More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1844 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1844  diguanylate cyclase with GAF sensor  100 
 
 
356 aa  723    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3659  diguanylate cyclase with GAF sensor  51.2 
 
 
362 aa  339  4e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2258  diguanylate cyclase  35.21 
 
 
353 aa  211  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000122425  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2048  diguanylate cyclase with GAF sensor  35.61 
 
 
704 aa  209  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2169  diguanylate cyclase with GAF sensor  35.91 
 
 
713 aa  208  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3745  diguanylate cyclase  35.15 
 
 
681 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2842  diguanylate cyclase  37.28 
 
 
785 aa  194  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2470  diguanylate cyclase with GAF sensor  36.13 
 
 
756 aa  193  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.578353  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1202  diguanylate cyclase  33.92 
 
 
356 aa  192  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0240122  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1741  diguanylate cyclase  34.56 
 
 
374 aa  191  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.564976  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3072  diguanylate cyclase  33.93 
 
 
356 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000986718 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1870  GGDEF domain-containing protein  33.74 
 
 
342 aa  189  5e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1298  diguanylate cyclase with GAF sensor  32.19 
 
 
353 aa  188  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000090214  hitchhiker  0.00354722 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2721  diguanylate cyclase with GAF sensor  33.63 
 
 
686 aa  186  5e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.53529  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0895  GAF domain/GGDEF domain-containing protein  33.96 
 
 
688 aa  184  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0310961  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1346  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  31.88 
 
 
947 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1949  diguanylate cyclase  34.2 
 
 
733 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1281  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.87 
 
 
586 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  32.65 
 
 
841 aa  177  3e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2133  GGDEF family protein  34.49 
 
 
332 aa  176  5e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.352584  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  32.36 
 
 
792 aa  175  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  32.65 
 
 
836 aa  175  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1282  diguanylate cyclase with GAF sensor  32.54 
 
 
550 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000101268  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1165  diguanylate cyclase  41.44 
 
 
459 aa  170  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000192138 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3097  diguanylate cyclase  41.44 
 
 
458 aa  169  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.948135  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2704  diguanylate cyclase with GAF sensor  35.05 
 
 
494 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0570321  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1886  diguanylate cyclase  40.55 
 
 
462 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1885  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.09 
 
 
558 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0185  diguanylate cyclase with GAF sensor  33.72 
 
 
1125 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3833  diguanylate cyclase with GAF sensor  33.9 
 
 
732 aa  164  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0822  diguanylate cyclase  29.38 
 
 
554 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00155452  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2797  diguanylate cyclase  35.65 
 
 
494 aa  162  6e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.129294  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2890  diguanylate cyclase  35.65 
 
 
494 aa  162  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00707629  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1719  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.57 
 
 
563 aa  161  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  30.61 
 
 
1073 aa  162  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1658  response regulator/GGDEF domain-containing protein  40.83 
 
 
458 aa  160  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.939598  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1914  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.19 
 
 
459 aa  157  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.943888  hitchhiker  0.00021307 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1760  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.52 
 
 
473 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.554911  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0165  diguanylate cyclase with GAF sensor  35.27 
 
 
710 aa  156  7e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1476  diguanylate cyclase  43.33 
 
 
414 aa  155  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.64785  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2497  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.44 
 
 
355 aa  154  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000595067  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2866  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.09 
 
 
448 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0488494  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1042  two component signal transduction response regulator  40.28 
 
 
465 aa  152  8e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.472622  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0319  diguanylate cyclase  39.19 
 
 
732 aa  151  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1177  two component signal transduction response regulator  30.35 
 
 
470 aa  152  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1380  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.95 
 
 
454 aa  152  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00781234  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1576  diguanylate cyclase  37.27 
 
 
764 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2375  diguanylate cyclase  37.27 
 
 
764 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1055  sensory box protein  31.4 
 
 
462 aa  150  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0299  hypothetical protein  37.28 
 
 
609 aa  151  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2287  diguanylate cyclase  37.27 
 
 
764 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3979  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.65 
 
 
567 aa  150  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000058301  hitchhiker  0.000000371669 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4523  diguanylate cyclase with GAF sensor  33.82 
 
 
499 aa  150  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.967133  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3350  sensor histidine kinase/GGDEF domain-containing protein  47.06 
 
 
565 aa  149  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21320  diguanylate cyclase  30.2 
 
 
510 aa  149  6e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0283  hypothetical protein  36.84 
 
 
709 aa  149  8e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2312  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.64 
 
 
597 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3816  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.67 
 
 
797 aa  146  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.250791  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1834  diguanylate cyclase  37.02 
 
 
525 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.245567  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01741  Putative CHASE3/GGDEF domain-containing signal protein  35.43 
 
 
563 aa  143  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1474  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.53 
 
 
465 aa  143  5e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.214208 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0744  diguanylate cyclase  32.59 
 
 
753 aa  143  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.165088  normal  0.416995 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1450  diguanylate cyclase  33.43 
 
 
1774 aa  143  6e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1171  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.23 
 
 
916 aa  142  7e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4131  diguanylate cyclase  33.99 
 
 
369 aa  142  7e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0043  diguanylate cyclase  45.61 
 
 
580 aa  142  8e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0995  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.5 
 
 
792 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.37011  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2189  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.69 
 
 
415 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1243  diguanylate cyclase  40.66 
 
 
419 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0069  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.91 
 
 
314 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.840661 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  40.83 
 
 
438 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3018  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.29 
 
 
475 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0634  response regulator  30.09 
 
 
470 aa  140  4.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00145352  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0894  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  31.14 
 
 
482 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.156047 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6322  diguanylate cyclase with GAF sensor  32.77 
 
 
682 aa  139  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314546  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2240  diguanylate cyclase  31.31 
 
 
758 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.365812 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1738  diguanylate cyclase  29.7 
 
 
462 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3042  response regulator receiver protein  34.69 
 
 
388 aa  139  8.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.646056  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1150  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.47 
 
 
1466 aa  139  8.999999999999999e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.765492  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0187  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.71 
 
 
469 aa  139  8.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0953  diguanylate cyclase  31.23 
 
 
494 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2511  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  44.21 
 
 
419 aa  138  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0881  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.15 
 
 
498 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3481  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.15 
 
 
488 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1713  diguanylate cyclase  29.43 
 
 
462 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0690  diguanylate cyclase  36.94 
 
 
471 aa  137  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2393  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.32 
 
 
455 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.502232  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3604  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.15 
 
 
498 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.352008 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1483  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.38 
 
 
335 aa  137  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.882912  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3406  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  30.15 
 
 
493 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0929  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.23 
 
 
464 aa  138  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.240329 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12380  diguanylate cyclase  28.57 
 
 
499 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00534046  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2678  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.86 
 
 
515 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0621  diguanylate cyclase  39.39 
 
 
323 aa  137  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3614  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  46.55 
 
 
310 aa  136  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0109  diguanylate cyclase  34.48 
 
 
461 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2740  diguanylate cyclase  29.89 
 
 
555 aa  136  6.0000000000000005e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1471  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.78 
 
 
455 aa  136  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2083  diguanylate cyclase  30.66 
 
 
568 aa  136  7.000000000000001e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.17301  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4360  serine/threonine protein kinase  30.03 
 
 
1636 aa  135  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>