More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3300 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  100 
 
 		 583 aa  1159    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  60.17 
 
 		 571 aa  657    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  99.83 
 
 		 583 aa  1158    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  92.27 
 
 		 583 aa  1064    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  58.1 
 
 		 662 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  58.13 
 
 		 601 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1333  signal transduction histidine kinase  57.34 
 
 		 346 aa  244  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0112868 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 586 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 		 759 aa  236  8e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5922  signal transduction histidine kinase  56.31 
 
 		 346 aa  229  8e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6531  signal transduction histidine kinase  56.8 
 
 		 344 aa  226  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14349  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3090  signal transduction histidine kinase  55.02 
 
 		 575 aa  225  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0895303  normal  0.0359946 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 		 907 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  38.34 
 
 		 850 aa  220  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  35.89 
 
 		 872 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 		 897 aa  217  4e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  38.34 
 
 		 840 aa  217  5e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3048  signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 1001 aa  211  4e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1390  signal transduction histidine kinase  49.53 
 
 		 484 aa  209  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.38029 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0167  signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 336 aa  206  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3344  signal transduction histidine kinase  50.24 
 
 		 336 aa  206  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0507  signal transduction histidine kinase  50.71 
 
 		 336 aa  205  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1888  PAS sensor protein  50.48 
 
 		 326 aa  204  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  34.11 
 
 		 1041 aa  197  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1350  signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 		 1016 aa  195  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597121 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 		 1002 aa  194  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4215  signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 582 aa  193  6e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6901  signal transduction histidine kinase  36.42 
 
 		 465 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 		 929 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  32.44 
 
 		 1202 aa  182  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  38.48 
 
 		 713 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4317  sensor histidine kinase  34.56 
 
 		 499 aa  180  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  34.58 
 
 		 728 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5599  signal transduction histidine kinase  46.04 
 
 		 389 aa  178  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7959  signal transduction histidine kinase  44.06 
 
 		 416 aa  177  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3662  alcohol dehydrogenase  36.6 
 
 		 733 aa  176  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.899908  normal  0.588935 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 728 aa  176  9e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  35.99 
 
 		 503 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  42.22 
 
 		 488 aa  173  6.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  39.15 
 
 		 488 aa  173  9e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0827  signal transduction histidine kinase  30.78 
 
 		 512 aa  173  9e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  39.15 
 
 		 488 aa  172  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  34.95 
 
 		 1167 aa  172  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6181  signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 		 1191 aa  172  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.299797 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2344  signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 		 500 aa  171  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00211814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 		 725 aa  171  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  36.73 
 
 		 717 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 		 713 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 		 372 aa  166  8e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  33.79 
 
 		 1160 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5586  signal transduction histidine kinase  41.58 
 
 		 390 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5235  signal transduction histidine kinase  43.46 
 
 		 571 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 		 639 aa  161  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1337  signal transduction histidine kinase  44.1 
 
 		 356 aa  160  4e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.552854 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1213  signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 		 603 aa  160  6e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6552  signal transduction histidine kinase  39.35 
 
 		 489 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2607  signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 		 489 aa  156  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2563  signal transduction histidine kinase  39.37 
 
 		 409 aa  155  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1753  sensor histidine kinase  39.8 
 
 		 364 aa  155  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  40.36 
 
 		 339 aa  154  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1944  signal transduction histidine kinase  39.3 
 
 		 507 aa  153  7e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0183597  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0678  two-component sensor histidine kinase  33.14 
 
 		 460 aa  153  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  39.27 
 
 		 1190 aa  153  8e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3126  signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 		 352 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6450  signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 635 aa  152  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5515  hypothetical protein  34.97 
 
 		 703 aa  152  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0007  signal transduction histidine kinase  43.72 
 
 		 482 aa  151  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.489749  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1074  signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 481 aa  151  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4618  signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 454 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.723174  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1241  signal transduction histidine kinase  45.13 
 
 		 631 aa  149  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0246477 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0743  HWE histidine kinase  39.32 
 
 		 483 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4109  signal transduction histidine kinase  42.36 
 
 		 384 aa  149  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0421223  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  36.28 
 
 		 1027 aa  148  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0798  PAS sensor protein  27.63 
 
 		 624 aa  148  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3652  signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 491 aa  148  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0554  sensory box protein  34.42 
 
 		 463 aa  147  7.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0588  sensory box protein  34.42 
 
 		 463 aa  147  8.000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4605  MCP methyltransferase, CheR-type  33.33 
 
 		 1092 aa  146  8.000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315944  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3978  signal transduction histidine kinase  40.98 
 
 		 577 aa  146  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2544  Signal transduction histidine kinase  37.62 
 
 		 489 aa  145  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1069  signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 387 aa  145  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2814  putative sensor histidine kinase  40.1 
 
 		 505 aa  145  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3982  hypothetical protein  35.29 
 
 		 478 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1395  signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 		 304 aa  144  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.695001  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4826  signal transduction histidine kinase  40.53 
 
 		 553 aa  144  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788722  normal  0.27838 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3897  PAS sensor protein  38.33 
 
 		 930 aa  143  7e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240133 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0905  putative PAS/PAC sensor protein  38.66 
 
 		 1170 aa  143  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.968727 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4368  signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 934 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523014 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2229  methylesterase CheB/methylase CheR  38.66 
 
 		 1170 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.840236  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5756  signal transduction histidine kinase  38.65 
 
 		 347 aa  143  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.170851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0487  signal transduction histidine kinase  38.58 
 
 		 555 aa  142  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5794  signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 717 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.63151  normal  0.343732 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1377  putative sensor histidine kinase  39.36 
 
 		 561 aa  143  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351027  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1628  sensor histidine protein kinase  35.53 
 
 		 332 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.560713  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2833  signal transduction histidine kinase  38.73 
 
 		 738 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0218  signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 		 867 aa  141  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269004 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0741  Signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 498 aa  141  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1551  signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 		 642 aa  141  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518292 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5560  signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 341 aa  141  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  normal  0.0162393 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3416  signal transduction histidine kinase  41.36 
 
 		 413 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.813211  normal  0.0120926 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>