252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3666 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3364  signal transduction histidine kinase  92.91 
 
 		 550 aa  1044    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3666  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 550 aa  1108    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123232  normal  0.85719 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3933  signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 		 579 aa  273  6e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939914  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3444  signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 		 572 aa  238  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.753856 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3978  signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 		 577 aa  183  8.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4605  MCP methyltransferase, CheR-type  43.52 
 
 		 1092 aa  159  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315944  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0218  signal transduction histidine kinase  41.79 
 
 		 867 aa  151  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269004 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0827  signal transduction histidine kinase  42.51 
 
 		 512 aa  147  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6901  signal transduction histidine kinase  38.07 
 
 		 465 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0741  Signal transduction histidine kinase  39.9 
 
 		 498 aa  140  6e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1301  signal transduction histidine kinase  41.53 
 
 		 588 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0678  two-component sensor histidine kinase  37.18 
 
 		 460 aa  135  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2666  signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 		 446 aa  134  5e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653198  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3982  hypothetical protein  36.08 
 
 		 478 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 		 850 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 759 aa  130  8.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2344  signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 		 500 aa  130  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00211814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4826  signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 		 553 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788722  normal  0.27838 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 		 601 aa  128  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3739  MCP methyltransferase, CheR-type  35.59 
 
 		 1045 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 662 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3662  alcohol dehydrogenase  36.6 
 
 		 733 aa  127  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.899908  normal  0.588935 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6531  signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 344 aa  127  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14349  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6933  signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 		 488 aa  126  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 		 713 aa  126  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2229  methylesterase CheB/methylase CheR  35.79 
 
 		 1170 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.840236  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4265  signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 		 930 aa  125  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.588648  normal  0.462436 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0905  putative PAS/PAC sensor protein  35.79 
 
 		 1170 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.968727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  35.64 
 
 		 842 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1628  sensor histidine protein kinase  37 
 
 		 332 aa  125  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.560713  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3126  signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 352 aa  125  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3897  PAS sensor protein  33.76 
 
 		 930 aa  124  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240133 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2814  putative sensor histidine kinase  24.65 
 
 		 505 aa  125  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4317  sensor histidine kinase  37.88 
 
 		 499 aa  124  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0950  Signal transduction histidine kinase protein  35.71 
 
 		 334 aa  124  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 		 503 aa  123  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3338  hypothetical protein  36.45 
 
 		 333 aa  123  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.815822  normal  0.18159 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5219  signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 512 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  35.68 
 
 		 1160 aa  123  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4368  signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 		 934 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523014 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  39.05 
 
 		 586 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5560  signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 341 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  normal  0.0162393 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2264  putative PAS/PAC sensor protein  33.68 
 
 		 1165 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.620072  normal  0.0600346 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3313  hypothetical protein  36.92 
 
 		 480 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.29262 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1074  signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 		 481 aa  121  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 339 aa  121  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2030  putative sensor histidine kinase  38.1 
 
 		 313 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1069  signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 		 387 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6211  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  36.22 
 
 		 1061 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.820077  normal  0.703655 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3755  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  35.53 
 
 		 1063 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 		 571 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  34.85 
 
 		 1190 aa  120  6e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1333  signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 346 aa  120  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0112868 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0741  signal transduction histidine kinase  37.62 
 
 		 356 aa  120  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  32.64 
 
 		 1027 aa  120  7.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5922  signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 		 346 aa  120  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 		 488 aa  120  9e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0180  signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 		 380 aa  119  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.012775  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  33.82 
 
 		 849 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5235  signal transduction histidine kinase  39.04 
 
 		 571 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0825  signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 		 455 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111815  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 840 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  36.08 
 
 		 728 aa  118  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5262  signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 		 338 aa  118  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 907 aa  118  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  37.26 
 
 		 872 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 		 728 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2563  signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 409 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4109  signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 384 aa  117  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0421223  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2544  Signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 489 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5756  signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 		 347 aa  117  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.170851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1395  signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 		 304 aa  116  7.999999999999999e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.695001  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1241  signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 		 631 aa  116  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0246477 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2764  HWE histidine kinase  36.98 
 
 		 234 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6181  signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 1191 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.299797 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 488 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  36.82 
 
 		 488 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 372 aa  115  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0007  signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 482 aa  114  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.489749  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2991  signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 234 aa  114  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.888175 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 929 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 		 713 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1944  signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 507 aa  113  8.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0183597  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  35.61 
 
 		 717 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3264  HWE histidine kinase  32.77 
 
 		 261 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440778 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5593  two component sensor kinase  36.6 
 
 		 352 aa  113  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5539  signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 677 aa  112  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  31.48 
 
 		 856 aa  111  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1377  putative sensor histidine kinase  29.86 
 
 		 561 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351027  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3090  signal transduction histidine kinase  28.01 
 
 		 575 aa  111  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0895303  normal  0.0359946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  31.55 
 
 		 583 aa  110  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 		 583 aa  110  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1551  signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 642 aa  110  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518292 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0615  signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 258 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 		 583 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  34.67 
 
 		 1167 aa  110  8.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3652  signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 491 aa  110  9.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3364  response regulator  31.19 
 
 		 847 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0167  signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 		 336 aa  108  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2394  putative GAF sensor protein  31.19 
 
 		 847 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25898  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>