More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1190 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  65.87 
 
 		 897 aa  781    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  61.96 
 
 		 872 aa  823    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  88.42 
 
 		 1002 aa  1739    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1350  signal transduction histidine kinase  99.21 
 
 		 1016 aa  2033    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597121 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3048  signal transduction histidine kinase  76.81 
 
 		 1001 aa  1504    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  100 
 
 		 1041 aa  2098    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6181  signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 1191 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.299797 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5228  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.27 
 
 		 1224 aa  350  1e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  38.79 
 
 		 759 aa  338  3.9999999999999995e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4215  signal transduction histidine kinase  44.79 
 
 		 582 aa  330  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  41.47 
 
 		 586 aa  317  5e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  33.55 
 
 		 1561 aa  298  5e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4368  signal transduction histidine kinase  58.74 
 
 		 934 aa  290  7e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523014 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3897  PAS sensor protein  57.53 
 
 		 930 aa  283  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4265  signal transduction histidine kinase  57.14 
 
 		 930 aa  283  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.588648  normal  0.462436 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  41.02 
 
 		 850 aa  251  4e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1053  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.92 
 
 		 1059 aa  249  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 		 929 aa  248  3e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3272  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.58 
 
 		 1011 aa  243  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  44.41 
 
 		 840 aa  241  4e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  30.65 
 
 		 728 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 		 601 aa  235  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 		 662 aa  233  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 		 725 aa  233  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0655  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.94 
 
 		 864 aa  229  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 728 aa  229  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3662  alcohol dehydrogenase  31.77 
 
 		 733 aa  228  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.899908  normal  0.588935 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0798  PAS sensor protein  33.27 
 
 		 624 aa  227  8e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4776  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.94 
 
 		 1086 aa  226  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 		 3706 aa  225  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  40.27 
 
 		 488 aa  224  6e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4625  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 1092 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.02 
 
 		 1057 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 907 aa  223  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  41.49 
 
 		 503 aa  222  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5219  signal transduction histidine kinase  39.18 
 
 		 512 aa  219  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 583 aa  218  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4259  PAS sensor protein  28.43 
 
 		 1086 aa  218  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.127746 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  40.71 
 
 		 713 aa  217  9e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  34.11 
 
 		 583 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2607  signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 		 489 aa  214  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.66 
 
 		 1965 aa  214  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  41.03 
 
 		 488 aa  214  9e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 583 aa  213  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2563  signal transduction histidine kinase  42.01 
 
 		 409 aa  212  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  40.59 
 
 		 488 aa  212  3e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.53 
 
 		 1076 aa  211  6e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.715458 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1778  PAS  34.43 
 
 		 956 aa  210  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.584017  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2251  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 657 aa  209  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5539  signal transduction histidine kinase  55.79 
 
 		 677 aa  209  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4542  PAS sensor protein  29.06 
 
 		 1096 aa  207  8e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220973  normal  0.0899725 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6854  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.99 
 
 		 886 aa  207  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5002  signal transduction histidine kinase  29.04 
 
 		 1096 aa  207  9e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6450  signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 		 635 aa  206  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  41.3 
 
 		 713 aa  204  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  41.3 
 
 		 717 aa  204  7e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 571 aa  203  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.25 
 
 		 1808 aa  201  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0827  signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 512 aa  201  6e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3840  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 		 759 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385478  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2810  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.05 
 
 		 998 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  32.1 
 
 		 1202 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.89 
 
 		 1002 aa  199  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.02 
 
 		 1391 aa  198  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6901  signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 		 465 aa  196  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2995  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.55 
 
 		 1002 aa  196  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175208  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.54 
 
 		 1501 aa  194  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6856  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 		 1000 aa  194  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3696  sensory box histidine kinase/response regulator  67.94 
 
 		 827 aa  193  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.652711  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.31 
 
 		 1068 aa  194  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0640729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 		 1171 aa  192  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48946  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 		 640 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3652  signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 491 aa  191  8e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 		 1171 aa  190  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135263 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2344  signal transduction histidine kinase  37.54 
 
 		 500 aa  188  6e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00211814  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.15 
 
 		 1418 aa  186  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5560  signal transduction histidine kinase  47.14 
 
 		 341 aa  185  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  normal  0.0162393 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2281  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 		 891 aa  185  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00177504  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.28 
 
 		 1273 aa  185  5.0000000000000004e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3634  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.39 
 
 		 944 aa  184  8.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103342  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  43.72 
 
 		 372 aa  184  8.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 		 1714 aa  182  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00620  two-component system sensor protein  38.22 
 
 		 1131 aa  183  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282271  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0588  sensory box protein  31.75 
 
 		 463 aa  182  4e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5262  signal transduction histidine kinase  41.63 
 
 		 338 aa  182  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04155  Putative signal protein with GAF,PAS(PAC) and GGDEF domains  28.76 
 
 		 874 aa  182  4e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.581833  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0554  sensory box protein  31.75 
 
 		 463 aa  181  4.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0386  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.16 
 
 		 1342 aa  181  8e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5418  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.76 
 
 		 774 aa  180  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4345  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 890 aa  180  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2833  signal transduction histidine kinase  40.11 
 
 		 738 aa  180  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4535  putative GAF sensor protein  56.89 
 
 		 251 aa  180  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2118  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.34 
 
 		 1125 aa  179  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1782  PAS sensor protein  32.34 
 
 		 1125 aa  179  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2184  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  33.99 
 
 		 832 aa  179  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.425647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5198  putative PAS/PAC sensor protein  29.6 
 
 		 694 aa  178  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02127  sensor histidine kinase  41.49 
 
 		 398 aa  176  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147572  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5710  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 515 aa  176  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2200  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 		 678 aa  175  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.541226  hitchhiker  0.00764394 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4812  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  29.62 
 
 		 1423 aa  175  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.330918  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>