More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0798 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0798  PAS sensor protein  100 
 
 		 624 aa  1269    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0108  PAS sensor protein  47.92 
 
 		 620 aa  527  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4799  signal transduction histidine kinase  47.76 
 
 		 620 aa  523  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1267  signal transduction histidine kinase  71.21 
 
 		 500 aa  484  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1117  PAS sensor protein  70.91 
 
 		 500 aa  481  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6450  signal transduction histidine kinase  54.24 
 
 		 635 aa  458  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2103  PAS sensor protein  42.33 
 
 		 655 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365518 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2379  signal transduction histidine kinase  42.88 
 
 		 655 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2055  signal transduction histidine kinase  41.62 
 
 		 655 aa  429  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.429948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4235  signal transduction histidine kinase  52.14 
 
 		 496 aa  334  3e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.942064  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0851  signal transduction histidine kinase  55.06 
 
 		 1124 aa  327  6e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.596817 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6264  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  50.72 
 
 		 1163 aa  326  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0876  signal transduction histidine kinase  52.77 
 
 		 1132 aa  323  7e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.61927  normal  0.464028 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0915  PAS sensor protein  52.77 
 
 		 1132 aa  323  7e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.476466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2364  signal transduction histidine kinase  42.02 
 
 		 633 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.932865  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  38.8 
 
 		 1202 aa  261  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1213  signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 		 603 aa  251  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3000  signal transduction histidine kinase  43.97 
 
 		 495 aa  247  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1297  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  42.94 
 
 		 1168 aa  239  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5794  signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 717 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.63151  normal  0.343732 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4215  signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 582 aa  228  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7977  signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 1039 aa  228  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  32.69 
 
 		 872 aa  219  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0471  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.56 
 
 		 1225 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.221036  normal  0.153067 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0437  PAS sensor protein  32.09 
 
 		 1225 aa  211  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719852  normal  0.440419 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1350  signal transduction histidine kinase  33.27 
 
 		 1016 aa  209  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597121 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0508  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.4 
 
 		 1215 aa  209  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.722414  normal  0.07841 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5237  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  34.25 
 
 		 1324 aa  209  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.395635 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3048  signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 		 1001 aa  206  7e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  33.27 
 
 		 1041 aa  206  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  30.26 
 
 		 728 aa  205  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 		 1002 aa  203  8e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 		 897 aa  203  9e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  30.06 
 
 		 728 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3662  alcohol dehydrogenase  30.2 
 
 		 733 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.899908  normal  0.588935 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0149  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.05 
 
 		 957 aa  192  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3634  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.7 
 
 		 944 aa  192  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103342  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0825  signal transduction histidine kinase  33.13 
 
 		 455 aa  182  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111815  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.27 
 
 		 1057 aa  180  9e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 759 aa  177  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4542  PAS sensor protein  35.09 
 
 		 1096 aa  177  6e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220973  normal  0.0899725 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5910  putative PAS/PAC sensor protein  36.45 
 
 		 739 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5002  signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 		 1096 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.33 
 
 		 1076 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.715458 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.73 
 
 		 941 aa  172  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4271  histidine kinase  35.76 
 
 		 692 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal  0.0625064 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3626  signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 		 792 aa  172  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0746201  normal  0.0102319 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5055  signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 		 1111 aa  172  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2666  signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 		 446 aa  171  5e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653198  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 		 662 aa  169  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0114  Signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 939 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.153209 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.98 
 
 		 943 aa  167  8e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 586 aa  166  9e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.05 
 
 		 1406 aa  166  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2512  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.54 
 
 		 798 aa  163  9e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.505413  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5545  two component sensor kinase/response regulator hybrid  29.19 
 
 		 1036 aa  162  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 		 840 aa  162  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  26.34 
 
 		 725 aa  161  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4625  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.07 
 
 		 1092 aa  159  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 		 601 aa  156  9e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 713 aa  156  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 		 850 aa  156  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4259  PAS sensor protein  29.36 
 
 		 1086 aa  155  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.127746 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1809  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.94 
 
 		 927 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.295908 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4776  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.33 
 
 		 1086 aa  154  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 		 583 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 		 929 aa  153  8e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1490  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.08 
 
 		 835 aa  153  8.999999999999999e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0364  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.92 
 
 		 1013 aa  152  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.39 
 
 		 1331 aa  151  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3360  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.45 
 
 		 1068 aa  150  5e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3055  putative PAS/PAC sensor protein  52.76 
 
 		 561 aa  150  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.618146  normal  0.669916 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 713 aa  150  6e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  30.36 
 
 		 717 aa  150  7e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  27.63 
 
 		 583 aa  148  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 		 583 aa  147  8.000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0827  signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 		 512 aa  143  7e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3083  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.47 
 
 		 845 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 		 372 aa  140  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2200  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 		 678 aa  140  8.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.541226  hitchhiker  0.00764394 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2182  signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 528 aa  137  6.0000000000000005e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3347  sensor histidine kinase  30.19 
 
 		 1020 aa  137  8e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3202  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 		 896 aa  134  6e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6901  signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 		 465 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 		 1297 aa  131  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.41 
 
 		 1559 aa  131  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2833  signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 738 aa  131  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6552  signal transduction histidine kinase  29.21 
 
 		 489 aa  132  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1053  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.11 
 
 		 1059 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1901  two-component sensor histidine kinase  25.6 
 
 		 931 aa  131  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0313083  normal  0.0871787 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3272  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.74 
 
 		 1011 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.66 
 
 		 1965 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6181  signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 		 1191 aa  130  9.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.299797 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 		 571 aa  130  9.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5113  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  29.24 
 
 		 1071 aa  128  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00592248 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6649  signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 		 739 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3126  signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 		 352 aa  127  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 		 907 aa  127  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  30.17 
 
 		 1190 aa  126  9e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1811  diguanylate cyclase  30.63 
 
 		 1037 aa  126  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.688838  normal  0.296213 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>