More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1066 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  100 
 
 
609 aa  1208    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0148  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  35.69 
 
 
560 aa  289  9e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.189493 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2390  TPR repeat-containing diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase  29.87 
 
 
600 aa  181  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4028  diguanylate cyclase  45.92 
 
 
447 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6549  diguanylate cyclase  30.6 
 
 
546 aa  171  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.530699 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7005  GGDEF family protein  29.06 
 
 
568 aa  165  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0620  diguanylate cyclase  47.29 
 
 
517 aa  162  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0089586 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  30.7 
 
 
782 aa  159  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6137  diguanylate cyclase  29.44 
 
 
551 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11555  normal  0.0857113 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3583  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  47.8 
 
 
322 aa  157  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000864033 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.35 
 
 
991 aa  154  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 
1060 aa  153  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2989  diguanylate cyclase  27.61 
 
 
628 aa  151  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.542118  normal  0.107456 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2951  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  46.29 
 
 
306 aa  151  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1332  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  46.29 
 
 
306 aa  150  5e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  30.9 
 
 
828 aa  150  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1136  diguanylate cyclase  30.14 
 
 
582 aa  150  8e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1643  GGDEF/response regulator receiver domain-containing protein  44.86 
 
 
316 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2458  diguanylate cyclase  42.52 
 
 
343 aa  149  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0069  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44 
 
 
314 aa  148  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.840661 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0195  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  46.86 
 
 
309 aa  148  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0106599  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0785  diguanylate cyclase with GAF sensor  48.7 
 
 
367 aa  146  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1576  diguanylate cyclase  45.05 
 
 
764 aa  146  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2375  diguanylate cyclase  45.05 
 
 
764 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2497  diguanylate cyclase with GAF sensor  46.99 
 
 
355 aa  145  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000595067  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2287  diguanylate cyclase  45.05 
 
 
764 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1154  sensory box protein  34.17 
 
 
340 aa  144  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2977  diguanylate cyclase  27.56 
 
 
650 aa  143  8e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1380  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.61 
 
 
332 aa  142  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.238298  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1752  diguanylate cyclase  42.94 
 
 
718 aa  142  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.972307  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3473  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.41 
 
 
351 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1528  diguanylate cyclase  40.31 
 
 
321 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1355  diguanylate cyclase  44.71 
 
 
487 aa  141  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.133394  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3508  diguanylate cyclase  35.8 
 
 
638 aa  141  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0970585 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3631  diguanylate cyclase  27.31 
 
 
628 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2623  cyclic nucleotide phosphodiesterase, putative  27.96 
 
 
626 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.616722 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3011  serine/threonine protein kinase  42.5 
 
 
1637 aa  140  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15444  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0701  diguanylate cyclase  47.62 
 
 
650 aa  140  8.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.291224  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3376  GGDEF/response regulator receiver domain-containing protein  43.75 
 
 
308 aa  140  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3557  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.86 
 
 
322 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.457648  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1741  diguanylate cyclase  43.6 
 
 
374 aa  139  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.564976  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2521  diguanylate cyclase  44.32 
 
 
350 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1125  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  44.02 
 
 
769 aa  139  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.586946  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3625  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.86 
 
 
322 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1348  response regulator PleD  46.7 
 
 
457 aa  139  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2880  GGDEF  42.86 
 
 
410 aa  139  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.16195  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0457  diguanylate cyclase  47.17 
 
 
472 aa  139  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100839  normal  0.562676 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2683  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.18 
 
 
505 aa  139  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1617  diguanylate cyclase  44.1 
 
 
514 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6813  diguanylate cyclase  43.17 
 
 
285 aa  138  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3550  diguanylate cyclase  46.43 
 
 
559 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.953301  normal  0.354246 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1477  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.59 
 
 
317 aa  138  3.0000000000000003e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4518  diguanylate cyclase  43.18 
 
 
345 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1225  diguanylate cyclase with beta propeller sensor  40.59 
 
 
985 aa  137  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.90661  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  30.08 
 
 
1266 aa  137  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3480  diguanylate cyclase  46.75 
 
 
395 aa  137  4e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232889  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3523  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  44.65 
 
 
1079 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0509  diguanylate cyclase  46.99 
 
 
498 aa  137  5e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00480754 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0380  diguanylate cyclase  32 
 
 
563 aa  137  5e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.620025  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1934  hypothetical protein  45.45 
 
 
634 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1662  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  45.73 
 
 
820 aa  137  8e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.29973  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1357  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.42 
 
 
901 aa  137  8e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000351362  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3859  cyclic nucleotide phosphodiesterase, putative  25.88 
 
 
631 aa  136  9e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1739  GGDEF domain protein  42.2 
 
 
308 aa  136  9e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2499  GGDEF domain-containing protein  47.8 
 
 
367 aa  136  9e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1298  diguanylate cyclase with GAF sensor  42.42 
 
 
353 aa  136  9e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000090214  hitchhiker  0.00354722 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0207  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.54 
 
 
772 aa  136  9.999999999999999e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.53871  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0172  GGDEF domain-containing protein  36.65 
 
 
328 aa  136  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0655  diguanylate cyclase  43.37 
 
 
172 aa  136  9.999999999999999e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000725118  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  42.94 
 
 
1073 aa  136  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0638  diguanylate cyclase  37.8 
 
 
569 aa  136  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3391  diguanylate cyclase  45.51 
 
 
360 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.372073  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3550  diguanylate cyclase  42.35 
 
 
381 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003519  diguanylate cyclase (GGDEF domain) with PAS/PAC sensor  39.44 
 
 
280 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000133532  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4122  diguanylate cyclase  46.15 
 
 
395 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302969  normal  0.519011 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3851  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.13 
 
 
634 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0571122  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1319  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  46.54 
 
 
610 aa  135  1.9999999999999998e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.104887  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1896  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.75 
 
 
564 aa  135  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000133427  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0237  diguanylate cyclase  37.44 
 
 
427 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.124528  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1281  diguanylate cyclase with GAF sensor  42.51 
 
 
586 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4131  diguanylate cyclase  44.38 
 
 
369 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02778  GGDEF protein  39.67 
 
 
946 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1516  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  46.37 
 
 
352 aa  135  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0065858  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01448  predicted diguanylate cyclase  41.24 
 
 
347 aa  134  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1282  diguanylate cyclase with GAF sensor  43.56 
 
 
550 aa  134  5e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000101268  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2023  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.69 
 
 
632 aa  134  5e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2754  diguanylate cyclase  40.55 
 
 
355 aa  134  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0798314  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3032  diguanylate cyclase  43.98 
 
 
547 aa  134  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01461  hypothetical protein  41.24 
 
 
347 aa  134  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3711  diguanylate cyclase  41.9 
 
 
320 aa  134  5e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336724  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1750  response regulator PleD  42.86 
 
 
457 aa  134  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0365  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.44 
 
 
308 aa  134  6e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2240  diguanylate cyclase  45.06 
 
 
758 aa  134  6e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.365812 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1745  diguanylate cyclase  39.09 
 
 
401 aa  134  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.597218  normal  0.101344 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0638  diguanylate cyclase  48.07 
 
 
524 aa  134  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0484455 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1914  GGDEF domain-containing protein  41.76 
 
 
381 aa  134  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.743896  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1679  diguanylate cyclase  41.24 
 
 
460 aa  134  6.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2167  diguanylate cyclase  41.24 
 
 
460 aa  134  6.999999999999999e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0116704  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1683  diguanylate cyclase  41.24 
 
 
460 aa  134  6.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2041  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.44 
 
 
317 aa  134  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>