More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1301 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1301  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 588 aa  1136    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5235  signal transduction histidine kinase  58.94 
 
 		 571 aa  586  1e-166  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5589  sensor histidine kinase  36.54 
 
 		 632 aa  276  5e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4826  signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 553 aa  249  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788722  normal  0.27838 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3978  signal transduction histidine kinase  38.56 
 
 		 577 aa  191  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  51.74 
 
 		 586 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6531  signal transduction histidine kinase  49.23 
 
 		 344 aa  174  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14349  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5922  signal transduction histidine kinase  49.26 
 
 		 346 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0487  signal transduction histidine kinase  48.99 
 
 		 555 aa  171  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  44.66 
 
 		 372 aa  170  8e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2563  signal transduction histidine kinase  48.04 
 
 		 409 aa  167  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  43.33 
 
 		 759 aa  167  6.9999999999999995e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  41.51 
 
 		 339 aa  166  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  46.94 
 
 		 840 aa  165  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  46.23 
 
 		 713 aa  165  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1074  signal transduction histidine kinase  45.18 
 
 		 481 aa  164  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1333  signal transduction histidine kinase  43.93 
 
 		 346 aa  164  6e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0112868 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  45.41 
 
 		 850 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1377  putative sensor histidine kinase  46.84 
 
 		 561 aa  163  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351027  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  42.72 
 
 		 725 aa  161  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0471  signal transduction histidine kinase  45.36 
 
 		 349 aa  160  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3982  hypothetical protein  44.61 
 
 		 478 aa  160  7e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  43.27 
 
 		 907 aa  159  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  47.64 
 
 		 713 aa  158  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  47.64 
 
 		 717 aa  158  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1551  signal transduction histidine kinase  47.39 
 
 		 642 aa  157  7e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518292 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3264  HWE histidine kinase  45.02 
 
 		 261 aa  156  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440778 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  42.8 
 
 		 503 aa  156  9e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4109  signal transduction histidine kinase  46.6 
 
 		 384 aa  156  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0421223  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3126  signal transduction histidine kinase  41.98 
 
 		 352 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6933  signal transduction histidine kinase  43.81 
 
 		 488 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  41.71 
 
 		 842 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2264  putative PAS/PAC sensor protein  44.66 
 
 		 1165 aa  150  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.620072  normal  0.0600346 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2833  signal transduction histidine kinase  46.84 
 
 		 738 aa  150  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6901  signal transduction histidine kinase  43.43 
 
 		 465 aa  150  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2814  putative sensor histidine kinase  43.81 
 
 		 505 aa  150  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  44.1 
 
 		 488 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0315  signal transduction histidine kinase  47.2 
 
 		 901 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  44.12 
 
 		 872 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  41.44 
 
 		 601 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5262  signal transduction histidine kinase  42.79 
 
 		 338 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  39.09 
 
 		 1027 aa  147  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  41.63 
 
 		 662 aa  147  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1069  signal transduction histidine kinase  42.6 
 
 		 387 aa  147  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3662  alcohol dehydrogenase  40.69 
 
 		 733 aa  146  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.899908  normal  0.588935 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  43.07 
 
 		 728 aa  146  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0825  signal transduction histidine kinase  43.28 
 
 		 455 aa  146  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111815  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5560  signal transduction histidine kinase  40.44 
 
 		 341 aa  146  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  normal  0.0162393 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  43.07 
 
 		 728 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6552  signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 		 489 aa  145  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  40.98 
 
 		 929 aa  144  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1395  signal transduction histidine kinase  42.16 
 
 		 304 aa  144  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.695001  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2229  methylesterase CheB/methylase CheR  42.72 
 
 		 1170 aa  144  5e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.840236  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  41.44 
 
 		 846 aa  144  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3652  signal transduction histidine kinase  38.92 
 
 		 491 aa  143  7e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  43.37 
 
 		 488 aa  144  7e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  43.37 
 
 		 488 aa  143  7e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2160  signal transduction histidine kinase  43.16 
 
 		 263 aa  143  8e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.31354  normal  0.0264622 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  41.12 
 
 		 571 aa  143  9e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  41.26 
 
 		 1190 aa  142  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0905  putative PAS/PAC sensor protein  42.23 
 
 		 1170 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.968727 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2070  signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 		 358 aa  142  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.315094  normal  0.359428 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0678  two-component sensor histidine kinase  43.84 
 
 		 460 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4265  signal transduction histidine kinase  42.72 
 
 		 930 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.588648  normal  0.462436 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0615  signal transduction histidine kinase  42.05 
 
 		 258 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2607  signal transduction histidine kinase  40.98 
 
 		 489 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4215  signal transduction histidine kinase  46.12 
 
 		 582 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2544  Signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 		 489 aa  139  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2072  signal transduction histidine kinase  38.85 
 
 		 829 aa  138  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3364  signal transduction histidine kinase  43.72 
 
 		 550 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3313  hypothetical protein  39.32 
 
 		 480 aa  139  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.29262 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4317  sensor histidine kinase  38.92 
 
 		 499 aa  139  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5515  hypothetical protein  36.6 
 
 		 703 aa  139  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4368  signal transduction histidine kinase  41.38 
 
 		 934 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523014 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3897  PAS sensor protein  42.23 
 
 		 930 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240133 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2574  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  40 
 
 		 844 aa  137  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.969915 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  41.04 
 
 		 583 aa  137  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  41.04 
 
 		 583 aa  137  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1753  sensor histidine kinase  40.67 
 
 		 364 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3666  signal transduction histidine kinase  41.53 
 
 		 550 aa  137  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123232  normal  0.85719 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5539  signal transduction histidine kinase  44.16 
 
 		 677 aa  137  7.000000000000001e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2586  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  41.54 
 
 		 847 aa  136  8e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251983 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 		 583 aa  137  8e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3364  response regulator  41.15 
 
 		 847 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0588  sensory box protein  35.12 
 
 		 463 aa  136  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5270  signal transduction histidine kinase  42.13 
 
 		 559 aa  136  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0554  sensory box protein  35.12 
 
 		 463 aa  136  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2394  putative GAF sensor protein  41.15 
 
 		 847 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0827  signal transduction histidine kinase  39.81 
 
 		 512 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0180  signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 		 380 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.012775  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6181  signal transduction histidine kinase  42.35 
 
 		 1191 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.299797 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0950  Signal transduction histidine kinase protein  40.47 
 
 		 334 aa  135  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1628  sensor histidine protein kinase  37.69 
 
 		 332 aa  135  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.560713  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  41.95 
 
 		 849 aa  135  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1390  signal transduction histidine kinase  40.51 
 
 		 484 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.38029 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1888  PAS sensor protein  41.21 
 
 		 326 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3416  signal transduction histidine kinase  44.95 
 
 		 413 aa  134  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.813211  normal  0.0120926 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2385  phytochrome:GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:HWE histidine kinase  41.8 
 
 		 1003 aa  134  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.460117  normal  0.215255 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5219  signal transduction histidine kinase  43.72 
 
 		 512 aa  134  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  42.49 
 
 		 1160 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>