More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3264 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3264  HWE histidine kinase  100 
 
 		 261 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440778 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2160  signal transduction histidine kinase  69.14 
 
 		 263 aa  350  1e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.31354  normal  0.0264622 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0615  signal transduction histidine kinase  66.38 
 
 		 258 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1153  signal transduction histidine kinase  64.98 
 
 		 275 aa  315  5e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.614752  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2176  putative signal transduction histidine kinase  55.93 
 
 		 411 aa  268  8e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  44.02 
 
 		 872 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  43.98 
 
 		 713 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2563  signal transduction histidine kinase  44.91 
 
 		 409 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  45.15 
 
 		 850 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4215  signal transduction histidine kinase  44.71 
 
 		 582 aa  159  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1074  signal transduction histidine kinase  40.7 
 
 		 481 aa  158  7e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  44.66 
 
 		 840 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 		 372 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1301  signal transduction histidine kinase  45.02 
 
 		 588 aa  155  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  41.83 
 
 		 713 aa  154  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  43.46 
 
 		 586 aa  154  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  41.83 
 
 		 717 aa  154  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5270  signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 		 559 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1069  signal transduction histidine kinase  45.13 
 
 		 387 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6181  signal transduction histidine kinase  43 
 
 		 1191 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.299797 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  41.83 
 
 		 929 aa  152  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  43.33 
 
 		 897 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5235  signal transduction histidine kinase  42.92 
 
 		 571 aa  151  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  40.98 
 
 		 339 aa  151  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1551  signal transduction histidine kinase  40.45 
 
 		 642 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518292 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5219  signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 512 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 725 aa  149  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1395  signal transduction histidine kinase  40.28 
 
 		 304 aa  149  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.695001  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  40.19 
 
 		 759 aa  149  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  38.73 
 
 		 1027 aa  149  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3662  alcohol dehydrogenase  44.16 
 
 		 733 aa  148  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.899908  normal  0.588935 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6531  signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 		 344 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14349  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  39.71 
 
 		 488 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5922  signal transduction histidine kinase  37.62 
 
 		 346 aa  146  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151215  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6933  signal transduction histidine kinase  42.23 
 
 		 488 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 		 488 aa  144  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1333  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 346 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0112868 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  38.24 
 
 		 488 aa  144  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  40.49 
 
 		 503 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  42 
 
 		 728 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  42 
 
 		 728 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1350  signal transduction histidine kinase  40.48 
 
 		 1016 aa  142  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597121 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  40.48 
 
 		 1041 aa  141  9e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3126  signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 		 352 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5560  signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 341 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  normal  0.0162393 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3978  signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 		 577 aa  139  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0588  sensory box protein  34.78 
 
 		 463 aa  139  4.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 		 571 aa  139  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0554  sensory box protein  34.78 
 
 		 463 aa  139  6e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4368  signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 934 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523014 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2833  signal transduction histidine kinase  42.4 
 
 		 738 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0471  signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 		 349 aa  138  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5262  signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 		 338 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4109  signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 		 384 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0421223  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4265  signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 		 930 aa  136  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.588648  normal  0.462436 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4536  signal transduction histidine kinase  40.7 
 
 		 430 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2814  putative sensor histidine kinase  39.6 
 
 		 505 aa  135  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  37.91 
 
 		 601 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 		 662 aa  133  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  41.43 
 
 		 1002 aa  133  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3897  PAS sensor protein  36.62 
 
 		 930 aa  133  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240133 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 602 aa  132  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 907 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6901  signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 		 465 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1377  putative sensor histidine kinase  38.86 
 
 		 561 aa  131  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351027  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3652  signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 491 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0741  signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 356 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6552  signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 		 489 aa  129  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2607  signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 		 489 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0950  Signal transduction histidine kinase protein  40.7 
 
 		 334 aa  129  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2030  putative sensor histidine kinase  41.18 
 
 		 313 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  33.9 
 
 		 842 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 583 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  35.71 
 
 		 583 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3048  signal transduction histidine kinase  40.95 
 
 		 1001 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2229  methylesterase CheB/methylase CheR  33.6 
 
 		 1170 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.840236  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1337  signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 356 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.552854 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  35.82 
 
 		 849 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0905  putative PAS/PAC sensor protein  33.6 
 
 		 1170 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.968727 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 583 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2264  putative PAS/PAC sensor protein  36.13 
 
 		 1165 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.620072  normal  0.0600346 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  37.68 
 
 		 1167 aa  125  5e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2344  signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 500 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00211814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4618  signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 		 454 aa  124  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.723174  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0007  signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 482 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.489749  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1628  sensor histidine protein kinase  32.37 
 
 		 332 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.560713  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  33.04 
 
 		 1160 aa  122  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0487  signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 555 aa  122  6e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  33.07 
 
 		 856 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0180  signal transduction histidine kinase  37.82 
 
 		 380 aa  122  6e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.012775  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5539  signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 		 677 aa  121  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  36.63 
 
 		 1190 aa  121  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0678  two-component sensor histidine kinase  39.39 
 
 		 460 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1944  signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 507 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0183597  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0218  signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 		 867 aa  119  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269004 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1753  sensor histidine kinase  37.37 
 
 		 364 aa  119  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1390  signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 484 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.38029 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3982  hypothetical protein  33.17 
 
 		 478 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0315  signal transduction histidine kinase  39.2 
 
 		 901 aa  118  9e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5005  signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 334 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>