More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2022 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  100 
 
 		 717 aa  1423    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  99.58 
 
 		 713 aa  1412    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2833  signal transduction histidine kinase  72.63 
 
 		 738 aa  994    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  94.67 
 
 		 713 aa  1349    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  57.81 
 
 		 850 aa  579  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  57.81 
 
 		 840 aa  527  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  47.01 
 
 		 586 aa  266  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3662  alcohol dehydrogenase  39.58 
 
 		 733 aa  243  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.899908  normal  0.588935 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  43.57 
 
 		 503 aa  238  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2563  signal transduction histidine kinase  45.99 
 
 		 409 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  41.94 
 
 		 372 aa  234  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  54.08 
 
 		 759 aa  233  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 		 488 aa  232  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4215  signal transduction histidine kinase  43.11 
 
 		 582 aa  229  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  37.25 
 
 		 728 aa  226  8e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 		 728 aa  226  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  40.94 
 
 		 488 aa  224  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  41.03 
 
 		 725 aa  224  4.9999999999999996e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  40.94 
 
 		 488 aa  224  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  41.47 
 
 		 872 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0471  signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 		 349 aa  216  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1069  signal transduction histidine kinase  41.12 
 
 		 387 aa  213  7.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2607  signal transduction histidine kinase  37.35 
 
 		 489 aa  205  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1074  signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 481 aa  204  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3126  signal transduction histidine kinase  45.13 
 
 		 352 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1350  signal transduction histidine kinase  41.59 
 
 		 1016 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597121 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3048  signal transduction histidine kinase  41.52 
 
 		 1001 aa  197  6e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  41.3 
 
 		 1041 aa  196  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  46.15 
 
 		 339 aa  196  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3652  signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 491 aa  195  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 		 907 aa  190  5.999999999999999e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  41.52 
 
 		 897 aa  190  9e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6933  signal transduction histidine kinase  47.26 
 
 		 488 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6901  signal transduction histidine kinase  39.37 
 
 		 465 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2666  signal transduction histidine kinase  35.89 
 
 		 446 aa  185  3e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653198  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3978  signal transduction histidine kinase  49.04 
 
 		 577 aa  185  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 		 571 aa  182  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5235  signal transduction histidine kinase  47.42 
 
 		 571 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 929 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0588  sensory box protein  39.69 
 
 		 463 aa  180  8e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0554  sensory box protein  39.69 
 
 		 463 aa  180  8e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1551  signal transduction histidine kinase  49.34 
 
 		 642 aa  178  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518292 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6181  signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 		 1191 aa  178  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.299797 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4368  signal transduction histidine kinase  46.79 
 
 		 934 aa  178  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523014 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1395  signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 		 304 aa  177  6e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.695001  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2344  signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 		 500 aa  177  6e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00211814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5515  hypothetical protein  26.44 
 
 		 703 aa  177  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 		 583 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 		 662 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  36.73 
 
 		 583 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 		 601 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  40.4 
 
 		 1002 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2379  signal transduction histidine kinase  33.13 
 
 		 655 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3897  PAS sensor protein  43.89 
 
 		 930 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240133 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6450  signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 635 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4317  sensor histidine kinase  33.15 
 
 		 499 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0825  signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 455 aa  174  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111815  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4265  signal transduction histidine kinase  43.89 
 
 		 930 aa  174  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.588648  normal  0.462436 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2103  PAS sensor protein  33.13 
 
 		 655 aa  174  5.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365518 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 		 583 aa  173  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  36.42 
 
 		 602 aa  172  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2814  putative sensor histidine kinase  46.15 
 
 		 505 aa  173  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3264  HWE histidine kinase  41.83 
 
 		 261 aa  171  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440778 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2160  signal transduction histidine kinase  48.73 
 
 		 263 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.31354  normal  0.0264622 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4271  histidine kinase  33.63 
 
 		 692 aa  169  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal  0.0625064 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1944  signal transduction histidine kinase  44.86 
 
 		 507 aa  167  5e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0183597  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1117  PAS sensor protein  31.07 
 
 		 500 aa  167  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1301  signal transduction histidine kinase  47.64 
 
 		 588 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1267  signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 		 500 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  34.58 
 
 		 1202 aa  165  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0615  signal transduction histidine kinase  44.23 
 
 		 258 aa  165  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  45.67 
 
 		 1160 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1297  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  34.02 
 
 		 1168 aa  163  9e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0798  PAS sensor protein  30.65 
 
 		 624 aa  163  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2070  signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 		 358 aa  163  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.315094  normal  0.359428 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5539  signal transduction histidine kinase  47.52 
 
 		 677 aa  161  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3416  signal transduction histidine kinase  49.52 
 
 		 413 aa  160  9e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.813211  normal  0.0120926 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4109  signal transduction histidine kinase  43.35 
 
 		 384 aa  159  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0421223  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5560  signal transduction histidine kinase  37.92 
 
 		 341 aa  160  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  normal  0.0162393 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  36.84 
 
 		 1167 aa  159  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6552  signal transduction histidine kinase  40.57 
 
 		 489 aa  159  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3626  signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 792 aa  157  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0746201  normal  0.0102319 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2176  putative signal transduction histidine kinase  45.64 
 
 		 411 aa  157  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5219  signal transduction histidine kinase  37.54 
 
 		 512 aa  157  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  38.91 
 
 		 1190 aa  156  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5262  signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 		 338 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1153  signal transduction histidine kinase  41.35 
 
 		 275 aa  155  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.614752  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 639 aa  154  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1753  sensor histidine kinase  46.04 
 
 		 364 aa  155  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4799  signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 620 aa  154  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5794  signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 717 aa  154  7e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.63151  normal  0.343732 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2055  signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 		 655 aa  153  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.429948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7977  signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 		 1039 aa  153  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0827  signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 512 aa  153  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  34.54 
 
 		 1027 aa  153  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4235  signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 496 aa  152  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.942064  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0108  PAS sensor protein  31.33 
 
 		 620 aa  152  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3000  signal transduction histidine kinase  35.76 
 
 		 495 aa  152  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2364  signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 633 aa  150  8e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.932865  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0741  Signal transduction histidine kinase  38.79 
 
 		 498 aa  150  9e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>