More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5584 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 586 aa  1182    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  38.46 
 
 		 872 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  41.21 
 
 		 759 aa  315  9.999999999999999e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3048  signal transduction histidine kinase  41.38 
 
 		 1001 aa  295  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  41.47 
 
 		 1041 aa  291  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1350  signal transduction histidine kinase  41.47 
 
 		 1016 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597121 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  42 
 
 		 850 aa  290  6e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  40.95 
 
 		 897 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  42.48 
 
 		 840 aa  286  5e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  42.03 
 
 		 1002 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  48.3 
 
 		 503 aa  278  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  47.35 
 
 		 713 aa  264  3e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  45.83 
 
 		 488 aa  258  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  47.01 
 
 		 713 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  47.01 
 
 		 717 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  43.99 
 
 		 488 aa  249  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  43.67 
 
 		 488 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 583 aa  244  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  36.97 
 
 		 583 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 		 601 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 		 583 aa  240  6.999999999999999e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4215  signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 		 582 aa  238  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 662 aa  230  6e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2833  signal transduction histidine kinase  47.01 
 
 		 738 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0540  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.52 
 
 		 1089 aa  219  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2563  signal transduction histidine kinase  42.3 
 
 		 409 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  40.3 
 
 		 907 aa  216  9e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 571 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 		 725 aa  213  5.999999999999999e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6901  signal transduction histidine kinase  39.82 
 
 		 465 aa  212  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3652  signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 		 491 aa  211  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3662  alcohol dehydrogenase  34.02 
 
 		 733 aa  210  7e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.899908  normal  0.588935 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 		 929 aa  210  7e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0471  signal transduction histidine kinase  43.28 
 
 		 349 aa  204  5e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  40.84 
 
 		 372 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0588  sensory box protein  32.91 
 
 		 463 aa  200  6e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0554  sensory box protein  35.58 
 
 		 463 aa  200  7e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1074  signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 		 481 aa  196  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 		 728 aa  196  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  36.96 
 
 		 728 aa  194  4e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3126  signal transduction histidine kinase  40.96 
 
 		 352 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5219  signal transduction histidine kinase  40.24 
 
 		 512 aa  189  9e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2344  signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 		 500 aa  189  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00211814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  39.04 
 
 		 639 aa  186  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5235  signal transduction histidine kinase  46.45 
 
 		 571 aa  184  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2607  signal transduction histidine kinase  38.07 
 
 		 489 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1301  signal transduction histidine kinase  51.74 
 
 		 588 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4317  sensor histidine kinase  35.8 
 
 		 499 aa  182  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2814  putative sensor histidine kinase  45.41 
 
 		 505 aa  180  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6181  signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 		 1191 aa  180  7e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.299797 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6933  signal transduction histidine kinase  44.04 
 
 		 488 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0827  signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 512 aa  178  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  40.97 
 
 		 339 aa  178  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1069  signal transduction histidine kinase  47.25 
 
 		 387 aa  176  8e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5515  hypothetical protein  37.22 
 
 		 703 aa  176  8e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  35.28 
 
 		 1202 aa  176  9e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3978  signal transduction histidine kinase  46.7 
 
 		 577 aa  175  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  35.59 
 
 		 1167 aa  173  6.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2544  Signal transduction histidine kinase  39.83 
 
 		 489 aa  170  5e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1213  signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 		 603 aa  170  7e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5560  signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 		 341 aa  170  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  normal  0.0162393 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  35.92 
 
 		 1160 aa  167  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 		 602 aa  167  6.9999999999999995e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0798  PAS sensor protein  30.43 
 
 		 624 aa  166  8e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6552  signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 		 489 aa  166  9e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4109  signal transduction histidine kinase  44.55 
 
 		 384 aa  165  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0421223  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1395  signal transduction histidine kinase  42.24 
 
 		 304 aa  165  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.695001  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  45.58 
 
 		 1190 aa  164  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4271  histidine kinase  34.78 
 
 		 692 aa  163  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal  0.0625064 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.36 
 
 		 1068 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0640729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0615  signal transduction histidine kinase  40.51 
 
 		 258 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1944  signal transduction histidine kinase  40.24 
 
 		 507 aa  161  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0183597  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0198  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.33 
 
 		 1344 aa  159  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.592297 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2666  signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 		 446 aa  159  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653198  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3416  signal transduction histidine kinase  39.62 
 
 		 413 aa  159  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.813211  normal  0.0120926 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0825  signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 		 455 aa  157  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111815  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5262  signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 		 338 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3264  HWE histidine kinase  43.46 
 
 		 261 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440778 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1153  signal transduction histidine kinase  38.66 
 
 		 275 aa  154  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.614752  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1377  putative sensor histidine kinase  45.13 
 
 		 561 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351027  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1333  signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 		 346 aa  152  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0112868 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1551  signal transduction histidine kinase  46.26 
 
 		 642 aa  152  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518292 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4368  signal transduction histidine kinase  42.65 
 
 		 934 aa  153  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523014 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1337  signal transduction histidine kinase  40.1 
 
 		 356 aa  152  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.552854 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4265  signal transduction histidine kinase  40.47 
 
 		 930 aa  152  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.588648  normal  0.462436 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5922  signal transduction histidine kinase  41.15 
 
 		 346 aa  152  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3897  PAS sensor protein  40.47 
 
 		 930 aa  151  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240133 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0315  signal transduction histidine kinase  46.94 
 
 		 901 aa  150  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.23 
 
 		 1501 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5794  signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 		 717 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.63151  normal  0.343732 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2072  signal transduction histidine kinase  45.6 
 
 		 829 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0950  Signal transduction histidine kinase protein  46.77 
 
 		 334 aa  149  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5539  signal transduction histidine kinase  46.39 
 
 		 677 aa  148  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1753  sensor histidine kinase  38.94 
 
 		 364 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1901  two-component sensor histidine kinase  29.83 
 
 		 931 aa  146  9e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0313083  normal  0.0871787 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3982  hypothetical protein  37.62 
 
 		 478 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0743  HWE histidine kinase  36.8 
 
 		 483 aa  146  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2815  sensory box histidine kinase  30.13 
 
 		 749 aa  145  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0118  HWE histidine kinase  45.5 
 
 		 538 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2176  putative signal transduction histidine kinase  42.5 
 
 		 411 aa  145  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>