More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4368 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4368  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 934 aa  1832    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523014 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4265  signal transduction histidine kinase  84.57 
 
 		 930 aa  1473    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.588648  normal  0.462436 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3897  PAS sensor protein  84.57 
 
 		 930 aa  1473    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240133 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  54.93 
 
 		 1002 aa  304  5.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  58.09 
 
 		 1041 aa  302  2e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1350  signal transduction histidine kinase  58.74 
 
 		 1016 aa  301  3e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597121 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3048  signal transduction histidine kinase  52.96 
 
 		 1001 aa  285  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  54.71 
 
 		 897 aa  284  5.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5539  signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 		 677 aa  280  8e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  52.73 
 
 		 872 aa  278  5e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5219  signal transduction histidine kinase  49.84 
 
 		 512 aa  276  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1117  PAS sensor protein  43.52 
 
 		 500 aa  226  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1267  signal transduction histidine kinase  43.19 
 
 		 500 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 759 aa  223  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5228  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.56 
 
 		 1224 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0118  HWE histidine kinase  38.26 
 
 		 538 aa  222  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  53.55 
 
 		 929 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5220  putative GAF sensor protein  64.91 
 
 		 182 aa  213  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.583285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0315  signal transduction histidine kinase  34.9 
 
 		 901 aa  209  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4345  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 890 aa  209  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2072  signal transduction histidine kinase  59.78 
 
 		 829 aa  205  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0655  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 		 864 aa  204  5e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4536  signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 		 430 aa  197  7e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6181  signal transduction histidine kinase  51.78 
 
 		 1191 aa  192  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.299797 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4535  putative GAF sensor protein  56.11 
 
 		 251 aa  184  6e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2563  signal transduction histidine kinase  43.78 
 
 		 409 aa  180  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.2 
 
 		 1057 aa  178  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.47 
 
 		 1076 aa  178  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.715458 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4812  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  32.56 
 
 		 1423 aa  177  7e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.330918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  47.25 
 
 		 713 aa  177  7e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  46.41 
 
 		 372 aa  177  7e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  45.74 
 
 		 850 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0442  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  37.78 
 
 		 1785 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3416  signal transduction histidine kinase  47.12 
 
 		 413 aa  171  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.813211  normal  0.0120926 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4387  multi-sensor hybrid histidine kinase  56.02 
 
 		 946 aa  171  7e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3496  hypothetical protein  38.02 
 
 		 497 aa  170  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.676733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.45 
 
 		 1550 aa  168  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3974  signal transduction histidine kinase  37.67 
 
 		 635 aa  168  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0272817 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  46.79 
 
 		 717 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  46.79 
 
 		 713 aa  167  8e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5599  signal transduction histidine kinase  47.85 
 
 		 389 aa  167  9e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5560  signal transduction histidine kinase  43.56 
 
 		 341 aa  167  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  normal  0.0162393 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1643  diguanylate cyclase with GAF sensor  51.27 
 
 		 506 aa  166  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.65001 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2985  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  51.25 
 
 		 321 aa  166  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.369432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  43.95 
 
 		 840 aa  164  8.000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02127  sensor histidine kinase  54.32 
 
 		 398 aa  163  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147572  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4215  signal transduction histidine kinase  47.89 
 
 		 582 aa  163  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03205  histidine kinase response regulator hybrid protein  49.37 
 
 		 542 aa  162  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.132161  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1778  PAS  50.66 
 
 		 956 aa  162  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.584017  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4311  signal transduction histidine kinase  40.41 
 
 		 365 aa  162  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.801495  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2810  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.72 
 
 		 998 aa  162  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5586  signal transduction histidine kinase  48.31 
 
 		 390 aa  162  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3696  sensory box histidine kinase/response regulator  37.74 
 
 		 827 aa  160  8e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.652711  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.52 
 
 		 1965 aa  160  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1241  signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 631 aa  160  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0246477 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7959  signal transduction histidine kinase  46.63 
 
 		 416 aa  159  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3072  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.26 
 
 		 689 aa  159  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0145505 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1392  putative sensory transduction histidine kinase  51.25 
 
 		 401 aa  158  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 		 1309 aa  158  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4331  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.83 
 
 		 921 aa  157  9e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.153837  normal  0.0586924 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3828  putative GAF sensor protein  47.53 
 
 		 226 aa  157  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.673739 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0136  diguanylate cyclase  34.42 
 
 		 1428 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  38.74 
 
 		 339 aa  155  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5262  signal transduction histidine kinase  39 
 
 		 338 aa  154  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1395  signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 304 aa  154  8.999999999999999e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.695001  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  41.07 
 
 		 662 aa  154  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  42.45 
 
 		 586 aa  153  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6933  signal transduction histidine kinase  45.67 
 
 		 488 aa  154  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3126  signal transduction histidine kinase  39.83 
 
 		 352 aa  153  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  40.18 
 
 		 571 aa  152  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1074  signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 		 481 aa  152  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  33.25 
 
 		 1561 aa  152  4e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  40.58 
 
 		 488 aa  151  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  40.58 
 
 		 503 aa  151  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3652  signal transduction histidine kinase  40.1 
 
 		 491 aa  151  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2833  signal transduction histidine kinase  46.31 
 
 		 738 aa  151  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  40.18 
 
 		 601 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  39.05 
 
 		 725 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0615  signal transduction histidine kinase  39.9 
 
 		 258 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0063  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.9 
 
 		 837 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2007  putative PAS/PAC sensor protein  28.38 
 
 		 692 aa  149  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.259838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0428  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.11 
 
 		 943 aa  149  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.94781  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1753  sensor histidine kinase  34.6 
 
 		 364 aa  148  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0180  signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 		 380 aa  146  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.012775  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5198  putative PAS/PAC sensor protein  28.85 
 
 		 694 aa  147  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0471  signal transduction histidine kinase  45.85 
 
 		 349 aa  147  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 		 569 aa  146  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2458  diguanylate cyclase  45.25 
 
 		 343 aa  147  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0588  sensory box protein  36.87 
 
 		 463 aa  146  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0934  hypothetical protein  48.39 
 
 		 253 aa  146  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0950  Signal transduction histidine kinase protein  39.9 
 
 		 334 aa  145  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4109  signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 		 384 aa  146  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0421223  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1946  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  41.09 
 
 		 722 aa  145  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146362  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17911  GAF domain-containing protein  48.39 
 
 		 253 aa  146  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.305194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  39.13 
 
 		 488 aa  145  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0554  sensory box protein  36.87 
 
 		 463 aa  146  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1069  signal transduction histidine kinase  39.41 
 
 		 387 aa  146  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3634  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.89 
 
 		 944 aa  145  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103342  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 		 488 aa  145  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0785  diguanylate cyclase with GAF sensor  45.25 
 
 		 367 aa  145  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>