More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3662 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  68.33 
 
 		 728 aa  967    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  68.46 
 
 		 728 aa  962    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3662  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 733 aa  1476    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.899908  normal  0.588935 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 		 713 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4215  signal transduction histidine kinase  42.24 
 
 		 582 aa  233  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  33.79 
 
 		 872 aa  232  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6181  signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 1191 aa  228  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.299797 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2666  signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 		 446 aa  228  4e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653198  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  36.52 
 
 		 717 aa  227  6e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 		 713 aa  226  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6450  signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 635 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  41.77 
 
 		 850 aa  220  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1213  signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 603 aa  213  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  35.89 
 
 		 840 aa  211  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 586 aa  210  9e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1350  signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 1016 aa  206  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597121 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  31.64 
 
 		 1041 aa  205  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  33.72 
 
 		 897 aa  204  6e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9041  two component sensor kinase/response regulator hybrid  35.58 
 
 		 701 aa  203  9e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5794  signal transduction histidine kinase  38.23 
 
 		 717 aa  200  7e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.63151  normal  0.343732 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3048  signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 1001 aa  200  9e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0798  PAS sensor protein  30.2 
 
 		 624 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 		 907 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 1002 aa  198  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2833  signal transduction histidine kinase  39.64 
 
 		 738 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2379  signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 655 aa  197  6e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4235  signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 		 496 aa  196  9e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.942064  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2103  PAS sensor protein  29.2 
 
 		 655 aa  196  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365518 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 		 759 aa  192  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2364  signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 		 633 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.932865  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1117  PAS sensor protein  33.54 
 
 		 500 aa  189  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0108  PAS sensor protein  30.82 
 
 		 620 aa  189  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1267  signal transduction histidine kinase  33.54 
 
 		 500 aa  188  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0825  signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 455 aa  187  6e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111815  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2055  signal transduction histidine kinase  28.49 
 
 		 655 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.429948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.69 
 
 		 1330 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4799  signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 		 620 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0471  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.6 
 
 		 1225 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.221036  normal  0.153067 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0508  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 		 1215 aa  182  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.722414  normal  0.07841 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0437  PAS sensor protein  35.34 
 
 		 1225 aa  183  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719852  normal  0.440419 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0802  PAS sensor protein  37.5 
 
 		 1065 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0149  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.57 
 
 		 957 aa  181  5.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3000  signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 495 aa  180  7e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6264  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.99 
 
 		 1163 aa  179  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.16 
 
 		 1297 aa  178  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  36.6 
 
 		 583 aa  176  9e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 		 583 aa  177  9e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2607  signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 489 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 		 503 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1069  signal transduction histidine kinase  39.56 
 
 		 387 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 662 aa  174  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 601 aa  172  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0091  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.9 
 
 		 930 aa  172  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00954137  normal  0.993222 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 		 339 aa  172  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 		 583 aa  170  8e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  38.95 
 
 		 488 aa  169  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 		 725 aa  170  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3336  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.98 
 
 		 1065 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6901  signal transduction histidine kinase  36.01 
 
 		 465 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  37.15 
 
 		 571 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 		 929 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0876  signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 1132 aa  167  8e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.61927  normal  0.464028 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0915  PAS sensor protein  31.36 
 
 		 1132 aa  167  9e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.476466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 372 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.55 
 
 		 1261 aa  166  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2563  signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 		 409 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0588  sensory box protein  36.47 
 
 		 463 aa  164  5.0000000000000005e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6933  signal transduction histidine kinase  40.31 
 
 		 488 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6552  signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 		 489 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0554  sensory box protein  36.47 
 
 		 463 aa  164  6e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 639 aa  162  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2072  signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 		 829 aa  162  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3974  signal transduction histidine kinase  46.82 
 
 		 635 aa  161  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0272817 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0851  signal transduction histidine kinase  31.04 
 
 		 1124 aa  160  6e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.596817 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 		 488 aa  160  9e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5235  signal transduction histidine kinase  43.37 
 
 		 571 aa  158  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.49 
 
 		 1331 aa  158  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4317  sensor histidine kinase  36.4 
 
 		 499 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0167  signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 336 aa  157  8e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2344  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 500 aa  157  8e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00211814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1395  signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 		 304 aa  157  9e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.695001  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  36.7 
 
 		 488 aa  156  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  34.88 
 
 		 1167 aa  156  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0364  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.98 
 
 		 1013 aa  155  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0471  signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 349 aa  155  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3652  signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 491 aa  154  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5262  signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 338 aa  154  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3126  signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 		 352 aa  153  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3344  signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 		 336 aa  153  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0507  signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 		 336 aa  152  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4826  signal transduction histidine kinase  44.21 
 
 		 553 aa  152  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788722  normal  0.27838 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3272  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.07 
 
 		 1011 aa  152  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1074  signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 		 481 aa  152  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  35.27 
 
 		 1027 aa  151  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3978  signal transduction histidine kinase  43.88 
 
 		 577 aa  150  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1888  PAS sensor protein  35.2 
 
 		 326 aa  150  7e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0678  two-component sensor histidine kinase  30.47 
 
 		 460 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3792  putative PAS/PAC sensor protein  36.17 
 
 		 406 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.200151 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  31.96 
 
 		 1160 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3264  HWE histidine kinase  44.16 
 
 		 261 aa  148  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440778 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>