More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3090 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3090  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 575 aa  1175    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0895303  normal  0.0359946 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1390  signal transduction histidine kinase  50.31 
 
 		 484 aa  473  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.38029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  55.98 
 
 		 662 aa  229  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  55.02 
 
 		 583 aa  225  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  55.02 
 
 		 583 aa  225  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  55.5 
 
 		 571 aa  225  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  55.02 
 
 		 601 aa  224  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  53.59 
 
 		 583 aa  220  6e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3344  signal transduction histidine kinase  46.72 
 
 		 336 aa  217  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1888  PAS sensor protein  40.97 
 
 		 326 aa  216  8e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0507  signal transduction histidine kinase  40.33 
 
 		 336 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0167  signal transduction histidine kinase  40.13 
 
 		 336 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1333  signal transduction histidine kinase  49.74 
 
 		 346 aa  196  7e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0112868 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5922  signal transduction histidine kinase  47.18 
 
 		 346 aa  189  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6531  signal transduction histidine kinase  46.67 
 
 		 344 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14349  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2740  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.1 
 
 		 943 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5599  signal transduction histidine kinase  42.13 
 
 		 389 aa  164  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7959  signal transduction histidine kinase  40.82 
 
 		 416 aa  164  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 725 aa  157  7e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  37.44 
 
 		 1190 aa  156  8e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5586  signal transduction histidine kinase  39.8 
 
 		 390 aa  156  8e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1306  PAS sensor Signal tranduction histidine kinase  35.56 
 
 		 949 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124542  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2967  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.56 
 
 		 949 aa  156  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.291071  normal  0.350737 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1337  signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 		 356 aa  150  6e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.552854 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0007  signal transduction histidine kinase  39.55 
 
 		 482 aa  150  9e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.489749  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  33.7 
 
 		 1027 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0743  HWE histidine kinase  39.17 
 
 		 483 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6901  signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 		 465 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2563  signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 409 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 		 372 aa  147  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 		 850 aa  145  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6552  signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 489 aa  145  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  25.69 
 
 		 488 aa  143  9e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0905  putative PAS/PAC sensor protein  28.21 
 
 		 1170 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.968727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1753  sensor histidine kinase  39.29 
 
 		 364 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2229  methylesterase CheB/methylase CheR  27.95 
 
 		 1170 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.840236  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0091  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.51 
 
 		 930 aa  141  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00954137  normal  0.993222 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 713 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  36.76 
 
 		 488 aa  140  7e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  36.53 
 
 		 586 aa  140  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  38.83 
 
 		 907 aa  140  8.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  24.75 
 
 		 488 aa  139  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2264  putative PAS/PAC sensor protein  30.56 
 
 		 1165 aa  139  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.620072  normal  0.0600346 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2814  putative sensor histidine kinase  38.86 
 
 		 505 aa  139  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2976  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.28 
 
 		 889 aa  138  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.29382  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4271  histidine kinase  33.19 
 
 		 692 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal  0.0625064 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3126  signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 352 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 		 840 aa  137  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2544  Signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 489 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3982  hypothetical protein  34.25 
 
 		 478 aa  137  8e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3444  signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 572 aa  136  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.753856 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6211  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  34.87 
 
 		 1061 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.820077  normal  0.703655 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  36.22 
 
 		 842 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1069  signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 		 387 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  38.31 
 
 		 759 aa  134  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4605  MCP methyltransferase, CheR-type  31.67 
 
 		 1092 aa  135  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315944  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  35.44 
 
 		 1160 aa  134  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.88 
 
 		 1167 aa  134  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 		 728 aa  135  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0588  sensory box protein  30.73 
 
 		 463 aa  134  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  36.54 
 
 		 728 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0554  sensory box protein  30.73 
 
 		 463 aa  134  3.9999999999999996e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0180  signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 380 aa  134  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.012775  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5560  signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 341 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  normal  0.0162393 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1944  signal transduction histidine kinase  40.49 
 
 		 507 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0183597  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5235  signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 571 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0471  signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 		 349 aa  131  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2030  putative sensor histidine kinase  32.75 
 
 		 313 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3652  signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 		 491 aa  131  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4108  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.91 
 
 		 1095 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  34.15 
 
 		 872 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1750  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.84 
 
 		 660 aa  130  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.92 
 
 		 1036 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.705021 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3626  signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 		 792 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0746201  normal  0.0102319 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0741  signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 356 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0218  signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 867 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269004 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1241  signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 631 aa  127  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0246477 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4109  signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 		 384 aa  127  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0421223  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 503 aa  127  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2607  signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 489 aa  127  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2344  signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 		 500 aa  126  9e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00211814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3313  hypothetical protein  32.43 
 
 		 480 aa  126  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.29262 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 		 339 aa  126  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 		 713 aa  125  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  36.57 
 
 		 717 aa  125  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7977  signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 1039 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3755  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.07 
 
 		 1063 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 602 aa  125  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1377  putative sensor histidine kinase  32.76 
 
 		 561 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351027  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3662  alcohol dehydrogenase  33.78 
 
 		 733 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.899908  normal  0.588935 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4317  sensor histidine kinase  33.18 
 
 		 499 aa  124  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6183  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.21 
 
 		 916 aa  123  9e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.24256 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3416  signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 413 aa  123  9e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.813211  normal  0.0120926 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5756  signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 347 aa  123  9e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.170851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0487  signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 555 aa  122  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5262  signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 338 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  35.2 
 
 		 849 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1635  signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 362 aa  123  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.466466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5589  sensor histidine kinase  34.13 
 
 		 632 aa  122  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6933  signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 488 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223762  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>