensor protein  46.61 
 
 		 739 aa  273  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4271  histidine kinase  44.32 
 
 		 692 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal  0.0625064 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2379  signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 655 aa  263  8.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2103  PAS sensor protein  32.73 
 
 		 655 aa  260  6e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365518 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2055  signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 655 aa  253  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.429948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0915  PAS sensor protein  33.58 
 
 		 1132 aa  247  6.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.476466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1297  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  44.48 
 
 		 1168 aa  246  9e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0876  signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 		 1132 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.61927  normal  0.464028 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0851  signal transduction histidine kinase  33.27 
 
 		 1124 aa  243  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.596817 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5237  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  39.14 
 
 		 1324 aa  239  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.395635 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.42 
 
 		 1022 aa  235  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1  normal  0.0660292 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2182  signal transduction histidine kinase  50.81 
 
 		 528 aa  224  4.9999999999999996e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48160  putative sensor/response regulator hybrid  35.41 
 
 		 858 aa  219  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217947 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1053  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.88 
 
 		 1059 aa  211  5e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9083  bacteriophytochrome protein  36.39 
 
 		 856 aa  192  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2108  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.17 
 
 		 1014 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.659699  normal  0.848073 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  33.27 
 
 		 639 aa  186  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3651  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 727 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.125923 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2079  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.99 
 
 		 727 aa  184  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.79077 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2252  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.05 
 
 		 732 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1213  signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 603 aa  181  5.999999999999999e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0855  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.56 
 
 		 776 aa  181  5.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0798  PAS sensor protein  35.31 
 
 		 624 aa  180  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 602 aa  176  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4458  putative GAF sensor protein  32.56 
 
 		 844 aa  176  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2251  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.11 
 
 		 721 aa  174  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0770498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  35.71 
 
 		 842 aa  173  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2256  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.8 
 
 		 727 aa  171  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.903593 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  34.93 
 
 		 872 aa  167  8e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6450  signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 		 635 aa  167  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1117  PAS sensor protein  34.34 
 
 		 500 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6211  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  38.94 
 
 		 1061 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.820077  normal  0.703655 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1267  signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 		 500 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5794  signal transduction histidine kinase  36.42 
 
 		 717 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.63151  normal  0.343732 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3496  bacteriophytochrome protein  33.62 
 
 		 852 aa  164  7e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552776  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  36.26 
 
 		 1202 aa  164  8.000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  34.29 
 
 		 846 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3755  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  37.01 
 
 		 1063 aa  161  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 713 aa  160  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1241  signal transduction histidine kinase  36.83 
 
 		 631 aa  159  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0246477 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  36.18 
 
 		 849 aa  158  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 		 713 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  33.43 
 
 		 717 aa  157  6e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3272  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.81 
 
 		 1011 aa  156  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3289  putative PAS/PAC sensor protein  33.15 
 
 		 855 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.363327  normal  0.145052 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 728 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  32.94 
 
 		 728 aa  154  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0146  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.49 
 
 		 1381 aa  152  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.436687 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3736  putative PAS/PAC sensor protein  33.61 
 
 		 1017 aa  152  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5270  signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 559 aa  151  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3662  alcohol dehydrogenase  32.46 
 
 		 733 aa  150  9e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.899908  normal  0.588935 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6264  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.86 
 
 		 1163 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2586  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  31.14 
 
 		 847 aa  147  6e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251983 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  31.16 
 
 		 856 aa  147  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3000  signal transduction histidine kinase  33.53 
 
 		 495 aa  144  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3048  signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 		 1001 aa  144  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2246  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.99 
 
 		 1084 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.692403 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4235  signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 496 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.942064  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2364  signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 633 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.932865  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6901  signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 		 465 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2574  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  32.09 
 
 		 844 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.969915 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  36.19 
 
 		 1190 aa  139  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00620  two-component system sensor protein  32.72 
 
 		 1131 aa  139  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282271  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 897 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 907 aa  137  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  35.89 
 
 		 662 aa  137  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4799  signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 620 aa  137  8e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2394  putative GAF sensor protein  31.4 
 
 		 847 aa  137  9e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25898  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3364  response regulator  31.69 
 
 		 847 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6933  signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 		 488 aa  135  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0108  PAS sensor protein  33.94 
 
 		 620 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 		 601 aa  134  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2607  signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 489 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1350  signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 1016 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597121 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 850 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 571 aa  133  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  34.74 
 
 		 1041 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 		 503 aa  133  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.36 
 
 		 1808 aa  131  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01099  bacteriophytochrome protein  27.81 
 
 		 822 aa  131  4.0000000000000003e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.506628  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2563  signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 		 409 aa  131  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 		 339 aa  130  8.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4317  sensor histidine kinase  33.68 
 
 		 499 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0471  signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 349 aa  130  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3090  signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 		 575 aa  129  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0895303  normal  0.0359946 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 		 759 aa  129  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2833  signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 738 aa  129  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 1002 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0149  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 957 aa  127  7e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.43 
 
 		 1167 aa  127  7e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1131  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.1 
 
 		 826 aa  127  8.000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.120114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3416  signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 413 aa  127  9e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.813211  normal  0.0120926 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3039  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.35 
 
 		 1067 aa  127  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.635771  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2764  HWE histidine kinase  38.46 
 
 		 234 aa  126  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  32.4 
 
 		 1027 aa  125  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>