More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1165 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1165  diguanylate cyclase  100 
 
 
459 aa  929    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000192138 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3097  diguanylate cyclase  98.03 
 
 
458 aa  907    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.948135  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1886  diguanylate cyclase  63.2 
 
 
462 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1658  response regulator/GGDEF domain-containing protein  54.7 
 
 
458 aa  504  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.939598  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1914  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  53.95 
 
 
459 aa  497  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.943888  hitchhiker  0.00021307 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1380  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  54.36 
 
 
454 aa  465  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00781234  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1760  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  50.33 
 
 
473 aa  457  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.554911  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1042  two component signal transduction response regulator  43.64 
 
 
465 aa  365  1e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.472622  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1474  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.9 
 
 
465 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.214208 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1566  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.17 
 
 
455 aa  260  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.355183  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1471  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.79 
 
 
455 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2393  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.51 
 
 
455 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.502232  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1844  diguanylate cyclase with GAF sensor  41.44 
 
 
356 aa  170  6e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1202  diguanylate cyclase  31.39 
 
 
356 aa  168  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0240122  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3072  diguanylate cyclase  31.11 
 
 
356 aa  166  8e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000986718 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1298  diguanylate cyclase with GAF sensor  36.56 
 
 
353 aa  158  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000090214  hitchhiker  0.00354722 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  32.83 
 
 
836 aa  156  6e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2258  diguanylate cyclase  38.05 
 
 
353 aa  155  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000122425  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3659  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.84 
 
 
362 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1870  GGDEF domain-containing protein  36.73 
 
 
342 aa  154  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  32.35 
 
 
792 aa  152  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.72 
 
 
841 aa  152  1e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2497  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.34 
 
 
355 aa  151  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000595067  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2943  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.74 
 
 
438 aa  150  6e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.641955  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0571  putative GAF sensor protein  27.21 
 
 
622 aa  150  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0744  diguanylate cyclase  44.39 
 
 
753 aa  149  7e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.165088  normal  0.416995 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2487  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.45 
 
 
735 aa  149  9e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1741  diguanylate cyclase  42.78 
 
 
374 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.564976  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0598  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  27.21 
 
 
622 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592678  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0606  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  27.21 
 
 
622 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0743  diguanylate cyclase  31.91 
 
 
680 aa  147  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0319  diguanylate cyclase  29.66 
 
 
732 aa  147  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  36.7 
 
 
1073 aa  147  6e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2287  diguanylate cyclase  41.71 
 
 
764 aa  146  6e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2375  diguanylate cyclase  41.71 
 
 
764 aa  146  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1576  diguanylate cyclase  41.71 
 
 
764 aa  146  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3745  diguanylate cyclase  37.77 
 
 
681 aa  146  9e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2048  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.63 
 
 
704 aa  145  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0043  diguanylate cyclase  44.12 
 
 
580 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0165  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.81 
 
 
710 aa  145  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3140  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.6 
 
 
754 aa  145  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2169  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.63 
 
 
713 aa  144  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0895  GAF domain/GGDEF domain-containing protein  36.16 
 
 
688 aa  143  6e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0310961  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3541  response regulator PleD  27.46 
 
 
457 aa  143  7e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1476  diguanylate cyclase  46.24 
 
 
414 aa  142  9e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.64785  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3350  sensor histidine kinase/GGDEF domain-containing protein  42.69 
 
 
565 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0223  diguanylate cyclase  44.85 
 
 
357 aa  142  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.133267  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3038  response regulator PleD  27.52 
 
 
457 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372566  normal  0.319547 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0691  diguanylate cyclase with GAF sensor  43.33 
 
 
742 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2240  diguanylate cyclase  36.16 
 
 
758 aa  141  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.365812 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1719  diguanylate cyclase with GAF sensor  39.78 
 
 
563 aa  140  6e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4131  diguanylate cyclase  44.85 
 
 
369 aa  140  7e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2721  diguanylate cyclase with GAF sensor  35.06 
 
 
686 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.53529  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21320  diguanylate cyclase  38.94 
 
 
510 aa  139  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4216  diguanylate cyclase  42.61 
 
 
717 aa  139  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0638  diguanylate cyclase  45.06 
 
 
569 aa  138  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0614  putative GAF sensor protein  26.65 
 
 
622 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00376401  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3677  response regulator PleD  29.04 
 
 
461 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00345303  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0817  diguanylate cyclase  41.03 
 
 
1826 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14870  diguanylate cyclase  38.83 
 
 
462 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.024895  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7417  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.51 
 
 
457 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196799  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  42.77 
 
 
1644 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0953  diguanylate cyclase  31.01 
 
 
494 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4523  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.11 
 
 
499 aa  137  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.967133  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0926  diguanylate cyclase  31.1 
 
 
494 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  43.56 
 
 
517 aa  137  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3647  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.48 
 
 
715 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1315  diguanylate cyclase  45.51 
 
 
608 aa  136  7.000000000000001e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243862  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1643  GGDEF/response regulator receiver domain-containing protein  45.51 
 
 
316 aa  136  8e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1156  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  42.94 
 
 
859 aa  136  8e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0136706  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1399  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  25.49 
 
 
476 aa  136  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1750  response regulator PleD  42.42 
 
 
457 aa  136  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0690  diguanylate cyclase  42.78 
 
 
471 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1554  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.57 
 
 
419 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12380  diguanylate cyclase  35.57 
 
 
499 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00534046  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1885  diguanylate cyclase with GAF sensor  32.22 
 
 
558 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0701  diguanylate cyclase  40.21 
 
 
650 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.291224  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1483  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.79 
 
 
335 aa  134  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.882912  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3508  diguanylate cyclase  45.06 
 
 
638 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0970585 
 
 
-
 
NC_002978  WD0221  response regulator PleD  27.61 
 
 
460 aa  134  5e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1471  diguanylate cyclase  40.91 
 
 
439 aa  134  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1282  diguanylate cyclase with GAF sensor  35.22 
 
 
550 aa  133  6e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000101268  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1752  diguanylate cyclase  40.68 
 
 
718 aa  133  6e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.972307  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1177  two component signal transduction response regulator  27.29 
 
 
470 aa  133  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1336  diguanylate cyclase  46.58 
 
 
439 aa  133  6e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0220322  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0224  diguanylate cyclase  38.1 
 
 
332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1184  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.33 
 
 
738 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2740  diguanylate cyclase  42.95 
 
 
555 aa  132  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3816  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.57 
 
 
797 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.250791  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1949  diguanylate cyclase  39.46 
 
 
733 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0634  response regulator  29.05 
 
 
470 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00145352  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0785  diguanylate cyclase with GAF sensor  42.58 
 
 
367 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1759  diguanylate cyclase  40 
 
 
266 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0198551  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3711  diguanylate cyclase  42.95 
 
 
320 aa  131  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336724  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2699  diguanylate cyclase  39.42 
 
 
251 aa  131  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1281  diguanylate cyclase with GAF sensor  41.04 
 
 
586 aa  131  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0109  diguanylate cyclase  40.57 
 
 
461 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1477  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  44.05 
 
 
730 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3316  diguanylate cyclase  42.01 
 
 
307 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6679  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.37 
 
 
457 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>