More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0380 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0380  diguanylate cyclase  100 
 
 		 563 aa  1090    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.620025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.52 
 
 		 609 aa  147  6e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3550  diguanylate cyclase  39.6 
 
 		 381 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0148  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  37.01 
 
 		 560 aa  122  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.189493 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1356  diguanylate cyclase  43.21 
 
 		 380 aa  121  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.299965 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1914  GGDEF domain-containing protein  39.11 
 
 		 381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.743896  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2458  diguanylate cyclase  41.26 
 
 		 343 aa  118  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2815  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.44 
 
 		 457 aa  118  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.631579  normal  0.0857187 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3903  diguanylate cyclase  41.21 
 
 		 370 aa  118  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0522591 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4119  diguanylate cyclase  43.52 
 
 		 382 aa  117  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898336 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3477  diguanylate cyclase  43.01 
 
 		 342 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.377939  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4523  diguanylate cyclase  45.09 
 
 		 532 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.646592 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3254  diguanylate cyclase  37.95 
 
 		 351 aa  115  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00411067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2469  diguanylate cyclase  41.98 
 
 		 351 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1922  diguanylate cyclase  41.57 
 
 		 527 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.252712 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3010  diguanylate cyclase  41.76 
 
 		 382 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2774  diguanylate cyclase  32.72 
 
 		 530 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1154  sensory box protein  34.15 
 
 		 340 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7005  GGDEF family protein  37.18 
 
 		 568 aa  114  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1357  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.72 
 
 		 901 aa  114  6e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000351362  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1795  diguanylate cyclase  31.3 
 
 		 339 aa  114  6e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6549  diguanylate cyclase  39.87 
 
 		 546 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.530699 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1264  diguanylate cyclase  34.9 
 
 		 512 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.417106 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0426  putative GGDEF protein  36.42 
 
 		 413 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.631508  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3316  diguanylate cyclase  39.02 
 
 		 307 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01583  Response regulator containing a CheY-like receiver domain and a GGDEF domain  34.78 
 
 		 477 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6137  diguanylate cyclase  40.52 
 
 		 551 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11555  normal  0.0857113 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2050  diguanylate cyclase  42.17 
 
 		 523 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645943 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2313  response regulator  40.99 
 
 		 301 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.483613  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3677  diguanylate cyclase  41.38 
 
 		 524 aa  110  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1158  diguanylate cyclase  38.59 
 
 		 507 aa  110  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0570084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3282  diguanylate cyclase  40.96 
 
 		 523 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2856  GGDEF domain-containing protein  35.29 
 
 		 568 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.592717 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0968  diguanylate cyclase  45.86 
 
 		 363 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.326915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3391  diguanylate cyclase  42.69 
 
 		 360 aa  110  9.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.372073  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2556  GGDEF domain-containing protein  31.9 
 
 		 518 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0319  two component diguanylate cyclase  38.51 
 
 		 661 aa  109  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1225  diguanylate cyclase with beta propeller sensor  38.82 
 
 		 985 aa  109  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.90661  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3988  two component response regulator  39.31 
 
 		 296 aa  109  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1078  diguanylate cyclase  38.59 
 
 		 507 aa  110  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329883  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3047  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  42.86 
 
 		 878 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0864607  normal  0.185142 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4162  diguanylate cyclase  36.96 
 
 		 501 aa  110  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0950734 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1136  diguanylate cyclase  40.53 
 
 		 582 aa  110  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4159  diguanylate cyclase  40.85 
 
 		 530 aa  109  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.956326 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2153  membrane associated GGDEF protein  35.67 
 
 		 490 aa  109  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2413  diguanylate cyclase  40.36 
 
 		 544 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2733  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  39.13 
 
 		 965 aa  108  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3402  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  42.86 
 
 		 881 aa  109  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.144033  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1745  diguanylate cyclase  36.5 
 
 		 401 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.597218  normal  0.101344 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3643  diguanylate cyclase  37.97 
 
 		 516 aa  109  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.93603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0096  diguanylate cyclase  38.89 
 
 		 555 aa  109  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0452  putative GGDEF protein  32.34 
 
