More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1811 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1811  diguanylate cyclase  100 
 
 
1037 aa  2123    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.688838  normal  0.296213 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5113  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  27.56 
 
 
1071 aa  277  6e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00592248 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1851  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  33.45 
 
 
1301 aa  262  3e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0114339  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2350  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  28.91 
 
 
1000 aa  249  3e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.521127 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0802  diguanylate cyclase  38.11 
 
 
321 aa  213  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0596  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.78 
 
 
1471 aa  193  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0273  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.8 
 
 
1078 aa  192  2.9999999999999997e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1477  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.76 
 
 
730 aa  183  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0452  sensory box protein  29.38 
 
 
451 aa  182  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2825  PAS:GGDEF  30.46 
 
 
548 aa  182  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.067576  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.01 
 
 
1559 aa  179  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0309  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.98 
 
 
827 aa  177  7e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0510078  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 
1714 aa  177  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2409  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  25.41 
 
 
729 aa  177  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.798311  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3048  signal transduction histidine kinase  25.95 
 
 
1001 aa  174  6.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143163  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2333  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.76 
 
 
578 aa  172  4e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2634  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  25.53 
 
 
843 aa  172  4e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0364  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.95 
 
 
1013 aa  171  5e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3153  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.95 
 
 
842 aa  171  6e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.256561  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4489  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.34 
 
 
1143 aa  171  7e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  24.57 
 
 
1002 aa  171  8e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4425  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.34 
 
 
1143 aa  171  8e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4215  signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 
582 aa  171  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3275  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.05 
 
 
1094 aa  171  9e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.393091 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.25 
 
 
1015 aa  169  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  26.25 
 
 
3706 aa  167  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  25.58 
 
 
1561 aa  166  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1559  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  36 
 
 
508 aa  166  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0906975 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3640  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  31.8 
 
 
1303 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.581797 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1931  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.29 
 
 
1289 aa  165  4.0000000000000004e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0959119  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.2 
 
 
1057 aa  165  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.04 
 
 
1076 aa  163  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.715458 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2521  diguanylate cyclase  33.33 
 
 
350 aa  163  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.33 
 
 
1432 aa  162  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  26.54 
 
 
1041 aa  161  7e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4518  diguanylate cyclase  33.55 
 
 
345 aa  160  8e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1350  signal transduction histidine kinase  26.54 
 
 
1016 aa  160  9e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597121 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2110  PAS:GGDEF  36.36 
 
 
796 aa  160  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172113  normal  0.0218284 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.63 
 
 
765 aa  160  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  25.71 
 
 
1442 aa  160  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0508  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.17 
 
 
1215 aa  160  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.722414  normal  0.07841 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  26.54 
 
 
2693 aa  159  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2463  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  46.24 
 
 
301 aa  159  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1715  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  23.69 
 
 
791 aa  158  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.680174 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2588  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  26.46 
 
 
710 aa  157  7e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0652312  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4442  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 
1267 aa  157  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2182  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.18 
 
 
305 aa  156  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.724323  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4259  PAS sensor protein  26.4 
 
 
1086 aa  156  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.127746 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4787  sensory box putative digualylate cyclase  35.4 
 
 
292 aa  156  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.243221  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3868  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.33 
 
 
1021 aa  156  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.85 
 
 
1330 aa  156  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173382  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2187  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.45 
 
 
705 aa  156  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0437  PAS sensor protein  32.17 
 
 
1225 aa  156  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719852  normal  0.440419 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0330  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.4 
 
 
531 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2041  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.08 
 
 
317 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2067  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.08 
 
 
317 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2895  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 
705 aa  155  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4776  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.27 
 
 
1086 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108623  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0471  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.82 
 
 
1225 aa  155  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.221036  normal  0.153067 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 
1383 aa  154  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.39 
 
 
1273 aa  154  5.9999999999999996e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2313  sensory box/GGDEF domain protein  34.15 
 
 
323 aa  154  8e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.447231  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4625  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.25 
 
 
1092 aa  154  8e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0096  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.7 
 
 
407 aa  154  8e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.758352  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2511  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.14 
 
 
419 aa  153  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1949  sensory box protein  24.89 
 
 
654 aa  153  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3374  diguanylate cyclase  39.11 
 
 
492 aa  152  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3893  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34 
 
 
853 aa  153  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1659  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  33.21 
 
 
833 aa  152  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0467119  normal  0.0611646 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0240  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.37 
 
 
342 aa  152  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0057  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.17 
 
 
550 aa  151  5e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0030  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.21 
 
 
833 aa  151  5e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 
1676 aa  151  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0136  diguanylate cyclase  24.07 
 
 
1428 aa  150  8e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4812  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  27.46 
 
 
1423 aa  151  8e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.330918  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0490  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  26.98 
 
 
681 aa  150  8e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.853397  normal  0.203863 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0300  sensory box/GGDEF family protein  31.51 
 
 
321 aa  151  8e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.759411  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0118  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.29 
 
 
1927 aa  150  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125924 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1477  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.28 
 
 
317 aa  150  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0231  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.96 
 
 
342 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2470  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  24.05 
 
 
693 aa  148  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000343207  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1658  putative sensory box-containing diguanylate cyclase  24.05 
 
 
693 aa  149  4.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000881395  normal  0.485091 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2374  putative sensory box-containing diguanylate cyclase  24.05 
 
 
693 aa  149  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185954  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.88 
 
 
991 aa  149  4.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 
1051 aa  149  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0216  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.96 
 
 
328 aa  148  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586587 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3902  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.5 
 
 
990 aa  148  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1139  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.18 
 
 
308 aa  148  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1169  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.18 
 
 
308 aa  148  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0471  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.94 
 
 
572 aa  147  8.000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.634401  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4307  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.88 
 
 
806 aa  147  8.000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.767019  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0190  diguanylate cyclase  34.36 
 
 
329 aa  147  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.48 
 
 
1501 aa  147  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3631  GGDEF domain-containing protein  37.43 
 
 
722 aa  146  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.770761  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3792  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  25.59 
 
 
893 aa  146  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.226695 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0636  diguanylate cyclase  46.11 
 
 
559 aa  146  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.445559  normal  0.916917 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2518  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  44.38 
 
 
751 aa  147  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00063624  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0645  diguanylate cyclase  30.58 
 
 
659 aa  146  2e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.02 
 
 
900 aa  146  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269875  normal  0.342346 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.48 
 
 
322 aa  146  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.895619 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>