More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0096 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0096  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  100 
 
 
407 aa  832    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.758352  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2634  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.57 
 
 
768 aa  231  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1985  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.7 
 
 
639 aa  188  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.267533  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1077  sensory box/GGDEF family protein  32.91 
 
 
808 aa  171  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3508  diguanylate cyclase  35.22 
 
 
638 aa  166  8e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0970585 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2588  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.77 
 
 
710 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0652312  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2333  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.13 
 
 
578 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3750  PAS:GGDEF  32.85 
 
 
721 aa  164  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0165  diguanylate cyclase with GAF sensor  51.45 
 
 
710 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1091  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.86 
 
 
424 aa  163  6e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0273  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.71 
 
 
1078 aa  162  7e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1896  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  44.83 
 
 
564 aa  162  8.000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000133427  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2841  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.05 
 
 
714 aa  162  9e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.310526 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2758  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.4 
 
 
698 aa  161  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3275  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.35 
 
 
1094 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.393091 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1411  diguanylate cyclase  34.25 
 
 
656 aa  159  9e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1477  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.79 
 
 
730 aa  157  3e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3230  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.14 
 
 
851 aa  157  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.105029 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2350  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  40.77 
 
 
1000 aa  157  4e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.521127 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1420  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.9 
 
 
314 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1260  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.9 
 
 
423 aa  157  5.0000000000000005e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2051  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.99 
 
 
703 aa  156  6e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.149643  normal  0.0751648 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3344  signal transduction protein  34.96 
 
 
1055 aa  156  8e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6104  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.06 
 
 
755 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3374  diguanylate cyclase  40.72 
 
 
492 aa  155  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1811  diguanylate cyclase  37.7 
 
 
1037 aa  154  2.9999999999999998e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.688838  normal  0.296213 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1504  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.77 
 
 
944 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.628866  normal  0.0653987 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1516  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.66 
 
 
352 aa  153  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0065858  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1521  diguanylate cyclase  41.78 
 
 
237 aa  154  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.281404  normal  0.309888 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2511  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.2 
 
 
419 aa  153  5e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0472  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.19 
 
 
853 aa  153  7e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000400428 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2518  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  45.15 
 
 
751 aa  152  7e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00063624  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1719  diguanylate cyclase with GAF sensor  36 
 
 
563 aa  152  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1646  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.21 
 
 
625 aa  152  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3525  diguanylate cyclase  46.67 
 
 
227 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.395826  normal  0.08798 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0926  diguanylate cyclase  44.86 
 
 
494 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2521  diguanylate cyclase  44.33 
 
 
350 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3316  diguanylate cyclase  45.5 
 
 
307 aa  150  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2246  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.43 
 
 
764 aa  150  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00114324  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0456  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.19 
 
 
853 aa  150  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4518  diguanylate cyclase  46.84 
 
 
345 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0995  diguanylate cyclase with GAF sensor  49.42 
 
 
792 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.37011  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4554  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.41 
 
 
331 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0516  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  34.13 
 
 
980 aa  150  4e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.579103  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  43.37 
 
 
1073 aa  150  4e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2926  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.36 
 
 
461 aa  150  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000284142  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3677  response regulator PleD  45.45 
 
 
461 aa  149  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00345303  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0743  diguanylate cyclase  41.95 
 
 
680 aa  149  6e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2218  GGDEF  48.31 
 
 
448 aa  149  6e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0442  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  33.22 
 
 
1785 aa  150  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1934  hypothetical protein  33.46 
 
 
634 aa  149  7e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0457  diguanylate cyclase  46.43 
 
 
472 aa  149  7e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100839  normal  0.562676 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0424  PAS:GGDEF  36.5 
 
 
715 aa  149  9e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000207007  hitchhiker  0.00445241 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1125  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.49 
 
 
769 aa  149  9e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.586946  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0413  diguanylate cyclase  42.78 
 
 
373 aa  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.191775  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1677  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.05 
 
 
512 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00717505  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0838  diguanylate cyclase  43.46 
 
 
332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.569939 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3523  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  45.03 
 
 
1079 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4400  diguanylate cyclase  49.07 
 
 
681 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.118889  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1346  sensory box/GGDEF domain protein  33.92 
 
 
425 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3816  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  46.6 
 
 
797 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.250791  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2675  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.43 
 
 
840 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0500157  hitchhiker  7.41843e-16 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2634  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.83 
 
 
843 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3606  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.86 
 
 
757 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1999  GGDEF domain-containing protein  34.58 
 
 
292 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1593  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.22 
 
 
706 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4489  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.22 
 
 
1143 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4425  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.22 
 
 
1143 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2619  diguanylate cyclase  43.35 
 
 
471 aa  147  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.912775  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0164  diguanylate cyclase  38.7 
 
 
437 aa  147  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.890841  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1806  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.14 
 
 
574 aa  147  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.55767  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0987  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.89 
 
 
739 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000757549  decreased coverage  0.00276789 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1281  diguanylate cyclase with GAF sensor  45.51 
 
 
586 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2740  diguanylate cyclase  46.15 
 
 
555 aa  147  4.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0953  diguanylate cyclase  44.81 
 
 
494 aa  146  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1052  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.95 
 
 
585 aa  147  5e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1315  diguanylate cyclase  42.7 
 
 
608 aa  146  5e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243862  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2408  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  27.73 
 
 
623 aa  146  5e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1770  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.01 
 
 
769 aa  147  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0395066  normal  0.809527 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1197  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.23 
 
 
457 aa  146  6e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1775  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.26 
 
 
468 aa  146  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.410369  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0828  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.93 
 
 
705 aa  146  6e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.263072  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0470  GGDEF  42.77 
 
 
412 aa  146  8.000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.606028 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1477  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.44 
 
 
317 aa  146  8.000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1673  sensory box protein  33.7 
 
 
1346 aa  145  9e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.338574  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2281  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.75 
 
 
450 aa  145  9e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1847  diguanylate cyclase  42.77 
 
 
470 aa  145  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3588  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.44 
 
 
827 aa  145  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0360121 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1451  diguanylate cyclase  29.26 
 
 
629 aa  145  1e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0524713  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1150  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.82 
 
 
1466 aa  145  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.765492  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0330  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.7 
 
 
531 aa  145  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2016  sensory box/GGDEF family protein  32.57 
 
 
799 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334987  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1325  sensory box protein  38.35 
 
 
428 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2825  PAS:GGDEF  41.71 
 
 
548 aa  145  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.067576  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1222  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.38 
 
 
815 aa  144  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0207  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.14 
 
 
772 aa  145  2e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.53871  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0474  sensory box/GGDEF family protein  35.71 
 
 
792 aa  144  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0136  diguanylate cyclase  34.27 
 
 
1428 aa  144  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1456  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.89 
 
 
1212 aa  144  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.4231 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0220  diguanylate cyclase  28.57 
 
 
539 aa  144  3e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.454807  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>