More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1741 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1741  diguanylate cyclase  100 
 
 
374 aa  765    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.564976  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2721  diguanylate cyclase with GAF sensor  35.63 
 
 
686 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.53529  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3745  diguanylate cyclase  35.67 
 
 
681 aa  207  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0895  GAF domain/GGDEF domain-containing protein  35.93 
 
 
688 aa  207  4e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0310961  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2704  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.14 
 
 
494 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0570321  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1282  diguanylate cyclase with GAF sensor  33.95 
 
 
550 aa  196  8.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000101268  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1844  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.56 
 
 
356 aa  191  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2169  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.15 
 
 
713 aa  188  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2048  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.5 
 
 
704 aa  187  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3659  diguanylate cyclase with GAF sensor  32.84 
 
 
362 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2797  diguanylate cyclase  34.94 
 
 
494 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.129294  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2890  diguanylate cyclase  34.94 
 
 
494 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00707629  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1298  diguanylate cyclase with GAF sensor  35.19 
 
 
353 aa  179  7e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000090214  hitchhiker  0.00354722 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3072  diguanylate cyclase  34.11 
 
 
356 aa  177  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000986718 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1202  diguanylate cyclase  33.92 
 
 
356 aa  176  7e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0240122  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1870  GGDEF domain-containing protein  35.79 
 
 
342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0995  diguanylate cyclase with GAF sensor  33.23 
 
 
792 aa  173  5e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.37011  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  31.02 
 
 
1073 aa  172  9e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4523  diguanylate cyclase with GAF sensor  33.92 
 
 
499 aa  171  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.967133  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1281  diguanylate cyclase with GAF sensor  33.14 
 
 
586 aa  170  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2497  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.88 
 
 
355 aa  170  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000595067  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0165  diguanylate cyclase with GAF sensor  35.56 
 
 
710 aa  169  7e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2258  diguanylate cyclase  31.36 
 
 
353 aa  169  8e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000122425  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0043  diguanylate cyclase  48.11 
 
 
580 aa  169  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1885  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.92 
 
 
558 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3350  sensor histidine kinase/GGDEF domain-containing protein  47.37 
 
 
565 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0743  diguanylate cyclase  40.81 
 
 
680 aa  163  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  32.74 
 
 
792 aa  161  2e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3816  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.34 
 
 
797 aa  160  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.250791  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  32.63 
 
 
836 aa  160  3e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21320  diguanylate cyclase  36.19 
 
 
510 aa  160  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1476  diguanylate cyclase  37.92 
 
 
414 aa  160  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.64785  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1576  diguanylate cyclase  30.12 
 
 
764 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2698  diguanylate cyclase  31.79 
 
 
489 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.100592  normal  0.047662 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1511  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.85 
 
 
557 aa  157  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00005186  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  39.57 
 
 
841 aa  157  4e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2842  diguanylate cyclase  32.85 
 
 
785 aa  156  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0185  diguanylate cyclase with GAF sensor  32.74 
 
 
1125 aa  156  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2375  diguanylate cyclase  37.61 
 
 
764 aa  156  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2287  diguanylate cyclase  37.61 
 
 
764 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0953  diguanylate cyclase  30 
 
 
494 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2715  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  49.7 
 
 
314 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2470  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.36 
 
 
756 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.578353  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0926  diguanylate cyclase  30 
 
 
494 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1525  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  50.3 
 
 
316 aa  154  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.15223e-23 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3523  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  37.17 
 
 
1079 aa  153  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1315  diguanylate cyclase  36.96 
 
 
608 aa  153  5e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243862  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2740  diguanylate cyclase  40.61 
 
 
555 aa  153  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1214  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.58 
 
 
496 aa  151  1e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.302028  hitchhiker  0.0000035245 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4400  diguanylate cyclase  39.91 
 
 
681 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.118889  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1658  response regulator/GGDEF domain-containing protein  30.45 
 
 
458 aa  151  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.939598  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1719  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.86 
 
 
563 aa  151  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0109  diguanylate cyclase  31.53 
 
 
461 aa  151  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2535  diguanylate cyclase  30.5 
 
 
1099 aa  151  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.12937  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4131  diguanylate cyclase  31.01 
 
 
369 aa  151  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4216  diguanylate cyclase  30.29 
 
 
717 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2458  diguanylate cyclase  38.24 
 
 
343 aa  150  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1450  diguanylate cyclase  32.95 
 
 
1774 aa  149  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2312  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.25 
 
 
597 aa  149  8e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1165  diguanylate cyclase  42.78 
 
 
459 aa  149  8e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000192138 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0299  hypothetical protein  39.37 
 
 
609 aa  149  9e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3097  diguanylate cyclase  42.78 
 
 
458 aa  149  9e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.948135  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01741  Putative CHASE3/GGDEF domain-containing signal protein  41.8 
 
 
563 aa  149  9e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1886  diguanylate cyclase  30.43 
 
 
462 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1471  diguanylate cyclase  39 
 
 
439 aa  148  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1530  GGDEF/HD domain-containing protein  35.77 
 
 
564 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.890216  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1643  GGDEF/response regulator receiver domain-containing protein  38.84 
 
 
316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1125  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.17 
 
 
769 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.586946  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3508  diguanylate cyclase  46.39 
 
 
638 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0970585 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0319  diguanylate cyclase  37.76 
 
 
732 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1477  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  47.62 
 
 
730 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1977  membrane associated GGDEF protein  37.93 
 
 
583 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0655  diguanylate cyclase  46.25 
 
 
172 aa  147  3e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000725118  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0283  hypothetical protein  38.91 
 
 
709 aa  147  3e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0509  diguanylate cyclase  35.78 
 
 
498 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00480754 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1811  GGDEF/HD domain-containing protein  38.16 
 
 
563 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.63619  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1177  two component signal transduction response regulator  29.28 
 
 
470 aa  146  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3855  serine/threonine protein kinase  30.22 
 
 
1726 aa  146  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993945  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1537  diguanylate cyclase  42.56 
 
 
381 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3550  diguanylate cyclase  43.28 
 
 
559 aa  145  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.953301  normal  0.354246 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1721  diguanylate cyclase  37.93 
 
 
483 aa  145  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.176219  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0744  diguanylate cyclase  41.54 
 
 
753 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.165088  normal  0.416995 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3316  diguanylate cyclase  38.22 
 
 
307 aa  145  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1318  diguanylate cyclase  42.08 
 
 
424 aa  144  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1752  diguanylate cyclase  28.93 
 
 
718 aa  144  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.972307  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1051  diguanylate cyclase  42.86 
 
 
424 aa  144  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1914  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.88 
 
 
459 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.943888  hitchhiker  0.00021307 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1386  diguanylate cyclase  44.91 
 
 
433 aa  144  3e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.904062  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4360  serine/threonine protein kinase  27.88 
 
 
1636 aa  143  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0330  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.2 
 
 
531 aa  143  5e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1471  diguanylate cyclase  37.93 
 
 
339 aa  143  5e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.435801  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2240  diguanylate cyclase  36.36 
 
 
758 aa  143  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.365812 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4128  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  29 
 
 
663 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1738  diguanylate cyclase  30.35 
 
 
462 aa  142  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02325  GGDEF domain protein  47.4 
 
 
949 aa  142  8e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1713  diguanylate cyclase  30.35 
 
 
462 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0822  diguanylate cyclase  33.08 
 
 
554 aa  142  9e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00155452  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1760  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.66 
 
 
473 aa  142  9e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.554911  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1058  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  46.71 
 
 
333 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0856452  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1840  putative transmembrane transcriptional sensor regulator  46.75 
 
 
506 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0399375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>