More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3652 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0588  sensory box protein  70.48 
 
 
463 aa  694    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3652  signal transduction histidine kinase  100 
 
 
491 aa  1016    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0554  sensory box protein  70.48 
 
 
463 aa  693    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  44.64 
 
 
488 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  43.78 
 
 
488 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  43.78 
 
 
488 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
503 aa  386  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4105  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.24 
 
 
888 aa  218  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5380  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.98 
 
 
890 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.622794 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 
586 aa  211  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 
850 aa  205  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  37.62 
 
 
872 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  35 
 
 
713 aa  196  9e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 
840 aa  190  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  35.29 
 
 
717 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
713 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5219  signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 
512 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2344  signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 
500 aa  182  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00211814  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 
759 aa  180  5.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 
907 aa  178  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2833  signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 
738 aa  176  9e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1350  signal transduction histidine kinase  39.84 
 
 
1016 aa  171  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597121 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2563  signal transduction histidine kinase  42.08 
 
 
409 aa  169  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  32.77 
 
 
1041 aa  169  7e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3048  signal transduction histidine kinase  42.39 
 
 
1001 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143163  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5515  hypothetical protein  35.64 
 
 
703 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 
814 aa  162  9e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486726  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4215  signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 
582 aa  162  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 
1002 aa  162  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6901  signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 
465 aa  161  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5560  signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
341 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  normal  0.0162393 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  39.04 
 
 
897 aa  160  6e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2607  signal transduction histidine kinase  26.72 
 
 
489 aa  159  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436893  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 
372 aa  159  9e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4317  sensor histidine kinase  31.77 
 
 
499 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305311  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0825  signal transduction histidine kinase  28.07 
 
 
455 aa  158  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111815  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5540  sensory box histidine kinase  58.4 
 
 
411 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5262  signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 
338 aa  156  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0118  HWE histidine kinase  43.5 
 
 
538 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1069  signal transduction histidine kinase  38.25 
 
 
387 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6552  signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 
489 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 
601 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 
725 aa  155  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3662  alcohol dehydrogenase  32.58 
 
 
733 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.899908  normal  0.588935 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1395  signal transduction histidine kinase  38.62 
 
 
304 aa  154  4e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.695001  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3126  signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 
352 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2045  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.59 
 
 
812 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000148537 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
339 aa  152  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0315  signal transduction histidine kinase  42.29 
 
 
901 aa  152  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6181  signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 
1191 aa  152  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.299797 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5539  signal transduction histidine kinase  43.22 
 
 
677 aa  151  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2544  Signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 
489 aa  151  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4368  signal transduction histidine kinase  40.1 
 
 
934 aa  150  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.523014 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0678  two-component sensor histidine kinase  27.98 
 
 
460 aa  150  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 
662 aa  150  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3416  signal transduction histidine kinase  38.82 
 
 
413 aa  150  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.813211  normal  0.0120926 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 
929 aa  150  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2814  putative sensor histidine kinase  34.93 
 
 
505 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467962  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  35.48 
 
 
583 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0180  signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 
380 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.012775  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 
583 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1074  signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 
481 aa  147  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4265  signal transduction histidine kinase  39.52 
 
 
930 aa  147  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.588648  normal  0.462436 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4874  histidine kinase  55.26 
 
 
544 aa  146  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.300744  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 
583 aa  147  6e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 
571 aa  147  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0167  signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 
336 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6213  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.64 
 
 
559 aa  146  9e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3897  PAS sensor protein  39.52 
 
 
930 aa  146  9e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.240133 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0880  histidine kinase  54.17 
 
 
534 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0615  signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 
258 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  29.41 
 
 
1167 aa  145  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5263  hypothetical protein  47.55 
 
 
345 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2229  methylesterase CheB/methylase CheR  37.04 
 
 
1170 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.840236  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 
639 aa  144  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1301  signal transduction histidine kinase  38.92 
 
 
588 aa  143  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6531  signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 
344 aa  143  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14349  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5922  signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 
346 aa  143  7e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151215  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2700  histidine kinase  54.62 
 
 
534 aa  142  9e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0483155  normal  0.0451896 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5235  signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 
571 aa  143  9e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878632  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2896  sensory box histidine kinase/response regulator  52.94 
 
 
534 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.287234  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1390  signal transduction histidine kinase  25.2 
 
 
484 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.38029 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0507  signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 
336 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4109  signal transduction histidine kinase  38.66 
 
 
384 aa  142  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0421223  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0905  putative PAS/PAC sensor protein  36.57 
 
 
1170 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.968727 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5589  sensor histidine kinase  37.72 
 
 
632 aa  141  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2264  putative PAS/PAC sensor protein  35.24 
 
 
1165 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.620072  normal  0.0600346 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0827  signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 
512 aa  141  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3567  histidine kinase  52.1 
 
 
539 aa  141  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464366  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6933  signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 
488 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223762  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1333  signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 
346 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0112868 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0741  Signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 
498 aa  140  6e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6934  signal transduction histidine kinase  48.84 
 
 
375 aa  140  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0476013  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3139  histidine kinase  48.51 
 
 
533 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468681  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4826  signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 
553 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788722  normal  0.27838 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3344  signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 
336 aa  139  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1581  histidine kinase  50 
 
 
541 aa  139  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3564  histidine kinase  52.63 
 
 
544 aa  139  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3280  PAS sensor protein  45.28 
 
 
354 aa  139  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2357  histidine kinase  55.26 
 
 
533 aa  139  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0826278 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>