More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1753 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
1073 aa  2171    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1752  diguanylate cyclase  42.9 
 
 
718 aa  411  1e-113  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.972307  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  41.29 
 
 
836 aa  315  2.9999999999999996e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  40.65 
 
 
841 aa  314  5.999999999999999e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  38.4 
 
 
792 aa  309  2.0000000000000002e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0185  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.73 
 
 
1125 aa  289  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0142  metal dependent phosphohydrolase  38.37 
 
 
545 aa  281  7e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000694732  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0129  metal dependent phosphohydrolase  40.38 
 
 
505 aa  276  2.0000000000000002e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0783  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  42.28 
 
 
483 aa  274  6e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00290712 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2483  putative PAS/PAC sensor protein  40.06 
 
 
619 aa  274  6e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1811  GGDEF/HD domain-containing protein  40.11 
 
 
563 aa  272  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.63619  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0910  metal dependent phosphohydrolase  38.08 
 
 
561 aa  270  1e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.69967  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1530  GGDEF/HD domain-containing protein  40.05 
 
 
564 aa  268  4e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.890216  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3082  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  38.38 
 
 
550 aa  268  4e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000925788 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2110  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 
814 aa  260  1e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.406671  normal  0.904687 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0996  sensory box protein  40.65 
 
 
599 aa  256  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2264  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  38.52 
 
 
719 aa  249  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000689674  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2450  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  37.97 
 
 
617 aa  246  9.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0417  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.54 
 
 
853 aa  241  5e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2332  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  36.71 
 
 
960 aa  239  2e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2203  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  37.53 
 
 
434 aa  236  2.0000000000000002e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2187  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  35.62 
 
 
593 aa  236  2.0000000000000002e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.1316 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1164  putative sensory box-containing diguanylate cyclase  40.37 
 
 
599 aa  236  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0260621  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2443  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  36.39 
 
 
912 aa  234  7.000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0689  putative PAS/PAC sensor protein  35.64 
 
 
836 aa  233  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000235898 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1469  HD-GYP domain-containing protein  39.18 
 
 
803 aa  233  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0011  putative PAS/PAC sensor protein  34.9 
 
 
526 aa  229  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.140902  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2408  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  36.34 
 
 
623 aa  228  3e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2407  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  34.79 
 
 
758 aa  227  8e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4714  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  29.31 
 
 
684 aa  226  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0823  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.26 
 
 
755 aa  225  4e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2652  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  36.8 
 
 
608 aa  225  4e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0273  metal dependent phosphohydrolase  39.57 
 
 
534 aa  224  4.9999999999999996e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.576727  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0210  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  34.84 
 
 
465 aa  223  9.999999999999999e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74546  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0138  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.79 
 
 
1338 aa  219  2e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0780  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.92 
 
 
520 aa  219  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0195559  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1552  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.81 
 
 
971 aa  219  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0169  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  34.34 
 
 
681 aa  218  4e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0383  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.09 
 
 
746 aa  218  5e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0162  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  35.88 
 
 
837 aa  216  1.9999999999999998e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2224  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  34.53 
 
 
500 aa  209  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000178543  decreased coverage  1.10821e-21 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4265  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  33.15 
 
 
539 aa  209  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2934  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  33.78 
 
 
683 aa  207  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1840  metal dependent phosphohydrolase  36.41 
 
 
540 aa  204  6e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4565  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  36.16 
 
 
833 aa  204  8e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0183003  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3953  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  31.59 
 
 
474 aa  192  4e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000778513 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0764  metal dependent phosphohydrolase  51.72 
 
 
438 aa  189  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1146  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  32.91 
 
 
909 aa  189  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1018  metal dependent phosphohydrolase  30.26 
 
 
652 aa  188  5e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0256  histidine kinase  35.84 
 
 
712 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1469  metal dependent phosphohydrolase  49.72 
 
