More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6181 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  59.75 
 
 		 929 aa  831    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6181  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 1191 aa  2368    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.299797 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  34.73 
 
 		 1041 aa  385  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3048  signal transduction histidine kinase  34.49 
 
 		 1001 aa  384  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1350  signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 1016 aa  381  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597121 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 1002 aa  376  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2072  signal transduction histidine kinase  46.92 
 
 		 829 aa  353  1e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1778  PAS  45.12 
 
 		 956 aa  329  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.584017  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2810  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.15 
 
 		 998 aa  329  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0146  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.96 
 
 		 1381 aa  276  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.436687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3335  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.75 
 
 		 942 aa  251  5e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3662  alcohol dehydrogenase  30.43 
 
 		 733 aa  228  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.899908  normal  0.588935 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  58.76 
 
 		 872 aa  228  6e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5228  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.61 
 
 		 1224 aa  228  6e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2070  signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 		 358 aa  222  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.315094  normal  0.359428 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4215  signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 582 aa  220  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  50.83 
 
 		 897 aa  217  9e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0118  HWE histidine kinase  41.74 
 
 		 538 aa  214  9e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 		 725 aa  207  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2563  signal transduction histidine kinase  40.24 
 
 		 409 aa  206  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3696  sensory box histidine kinase/response regulator  67.65 
 
 		 827 aa  204  7e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.652711  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6212  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.12 
 
 		 999 aa  196  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0442  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  30.28 
 
 		 1785 aa  193  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1117  PAS sensor protein  58.64 
 
 		 500 aa  193  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4368  signal transduction histidine kinase  61.25 
 
 		 934 aa  190  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523014 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 		 372 aa  191  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1267  signal transduction histidine kinase  58.02 
 
 		 500 aa  190  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4265  signal transduction histidine kinase  51.18 
 
 		 930 aa  189  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.588648  normal  0.462436 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3897  PAS sensor protein  34 
 
 		 930 aa  189  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240133 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6450  signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 		 635 aa  188  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5220  putative GAF sensor protein  58.58 
 
 		 182 aa  188  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.583285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 		 759 aa  187  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  36.05 
 
 		 728 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  35.76 
 
 		 728 aa  185  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 713 aa  182  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 		 586 aa  180  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5176  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  27.62 
 
 		 1404 aa  174  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.190634 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  29.64 
 
 		 1561 aa  173  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5560  signal transduction histidine kinase  38.77 
 
 		 341 aa  172  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  normal  0.0162393 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  36.31 
 
 		 662 aa  172  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  29.26 
 
 		 583 aa  172  5e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 		 583 aa  171  6e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2607  signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 489 aa  171  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 601 aa  171  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 		 583 aa  170  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 		 503 aa  169  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  33.25 
 
 		 571 aa  169  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  37.57 
 
 		 713 aa  169  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  37.57 
 
 		 717 aa  169  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 		 850 aa  169  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0655  multi-sensor hybrid histidine kinase  59.87 
 
 		 864 aa  168  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5262  signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 		 338 aa  168  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2281  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.57 
 
 		 891 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00177504  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.44 
 
 		 1965 aa  166  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0180  signal transduction histidine kinase  41.7 
 
 		 380 aa  166  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.012775  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  37.88 
 
 		 840 aa  166  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3043  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.26 
 
 		 1122 aa  165  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000641159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2985  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  53.46 
 
 		 321 aa  165  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.369432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  50 
 
 		 1550 aa  164  7e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 		 3706 aa  164  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 		 907 aa  163  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1417  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 1055 aa  162  3e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0587691  normal  0.569805 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5539  signal transduction histidine kinase  49.76 
 
 		 677 aa  162  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5586  signal transduction histidine kinase  51.85 
 
 		 390 aa  162  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6933  signal transduction histidine kinase  46.82 
 
 		 488 aa  162  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03205  histidine kinase response regulator hybrid protein  41.18 
 
 		 542 aa  161  8e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.132161  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.03 
 
 		 943 aa  161  8e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7959  signal transduction histidine kinase  51.85 
 
 		 416 aa  160  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4812  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  43.55 
 
 		 1423 aa  159  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.330918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5922  signal transduction histidine kinase  42.08 
 
 		 346 aa  158  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5599  signal transduction histidine kinase  52.17 
 
 		 389 aa  158  7e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3126  signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 		 352 aa  158  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1700  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  44.32 
 
 		 767 aa  158  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3974  signal transduction histidine kinase  41.24 
 
 		 635 aa  157  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0272817 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0471  signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 		 349 aa  157  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 		 904 aa  157  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5219  signal transduction histidine kinase  45.27 
 
 		 512 aa  155  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 		 488 aa  155  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3978  signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 		 577 aa  154  8.999999999999999e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6531  signal transduction histidine kinase  40.59 
 
 		 344 aa  154  8.999999999999999e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14349  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1643  diguanylate cyclase with GAF sensor  47.06 
 
 		 506 aa  154  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.65001 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3264  HWE histidine kinase  43 
 
 		 261 aa  153  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440778 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0315  signal transduction histidine kinase  48.28 
 
 		 901 aa  153  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0136  diguanylate cyclase  42.86 
 
 		 1428 aa  153  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0615  signal transduction histidine kinase  44.29 
 
 		 258 aa  152  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  39.04 
 
 		 488 aa  152  5e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3652  signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 		 491 aa  152  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  39.04 
 
 		 488 aa  152  5e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0785  diguanylate cyclase with GAF sensor  48.78 
 
 		 367 aa  151  6e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6901  signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 465 aa  151  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4535  putative GAF sensor protein  47.93 
 
 		 251 aa  151  8e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0364  PAS sensor protein  30.41 
 
 		 501 aa  151  8e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.140778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3072  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.64 
 
 		 689 aa  150  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0145505 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02127  sensor histidine kinase  47.09 
 
 		 398 aa  150  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147572  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1395  signal transduction histidine kinase  41.74 
 
 		 304 aa  150  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.695001  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1392  putative sensory transduction histidine kinase  48.41 
 
 		 401 aa  150  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2007  putative PAS/PAC sensor protein  28.93 
 
 		 692 aa  150  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.259838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 		 339 aa  150  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4311  signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 365 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.801495  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15571  GAF domain-containing protein  47.44 
 
 		 249 aa  150  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0414818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>