More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0875 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  100 
 
 		 488 aa  988    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  67.08 
 
 		 503 aa  676    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  89.96 
 
 		 488 aa  899    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  99.39 
 
 		 488 aa  982    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3652  signal transduction histidine kinase  43.78 
 
 		 491 aa  400  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0588  sensory box protein  43.11 
 
 		 463 aa  383  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0554  sensory box protein  43.11 
 
 		 463 aa  385  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4105  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.67 
 
 		 888 aa  274  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  43.67 
 
 		 586 aa  247  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5380  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.77 
 
 		 890 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.622794 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 		 850 aa  240  4e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  37.9 
 
 		 840 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  40.42 
 
 		 759 aa  221  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  39.82 
 
 		 713 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  40.71 
 
 		 713 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  40.71 
 
 		 717 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  36.31 
 
 		 907 aa  210  6e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.67 
 
 		 814 aa  209  7e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486726  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  39.58 
 
 		 872 aa  207  4e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6901  signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 		 465 aa  201  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1350  signal transduction histidine kinase  41.34 
 
 		 1016 aa  195  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597121 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2833  signal transduction histidine kinase  39.65 
 
 		 738 aa  193  6e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2045  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.93 
 
 		 812 aa  193  7e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000148537 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  41.03 
 
 		 1041 aa  192  9e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5219  signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 		 512 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  40.25 
 
 		 897 aa  184  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  34.37 
 
 		 571 aa  182  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2563  signal transduction histidine kinase  39.38 
 
 		 409 aa  182  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  36.53 
 
 		 601 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  41.82 
 
 		 1002 aa  179  7e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2607  signal transduction histidine kinase  31.24 
 
 		 489 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 		 662 aa  177  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4215  signal transduction histidine kinase  44.12 
 
 		 582 aa  176  8e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6934  signal transduction histidine kinase  57.97 
 
 		 375 aa  176  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0476013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  39.5 
 
 		 583 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3048  signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 		 1001 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  39.15 
 
 		 583 aa  173  6.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  39.15 
 
 		 583 aa  173  7.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3416  signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 413 aa  172  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.813211  normal  0.0120926 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5540  sensory box histidine kinase  52.41 
 
 		 411 aa  171  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  41.71 
 
 		 339 aa  170  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1069  signal transduction histidine kinase  45.96 
 
 		 387 aa  170  6e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2344  signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 		 500 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00211814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2700  histidine kinase  57.72 
 
 		 534 aa  167  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0483155  normal  0.0451896 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5515  hypothetical protein  35.35 
 
 		 703 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2896  sensory box histidine kinase/response regulator  56.91 
 
 		 534 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.287234  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 		 639 aa  162  9e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0950  Signal transduction histidine kinase protein  41.08 
 
 		 334 aa  162  9e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5560  signal transduction histidine kinase  36.74 
 
 		 341 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  normal  0.0162393 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4874  histidine kinase  56.2 
 
 		 544 aa  162  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.300744  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  43.75 
 
 		 372 aa  161  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4317  sensor histidine kinase  31.71 
 
 		 499 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01426  histidine kinase  57.89 
 
 		 507 aa  160  5e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.643455  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6933  signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 488 aa  159  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3564  histidine kinase  57.5 
 
 		 544 aa  159  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4511  putative PAS/PAC sensor protein  59.2 
 
 		 164 aa  157  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1888  PAS sensor protein  36.02 
 
 		 326 aa  157  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1395  signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 		 304 aa  157  5.0000000000000005e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.695001  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1649  histidine kinase  54.4 
 
 		 541 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.784453 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1931  histidine kinase  54.4 
 
 		 541 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0167  signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 336 aa  157  6e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3662  alcohol dehydrogenase  36.7 
 
 		 733 aa  156  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.899908  normal  0.588935 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  36.26 
 
 		 728 aa  156  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3478  putative signal transduction histidine kinase  56.34 
 
 		 354 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3978  signal transduction histidine kinase  43.07 
 
 		 577 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6552  signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 489 aa  155  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  42.44 
 
 		 929 aa  155  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3567  histidine kinase  52.03 
 
 		 539 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2357  histidine kinase  55 
 
 		 533 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0826278 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  35.88 
 
 		 728 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2814  putative sensor histidine kinase  40.1 
 
 		 505 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6531  signal transduction histidine kinase  39.9 
 
 		 344 aa  154  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14349  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  28.78 
 
 		 1202 aa  154  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5922  signal transduction histidine kinase  39.9 
 
 		 346 aa  153  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5012  putative sensory transduction histidine kinase  35.4 
 
 		 333 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235153  normal  0.174809 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 		 725 aa  153  8e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3280  PAS sensor protein  58.02 
 
 		 354 aa  152  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3604  signal transduction histidine kinase  58.02 
 
 		 354 aa  152  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3336  histidine kinase  52.89 
 
 		 531 aa  151  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4555  signal transduction histidine kinase  44.91 
 
 		 369 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0880  histidine kinase  53.23 
 
 		 534 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6181  signal transduction histidine kinase  39.04 
 
 		 1191 aa  152  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.299797 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3139  histidine kinase  56.41 
 
 		 533 aa  150  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468681  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6213  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.24 
 
 		 559 aa  150  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2768  signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 333 aa  150  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000214374 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3461  histidine kinase  56.41 
 
 		 533 aa  150  7e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4265  signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 		 930 aa  149  9e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.588648  normal  0.462436 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3897  PAS sensor protein  38.57 
 
 		 930 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240133 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5235  signal transduction histidine kinase  42.29 
 
 		 571 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1390  signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 		 484 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.38029 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3126  signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 		 352 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1581  histidine kinase  51.2 
 
 		 541 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5262  signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 338 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1074  signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 		 481 aa  147  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1333  signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 		 346 aa  147  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0112868 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  41.46 
 
 		 1160 aa  147  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3344  signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 336 aa  146  9e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4368  signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 		 934 aa  145  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523014 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1944  signal transduction histidine kinase  41.1 
 
 		 507 aa  145  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0183597  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4109  signal transduction histidine kinase  41.46 
 
 		 384 aa  145  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0421223  normal  0.437508 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>