More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1377 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1377  putative sensor histidine kinase  100 
 
 		 561 aa  1127    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351027  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3978  signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 577 aa  217  5e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2814  putative sensor histidine kinase  27.95 
 
 		 505 aa  205  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5235  signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 571 aa  169  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1301  signal transduction histidine kinase  46.84 
 
 		 588 aa  162  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  43.41 
 
 		 372 aa  159  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  39.47 
 
 		 339 aa  157  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  39.41 
 
 		 725 aa  154  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  45.13 
 
 		 586 aa  154  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 		 759 aa  154  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  43.16 
 
 		 850 aa  152  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6552  signal transduction histidine kinase  41.29 
 
 		 489 aa  152  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3933  signal transduction histidine kinase  26.43 
 
 		 579 aa  150  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939914  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1074  signal transduction histidine kinase  40.82 
 
 		 481 aa  150  7e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  42.39 
 
 		 1160 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3662  alcohol dehydrogenase  40.4 
 
 		 733 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.899908  normal  0.588935 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6531  signal transduction histidine kinase  39.58 
 
 		 344 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14349  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3126  signal transduction histidine kinase  42.05 
 
 		 352 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 713 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3982  hypothetical protein  39.58 
 
 		 478 aa  146  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 601 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  41.27 
 
 		 840 aa  145  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3344  signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 		 336 aa  144  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 662 aa  144  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5922  signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 		 346 aa  144  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0487  signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 		 555 aa  144  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1333  signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 		 346 aa  144  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0112868 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3313  hypothetical protein  40.5 
 
 		 480 aa  143  8e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.29262 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  37 
 
 		 728 aa  143  9e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  39.36 
 
 		 583 aa  143  9e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  39.36 
 
 		 583 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1551  signal transduction histidine kinase  38.86 
 
 		 642 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518292 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0167  signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 		 336 aa  141  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1069  signal transduction histidine kinase  39.69 
 
 		 387 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  36.5 
 
 		 728 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  38.83 
 
 		 583 aa  140  6e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 		 571 aa  139  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  34.3 
 
 		 872 aa  139  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0507  signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 		 336 aa  139  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2563  signal transduction histidine kinase  38.92 
 
 		 409 aa  138  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 		 907 aa  137  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1888  PAS sensor protein  34.74 
 
 		 326 aa  137  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3666  signal transduction histidine kinase  25.18 
 
 		 550 aa  137  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123232  normal  0.85719 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6901  signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 		 465 aa  136  8e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  37.56 
 
 		 1027 aa  136  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1241  signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 		 631 aa  136  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0246477 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4317  sensor histidine kinase  39.06 
 
 		 499 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  40.74 
 
 		 1167 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6933  signal transduction histidine kinase  42.41 
 
 		 488 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  42.93 
 
 		 717 aa  135  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  42.93 
 
 		 713 aa  135  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4368  signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 934 aa  134  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523014 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 		 639 aa  134  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 		 503 aa  134  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3364  signal transduction histidine kinase  25.09 
 
 		 550 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4215  signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 582 aa  133  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0615  signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 		 258 aa  133  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  39.27 
 
 		 488 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3264  HWE histidine kinase  38.86 
 
 		 261 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440778 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5593  two component sensor kinase  35.75 
 
 		 352 aa  130  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5756  signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 		 347 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.170851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2833  signal transduction histidine kinase  44.51 
 
 		 738 aa  130  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3897  PAS sensor protein  33.33 
 
 		 930 aa  130  6e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240133 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5729  signal transduction histidine kinase  39.44 
 
 		 352 aa  130  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3652  signal transduction histidine kinase  37.99 
 
 		 491 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4265  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 930 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.588648  normal  0.462436 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4109  signal transduction histidine kinase  36.98 
 
 		 384 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0421223  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2264  putative PAS/PAC sensor protein  36.04 
 
 		 1165 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.620072  normal  0.0600346 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  34.25 
 
 		 1190 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0905  putative PAS/PAC sensor protein  35.44 
 
 		 1170 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.968727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2176  putative signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 		 411 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2229  methylesterase CheB/methylase CheR  35.53 
 
 		 1170 aa  128  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.840236  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1395  signal transduction histidine kinase  38.54 
 
 		 304 aa  128  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.695001  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3444  signal transduction histidine kinase  27.13 
 
 		 572 aa  128  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.753856 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1944  signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 507 aa  127  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0183597  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2344  signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 		 500 aa  126  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00211814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1153  signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 		 275 aa  126  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.614752  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 		 488 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0471  signal transduction histidine kinase  38.95 
 
 		 349 aa  125  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5539  signal transduction histidine kinase  40.1 
 
 		 677 aa  125  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1337  signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 		 356 aa  125  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.552854 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  38.22 
 
 		 488 aa  125  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5515  hypothetical protein  38.62 
 
 		 703 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2574  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  37.11 
 
 		 844 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.969915 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0588  sensory box protein  37.43 
 
 		 463 aa  125  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2160  signal transduction histidine kinase  36.81 
 
 		 263 aa  125  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.31354  normal  0.0264622 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3090  signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 575 aa  125  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0895303  normal  0.0359946 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0554  sensory box protein  37.43 
 
 		 463 aa  125  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0180  signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 		 380 aa  124  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.012775  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5262  signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 		 338 aa  123  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5270  signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 559 aa  123  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 		 602 aa  123  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5589  sensor histidine kinase  24.18 
 
 		 632 aa  122  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2544  Signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 		 489 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0950  Signal transduction histidine kinase protein  36.89 
 
 		 334 aa  121  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3466  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.16 
 
 		 1362 aa  121  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185791  normal  0.474676 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3364  response regulator  35.5 
 
 		 847 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1350  signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 1016 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597121 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5219  signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 512 aa  121  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2394  putative GAF sensor protein  35.5 
 
 		 847 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25898  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>