More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2497 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2497  diguanylate cyclase with GAF sensor  100 
 
 
355 aa  731    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000595067  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2258  diguanylate cyclase  47.47 
 
 
353 aa  328  7e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000122425  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1202  diguanylate cyclase  47.15 
 
 
356 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0240122  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3072  diguanylate cyclase  47.15 
 
 
356 aa  311  7.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000986718 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1870  GGDEF domain-containing protein  46.61 
 
 
342 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1298  diguanylate cyclase with GAF sensor  45.72 
 
 
353 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000090214  hitchhiker  0.00354722 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3659  diguanylate cyclase with GAF sensor  35 
 
 
362 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0165  diguanylate cyclase with GAF sensor  42.13 
 
 
710 aa  175  9e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2842  diguanylate cyclase  33.15 
 
 
785 aa  170  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1741  diguanylate cyclase  34.88 
 
 
374 aa  170  4e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.564976  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1949  diguanylate cyclase  33.43 
 
 
733 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1282  diguanylate cyclase with GAF sensor  39.27 
 
 
550 aa  166  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000101268  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2470  diguanylate cyclase with GAF sensor  32.49 
 
 
756 aa  166  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.578353  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2721  diguanylate cyclase with GAF sensor  40.34 
 
 
686 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.53529  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1471  diguanylate cyclase  39.73 
 
 
439 aa  164  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0744  diguanylate cyclase  40.69 
 
 
753 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.165088  normal  0.416995 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  37.55 
 
 
1073 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0299  hypothetical protein  37.99 
 
 
609 aa  162  6e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01741  Putative CHASE3/GGDEF domain-containing signal protein  38.13 
 
 
563 aa  162  7e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  32.65 
 
 
792 aa  161  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0283  hypothetical protein  37.99 
 
 
709 aa  161  1e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.66 
 
 
841 aa  161  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  38.08 
 
 
836 aa  160  3e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0953  diguanylate cyclase  40.18 
 
 
494 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1885  diguanylate cyclase with GAF sensor  35.43 
 
 
558 aa  158  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4131  diguanylate cyclase  39.29 
 
 
369 aa  158  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0822  diguanylate cyclase  35.38 
 
 
554 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00155452  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2333  hypothetical protein  35.52 
 
 
565 aa  156  4e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2375  diguanylate cyclase  40 
 
 
764 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0319  diguanylate cyclase  38.63 
 
 
732 aa  156  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2287  diguanylate cyclase  40 
 
 
764 aa  156  6e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2477  hypothetical protein  35.5 
 
 
273 aa  155  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0701  diguanylate cyclase  40 
 
 
650 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.291224  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0926  diguanylate cyclase  39.73 
 
 
494 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3097  diguanylate cyclase  31.62 
 
 
458 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.948135  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1576  diguanylate cyclase  39.11 
 
 
764 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1844  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.44 
 
 
356 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7079  serine/threonine protein kinase  38.02 
 
 
1643 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1752  diguanylate cyclase  37.17 
 
 
718 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.972307  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1759  diguanylate cyclase  38.49 
 
 
266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0198551  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6003  diguanylate cyclase  40.35 
 
 
371 aa  152  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.753958  normal  0.321238 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2189  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.58 
 
 
415 aa  152  8.999999999999999e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2240  diguanylate cyclase  42.93 
 
 
758 aa  152  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.365812 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4523  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.23 
 
 
499 aa  152  8.999999999999999e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.967133  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1525  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.56 
 
 
316 aa  151  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.15223e-23 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4330  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.45 
 
 
325 aa  152  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3583  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.52 
 
 
322 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000864033 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3833  diguanylate cyclase with GAF sensor  33.33 
 
 
732 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1165  diguanylate cyclase  31.34 
 
 
459 aa  151  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000192138 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0691  diguanylate cyclase with GAF sensor  43.41 
 
 
742 aa  150  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2413  response regulator PleD  45.18 
 
 
457 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592932  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0895  GAF domain/GGDEF domain-containing protein  31.53 
 
 
688 aa  150  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0310961  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4666  diguanylate cyclase  49.71 
 
 
501 aa  150  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0421428  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3011  serine/threonine protein kinase  36.48 
 
 
1637 aa  149  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15444  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0817  diguanylate cyclase  40.1 
 
 
1826 aa  149  7e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3038  response regulator PleD  45.18 
 
 
457 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372566  normal  0.319547 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4360  serine/threonine protein kinase  38.11 
 
 
1636 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21320  diguanylate cyclase  30.5 
 
 
510 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2715  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  46.11 
 
 
314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1760  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.95 
 
 
473 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.554911  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2704  diguanylate cyclase with GAF sensor  33.91 
 
 
494 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0570321  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1719  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.36 
 
 
563 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1348  response regulator PleD  46.43 
 
 
457 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0620  diguanylate cyclase  36.68 
 
 
517 aa  147  3e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0089586 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3678  diguanylate cyclase with GAF sensor  40.35 
 
 
418 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313961 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0069  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.81 
 
 
314 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.840661 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1758  diguanylate cyclase with Chase2 sensor  40.96 
 
 
583 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.621597 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2290  diguanylate cyclase  33.24 
 
 
646 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.666302 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4748  diguanylate cyclase  43.18 
 
 
377 aa  146  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1476  diguanylate cyclase  44.26 
 
 
414 aa  146  5e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.64785  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3541  response regulator PleD  44.58 
 
 
457 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1425  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  36 
 
 
483 aa  146  5e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1908  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.36 
 
 
519 aa  146  6e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.11693  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1315  diguanylate cyclase  35.25 
 
 
608 aa  146  6e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243862  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2048  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.87 
 
 
704 aa  146  6e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0401  GGDEF domain-containing protein  45.88 
 
 
507 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3855  serine/threonine protein kinase  38.59 
 
 
1726 aa  145  9e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993945  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2458  diguanylate cyclase  37.14 
 
 
343 aa  145  9e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0767  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.01 
 
 
675 aa  145  9e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000798179  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1658  response regulator/GGDEF domain-containing protein  40.5 
 
 
458 aa  145  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.939598  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3523  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  36.25 
 
 
1079 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0349  diguanylate cyclase  42.22 
 
 
523 aa  145  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.291431  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  46.99 
 
 
609 aa  145  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1125  GGDEF  49.39 
 
 
509 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.394023  normal  0.376452 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0995  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.39 
 
 
792 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.37011  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0690  diguanylate cyclase  39.17 
 
 
471 aa  144  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3308  response regulator PleD  45.12 
 
 
457 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268667  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3316  diguanylate cyclase  50.31 
 
 
307 aa  143  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1332  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.09 
 
 
306 aa  143  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4128  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  34.52 
 
 
663 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2169  diguanylate cyclase with GAF sensor  32.5 
 
 
713 aa  143  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1750  response regulator PleD  45.03 
 
 
457 aa  143  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4746  response regulator PleD  44.51 
 
 
466 aa  143  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0979514  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2511  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.93 
 
 
419 aa  142  6e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1896  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.31 
 
 
564 aa  142  7e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000133427  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3508  diguanylate cyclase  43.26 
 
 
638 aa  142  7e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0970585 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2096  diguanylate cyclase with GAF sensor  36.73 
 
 
664 aa  142  7e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.76184 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0638  diguanylate cyclase  39.5 
 
 
569 aa  142  7e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2815  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  48.3 
 
 
457 aa  142  7e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.631579  normal  0.0857187 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3745  diguanylate cyclase  31.13 
 
 
681 aa  142  8e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>