 
326 aa  185  4.0000000000000006e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.664094  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.55 
 
 
496 aa  182  2e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2803  metal dependent phosphohydrolase  48 
 
 
448 aa  181  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361766  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  49.44 
 
 
465 aa  181  7e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2131  metal dependent phosphohydrolase  49.71 
 
 
331 aa  181  9e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000504483  normal  0.911258 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0743  diguanylate cyclase  33.33 
 
 
680 aa  180  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  50.27 
 
 
366 aa  180  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  27.83 
 
 
553 aa  179  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  43.93 
 
 
876 aa  178  6e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1151  metal dependent phosphohydrolase  48.88 
 
 
248 aa  178  6e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.505397  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0279  metal dependent phosphohydrolase  47.46 
 
 
363 aa  177  8e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258813  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0568  metal dependent phosphohydrolase  47.25 
 
 
495 aa  174  5.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.17826  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2740  diguanylate cyclase  31.68 
 
 
555 aa  173  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0620  diguanylate cyclase  37.79 
 
 
517 aa  174  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0089586 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0639  metal dependent phosphohydrolase  50.92 
 
 
210 aa  172  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000043249  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  39.62 
 
 
481 aa  172  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4444  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.02 
 
 
526 aa  172  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2045  metal dependent phosphohydrolase  45.95 
 
 
373 aa  173  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.803605  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1741  diguanylate cyclase  31.02 
 
 
374 aa  172  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.564976  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2150  metal dependent phosphohydrolase  50.58 
 
 
718 aa  172  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0362  metal dependent phosphohydrolase  48.88 
 
 
518 aa  172  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1201  metal dependent phosphohydrolase  50.29 
 
 
719 aa  172  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0319  diguanylate cyclase  37.87 
 
 
732 aa  172  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.32 
 
 
491 aa  172  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1575  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  48.48 
 
 
561 aa  171  5e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.874521  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0995  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.89 
 
 
792 aa  171  6e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.37011  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3173  metal dependent phosphohydrolase  46.67 
 
 
713 aa  171  8e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1579  metal dependent phosphohydrolase  43.59 
 
 
618 aa  171  8e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0550  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  43.43 
 
 
509 aa  170  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  49.71 
 
 
632 aa  170  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0165  diguanylate cyclase with GAF sensor  36.16 
 
 
710 aa  170  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2919  metal dependent phosphohydrolase  44.57 
 
 
451 aa  170  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55477  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1889  metal dependent phosphohydrolase  43.5 
 
 
487 aa  169  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.562954  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1202  diguanylate cyclase  30.93 
 
 
356 aa  170  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0240122  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2856  putative PAS/PAC sensor protein  45.74 
 
 
339 aa  169  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220538  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2258  diguanylate cyclase  31.64 
 
 
353 aa  169  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000122425  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  46.82 
 
 
770 aa  169  2.9999999999999998e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3292  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  48.54 
 
 
502 aa  169  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1090  metal dependent phosphohydrolase  45 
 
 
698 aa  168  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111355 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  47.88 
 
 
880 aa  168  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0459  metal dependent phosphohydrolase  43.75 
 
 
428 aa  168  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2627  metal dependent phosphohydrolase  46.29 
 
 
651 aa  168  5e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.907693  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  47.88 
 
 
860 aa  168  5e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1645  metal dependent phosphohydrolase  46.29 
 
 
615 aa  168  5.9999999999999996e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1669  metal dependent phosphohydrolase  49.44 
 
 
499 aa  168  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3072  diguanylate cyclase  30.42 
 
 
356 aa  167  6.9999999999999995e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000986718 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.51 
 
 
343 aa  167  6.9999999999999995e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0244  metal dependent phosphohydrolase  48.55 
 
 
220 aa  167  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100694  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3816  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.96 
 
 
797 aa  167  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.250791  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4523  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.82 
 
 
499 aa  167  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.967133  normal  0.833222 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>