 		 528 aa  108  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0275  diguanylate cyclase  41.4 
 
 		 630 aa  109  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0339591 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03006  hypothetical protein  38.16 
 
 		 520 aa  108  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2390  TPR repeat-containing diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase  32.37 
 
 		 600 aa  108  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0178  diguanylate cyclase  38.55 
 
 		 521 aa  108  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.776824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2198  diguanylate cyclase  32.63 
 
 		 341 aa  107  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.83837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2275  diguanylate cyclase  32.63 
 
 		 341 aa  107  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6915  diguanylate cyclase  41.25 
 
 		 202 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.322303  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3536  GGDEF domain-containing protein  29.15 
 
 		 536 aa  107  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2197  GGDEF family protein  33.16 
 
 		 341 aa  107  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1231  diguanylate cyclase  35.39 
 
 		 345 aa  107  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0162  diguanylate cyclase  34.07 
 
 		 614 aa  107  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2490  diguanylate cyclase  29.96 
 
 		 341 aa  107  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.316308  normal  0.521612 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0034  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.31 
 
 		 728 aa  107  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1227  diguanylate cyclase  43.83 
 
 		 554 aa  107  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.594022  normal  0.072002 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3489  GGDEF domain-containing protein  33.47 
 
 		 312 aa  107  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3023  diguanylate cyclase  36.06 
 
 		 362 aa  107  8e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0470  GGDEF  41.32 
 
 		 412 aa  107  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.606028 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4030  diguanylate cyclase  41.32 
 
 		 498 aa  107  8e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2966  diguanylate cyclase  40.25 
 
 		 386 aa  107  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175816  decreased coverage  0.00586824 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4178  response regulator receiver protein  38.51 
 
 		 1477 aa  106  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.450705 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2418  GGDEF domain-containing protein  31.7 
 
 		 518 aa  106  9e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.659104 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0820  GGDEF domain-containing protein  35.11 
 
 		 333 aa  106  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0690  diguanylate cyclase  36.9 
 
 		 471 aa  106  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3816  diguanylate cyclase  37.13 
 
 		 526 aa  106  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2986  diguanylate cyclase  32 
 
 		 518 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000165218 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4463  diguanylate cyclase  37.89 
 
 		 372 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.379038 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2514  diguanylate cyclase  34.78 
 
 		 341 aa  106  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.39605  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1359  diguanylate cyclase  31.2 
 
 		 518 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0267  diguanylate cyclase  40.1 
 
 		 550 aa  106  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.92395  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3218  diguanylate cyclase  37.72 
 
 		 532 aa  106  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72420  GGDEF domain-containing protein  32.05 
 
 		 671 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0411466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2126  diguanylate cyclase  37.89 
 
 		 341 aa  106  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.128443  normal  0.0489303 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1425  diguanylate cyclase  39.16 
 
 		 381 aa  106  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1373  diguanylate cyclase  31.2 
 
 		 518 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1301  diguanylate cyclase  38.1 
 
 		 331 aa  106  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.298458  normal  0.144882 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6286  GGDEF domain-containing protein  33.46 
 
 		 668 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1398  diguanylate cyclase  31.2 
 
 		 518 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0531857  decreased coverage  0.00306238 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1143  diguanylate cyclase  33.13 
 
 		 532 aa  105  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4028  diguanylate cyclase  36.51 
 
 		 447 aa  105  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0094  diguanylate cyclase  32.52 
 
 		 451 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3762  diguanylate cyclase  40.96 
 
 		 368 aa  105  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.742847  normal  0.824996 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2322  diguanylate cyclase  29.08 
 
 		 354 aa  105  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03046  GGDEF domain protein  34.78 
 
 		 518 aa  105  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.444384  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3046  diguanylate cyclase  45.68 
 
 		 562 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.641394  normal  0.406701 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0283  GGDEF family protein  31.58 
 
 		 339 aa  105  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.286485  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2884  diguanylate cyclase  30.77 
 
 		 518 aa  105  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000014858 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1109  diguanylate cyclase  37.2 
 
 		 532 aa  105  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1412  diguanylate cyclase  38.04 
 
 		 516 aa  105  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>